MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1e

Total Repeats: 2748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021909	CAA	2	6	141319	141324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021909	TGT	2	6	141372	141377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021909	CGT	2	6	141383	141388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021909	CGA	2	6	141397	141402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021909	GACGA	2	10	141443	141452	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
506	NC_021909	AGC	2	6	141468	141473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021909	GAT	2	6	141497	141502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021909	GCG	2	6	141523	141528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021909	GC	3	6	141577	141582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_021909	GGGC	2	8	141588	141595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
511	NC_021909	CGG	2	6	141651	141656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021909	ATA	2	6	141683	141688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021909	GC	3	6	141727	141732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_021909	AAC	2	6	141793	141798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021909	CCG	2	6	141855	141860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_021909	CAC	2	6	141949	141954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_021909	GGA	2	6	142110	142115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021909	TTG	2	6	142650	142655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021909	TGAT	2	8	142691	142698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021909	CAA	2	6	142713	142718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021909	GCCCC	2	10	142719	142728	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
522	NC_021909	CGACG	2	10	142765	142774	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
523	NC_021909	GAT	2	6	142829	142834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021909	AAAT	2	8	142864	142871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021909	CG	4	8	142889	142896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
526	NC_021909	CCTC	2	8	142931	142938	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
527	NC_021909	ATCA	2	8	142959	142966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_021909	AGC	2	6	147031	147036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_021909	GCA	2	6	147054	147059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021909	GTC	2	6	147093	147098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021909	CGA	2	6	147109	147114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021909	CCAGG	2	10	147154	147163	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
533	NC_021909	CGG	2	6	147190	147195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_021909	TCG	2	6	147222	147227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021909	TGC	3	9	147246	147254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021909	TCA	2	6	147268	147273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021909	CAT	2	6	148949	148954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021909	GTT	2	6	149071	149076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021909	AGC	3	9	149108	149116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021909	TGA	2	6	149379	149384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021909	GCT	2	6	149407	149412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021909	ATT	2	6	149434	149439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021909	CGT	2	6	149473	149478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021909	GGAG	2	8	149479	149486	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021909	CG	3	6	149570	149575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_021909	TGA	2	6	149645	149650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021909	TCG	2	6	150019	150024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021909	TCGT	2	8	150033	150040	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_021909	CGA	2	6	150041	150046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021909	AG	3	6	150071	150076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021909	GCTG	2	8	150681	150688	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_021909	GCA	2	6	150700	150705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021909	GC	3	6	150725	150730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_021909	AGC	2	6	150757	150762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021909	CAG	2	6	150763	150768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021909	CGAC	2	8	150790	150797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
557	NC_021909	TGT	3	9	150802	150810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021909	CGAT	2	8	150921	150928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
559	NC_021909	ACC	2	6	150942	150947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_021909	GTC	2	6	150962	150967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021909	ACC	2	6	151005	151010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_021909	GCG	2	6	151017	151022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_021909	CGA	2	6	151427	151432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021909	GATTGC	2	12	151434	151445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
565	NC_021909	CGC	2	6	151492	151497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_021909	TCA	2	6	151640	151645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_021909	CCA	2	6	151675	151680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_021909	GCG	2	6	151711	151716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021909	AGC	2	6	151746	151751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021909	TCGCG	2	10	151765	151774	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
571	NC_021909	CTT	2	6	151871	151876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021909	TGG	2	6	151887	151892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021909	GGA	2	6	151938	151943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021909	ACC	2	6	156255	156260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_021909	GCA	2	6	156611	156616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021909	TGCA	2	8	156705	156712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_021909	GGA	2	6	156719	156724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021909	CTC	2	6	165803	165808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_021909	CG	3	6	165823	165828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_021909	TCA	2	6	165936	165941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021909	GAAC	2	8	165966	165973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_021909	GCG	2	6	166101	166106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_021909	CGT	2	6	166272	166277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021909	CAG	2	6	166278	166283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021909	GAT	2	6	166284	166289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021909	GTTT	2	8	166505	166512	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021909	TGG	3	9	166527	166535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021909	ATGA	2	8	168344	168351	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_021909	GAAA	2	8	168364	168371	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021909	GCA	2	6	168377	168382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021909	TCG	2	6	168393	168398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021909	GCCC	2	8	168434	168441	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
593	NC_021909	TGA	2	6	168488	168493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021909	TCT	2	6	168494	168499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021909	GTC	2	6	168512	168517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021909	TGG	2	6	168533	168538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021909	GGC	2	6	168572	168577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021909	GTG	2	6	168602	168607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021909	AGC	2	6	168637	168642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021909	CAA	2	6	168685	168690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021909	TCAT	2	8	168742	168749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_021909	ATT	2	6	168763	168768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021909	CGG	2	6	168797	168802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021909	AGC	2	6	168828	168833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021909	GTG	2	6	168843	168848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021909	AAT	2	6	168907	168912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021909	TGGAAC	2	12	168968	168979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
608	NC_021909	CCG	2	6	169001	169006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_021909	AG	3	6	169010	169015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021909	CTC	2	6	169342	169347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_021909	AGGGC	2	10	169505	169514	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
612	NC_021909	TGG	2	6	169649	169654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_021909	CGG	2	6	169663	169668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021909	CGG	2	6	169687	169692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021909	TGC	2	6	169890	169895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_021909	GC	3	6	169894	169899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_021909	TCC	2	6	169912	169917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_021909	GAA	2	6	169934	169939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021909	GTGC	2	8	169982	169989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
620	NC_021909	AAC	2	6	169993	169998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021909	CTC	2	6	170054	170059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_021909	GGC	2	6	170063	170068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021909	GCG	2	6	170173	170178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021909	CGC	2	6	170336	170341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_021909	CGGG	2	8	170361	170368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
626	NC_021909	GCA	2	6	170531	170536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021909	GTT	2	6	170607	170612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021909	TGG	2	6	170712	170717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_021909	GTT	2	6	170787	170792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021909	TTG	2	6	170797	170802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021909	CTG	2	6	170908	170913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021909	TGG	2	6	170945	170950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021909	GCTGT	2	10	171006	171015	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
634	NC_021909	GCC	2	6	171024	171029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_021909	CAG	2	6	171086	171091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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