MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021908	TCT	2	6	63	68	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021908	TTG	2	6	88	93	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021908	GGA	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021908	GCC	2	6	3542	3547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021908	CGA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021908	CCG	2	6	6967	6972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021908	CTC	2	6	17266	17271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_021908	CTC	2	6	17273	17278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021908	TTC	2	6	17329	17334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021908	AAT	2	6	18705	18710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021908	CCT	2	6	18783	18788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_021908	GCT	2	6	18894	18899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021908	CTT	2	6	18910	18915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021908	CAG	2	6	20144	20149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021908	ATC	2	6	20221	20226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021908	GCG	2	6	20246	20251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021908	GAA	2	6	21554	21559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021908	CGG	2	6	21582	21587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021908	GCG	2	6	21588	21593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021908	TCC	2	6	23989	23994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021908	CTT	2	6	24017	24022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021908	CGG	2	6	24080	24085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021908	GAC	2	6	24100	24105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021908	GCT	2	6	24167	24172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021908	CGC	2	6	24263	24268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021908	AGG	2	6	24629	24634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021908	GCA	2	6	24643	24648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021908	TCC	2	6	26613	26618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021908	TGG	2	6	26635	26640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021908	GCC	2	6	28800	28805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021908	CGA	2	6	29857	29862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021908	GGC	2	6	29974	29979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021908	GCG	2	6	29998	30003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021908	TCG	2	6	30122	30127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021908	GCG	2	6	30177	30182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021908	TCA	2	6	30209	30214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021908	GGC	2	6	33709	33714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021908	AGT	2	6	34911	34916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021908	GCG	2	6	35763	35768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021908	GCC	3	9	35771	35779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021908	AAC	2	6	38822	38827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021908	TTG	2	6	40059	40064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021908	GCA	2	6	40127	40132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021908	ATC	2	6	40155	40160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021908	TGA	3	9	40321	40329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021908	GAG	2	6	40412	40417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021908	CAG	2	6	41766	41771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021908	GAA	2	6	41815	41820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021908	CCG	2	6	41826	41831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021908	GCG	2	6	42379	42384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021908	CGA	2	6	42459	42464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021908	TCA	2	6	42531	42536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021908	GCC	2	6	42573	42578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_021908	CGC	2	6	43146	43151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_021908	CCG	2	6	45968	45973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_021908	AAC	2	6	49688	49693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021908	GCC	2	6	49750	49755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021908	TCT	2	6	55755	55760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021908	TGA	2	6	55809	55814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021908	GAA	2	6	55855	55860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021908	GCA	2	6	57373	57378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021908	TGC	2	6	57456	57461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021908	GCA	2	6	57506	57511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021908	GCC	2	6	57597	57602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_021908	TCG	2	6	57654	57659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021908	CAT	2	6	57796	57801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021908	GCT	2	6	60375	60380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021908	TCA	2	6	60450	60455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021908	AGG	2	6	60981	60986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021908	GCC	2	6	61600	61605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021908	AGC	2	6	61611	61616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021908	ACG	2	6	61712	61717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021908	ATC	2	6	61740	61745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021908	CGC	2	6	61754	61759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021908	TGC	2	6	61779	61784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021908	GCC	2	6	61861	61866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021908	TCT	2	6	61894	61899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021908	AGC	2	6	61930	61935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021908	AGC	2	6	68896	68901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021908	GAA	3	9	68953	68961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021908	GCT	2	6	69031	69036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021908	CGC	2	6	69120	69125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021908	GCC	2	6	69134	69139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_021908	GCC	2	6	70248	70253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_021908	CGG	2	6	73004	73009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021908	GCC	2	6	73026	73031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_021908	CTT	2	6	74169	74174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021908	CCG	3	9	76089	76097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021908	CTT	2	6	76119	76124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021908	GAT	2	6	76343	76348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021908	CGT	2	6	76425	76430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021908	CGC	2	6	76501	76506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_021908	ATC	2	6	77636	77641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021908	TTC	2	6	77658	77663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021908	ATG	2	6	77684	77689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021908	GGT	2	6	77804	77809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021908	GGC	2	6	78678	78683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021908	CCG	2	6	78686	78691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_021908	CAT	2	6	79130	79135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021908	TTC	2	6	79159	79164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021908	TCC	2	6	79206	79211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_021908	CCG	2	6	79229	79234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021908	CAT	2	6	79305	79310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021908	AGG	2	6	79339	79344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021908	TGC	2	6	80067	80072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021908	GCC	2	6	80716	80721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021908	TCT	3	9	80745	80753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021908	ATA	2	6	87005	87010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021908	TCT	2	6	87039	87044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021908	GCG	2	6	87057	87062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021908	GGC	2	6	87064	87069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021908	TCC	2	6	90107	90112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021908	CGG	2	6	90141	90146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_021908	CGG	2	6	90151	90156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021908	TCA	2	6	90191	90196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021908	AAG	2	6	95478	95483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021908	GCG	2	6	95516	95521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021908	AAG	2	6	95605	95610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021908	GCC	2	6	99067	99072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021908	TCC	2	6	99113	99118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021908	TAT	2	6	99140	99145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021908	CGC	2	6	99176	99181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_021908	TGC	2	6	100184	100189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021908	GCA	2	6	101094	101099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021908	CAA	2	6	101165	101170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021908	GAG	2	6	101174	101179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021908	GGA	2	6	101202	101207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021908	GTC	2	6	102795	102800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021908	GAG	2	6	102852	102857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021908	GCG	2	6	105036	105041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021908	CAA	2	6	105111	105116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021908	GGC	2	6	105143	105148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021908	CGG	2	6	110422	110427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021908	GCA	2	6	115368	115373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021908	AAC	2	6	115458	115463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021908	CGA	2	6	119149	119154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021908	TGT	2	6	121783	121788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021908	TTG	2	6	121810	121815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021908	GCA	2	6	121946	121951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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141	NC_021908	TGC	2	6	122287	122292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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149	NC_021908	GGT	2	6	128321	128326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_021908	GAA	2	6	160322	160327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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