MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	GC	3	6	3474	3479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021908	GA	3	6	3519	3524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021908	GA	3	6	6896	6901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021908	GC	4	8	6992	6999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021908	GA	4	8	9626	9633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021908	GC	3	6	18743	18748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021908	CG	3	6	20211	20216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021908	CG	3	6	21567	21572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021908	CG	3	6	26643	26648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021908	GC	3	6	28830	28835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021908	GA	3	6	28879	28884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021908	AT	3	6	40228	40233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021908	GC	4	8	57515	57522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021908	GA	3	6	57831	57836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021908	GC	3	6	61541	61546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021908	CG	3	6	64659	64664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021908	CG	3	6	64764	64769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021908	CG	3	6	79325	79330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021908	TA	3	6	86998	87003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021908	GC	3	6	87033	87038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021908	GA	4	8	87075	87082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021908	CG	4	8	99044	99051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021908	GC	3	6	99261	99266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021908	CT	3	6	100212	100217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021908	CG	3	6	105040	105045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_021908	CG	3	6	105082	105087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021908	GC	4	8	105090	105097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021908	CA	3	6	125984	125989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021908	AT	3	6	135175	135180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021908	GA	3	6	151394	151399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021908	CT	3	6	152168	152173	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021908	CG	3	6	152347	152352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021908	CG	3	6	163179	163184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021908	GC	3	6	167241	167246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021908	CG	3	6	168128	168133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021908	TG	3	6	171199	171204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021908	AG	3	6	173228	173233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021908	CA	3	6	173379	173384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021908	CG	3	6	173530	173535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021908	CG	3	6	174169	174174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021908	CT	3	6	187066	187071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021908	GC	3	6	187175	187180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021908	CG	3	6	191969	191974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021908	CG	3	6	192054	192059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021908	CT	3	6	193821	193826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021908	GC	3	6	196084	196089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021908	TA	3	6	198853	198858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021908	GA	3	6	199004	199009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021908	CG	3	6	199087	199092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021908	GC	3	6	204470	204475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021908	GC	3	6	206370	206375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021908	TG	3	6	213952	213957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021908	TG	3	6	218080	218085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021908	GA	3	6	218916	218921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021908	CG	3	6	220978	220983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021908	TC	3	6	223916	223921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021908	GA	3	6	223935	223940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021908	CG	3	6	224798	224803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021908	GC	3	6	228083	228088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021908	CG	3	6	228171	228176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021908	CT	3	6	232213	232218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021908	GT	3	6	237314	237319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021908	CT	3	6	241223	241228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021908	GC	3	6	244875	244880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021908	GA	3	6	244893	244898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021908	CG	3	6	246146	246151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021908	GC	3	6	246279	246284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021908	GA	3	6	248204	248209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021908	GC	3	6	254128	254133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021908	TC	3	6	258024	258029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021908	AG	3	6	270754	270759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021908	GA	4	8	273543	273550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021908	GA	3	6	281168	281173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021908	CA	3	6	282618	282623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021908	CG	3	6	291305	291310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021908	GT	3	6	291768	291773	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021908	AG	3	6	294268	294273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021908	TA	3	6	300006	300011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021908	TA	3	6	308483	308488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021908	TC	3	6	309109	309114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021908	GA	3	6	316057	316062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021908	GC	3	6	337706	337711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021908	GA	3	6	346012	346017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021908	CG	3	6	348131	348136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021908	TC	3	6	362860	362865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021908	TG	3	6	363360	363365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021908	TC	3	6	363489	363494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021908	GA	3	6	375514	375519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021908	GC	3	6	375522	375527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021908	AT	3	6	377091	377096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021908	TC	3	6	379656	379661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021908	GA	4	8	391943	391950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021908	GT	3	6	396323	396328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021908	GA	3	6	405098	405103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021908	GC	3	6	406843	406848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021908	GC	3	6	413623	413628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021908	GC	3	6	413725	413730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021908	CT	3	6	419382	419387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021908	CT	3	6	423431	423436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021908	TC	3	6	425476	425481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021908	GC	3	6	434298	434303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021908	CG	3	6	438537	438542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021908	CA	3	6	438775	438780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021908	TC	3	6	442788	442793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021908	AG	3	6	446163	446168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021908	GC	3	6	451382	451387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021908	TG	3	6	456101	456106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021908	TC	4	8	459650	459657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021908	CT	3	6	461299	461304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021908	TG	3	6	462765	462770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021908	TA	3	6	466666	466671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021908	GC	3	6	472057	472062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021908	TC	3	6	479980	479985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021908	GC	3	6	480017	480022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021908	TC	3	6	483642	483647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021908	TG	3	6	485729	485734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.