MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 1143

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021908	GCG	2	6	442727	442732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_021908	TTG	2	6	442759	442764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021908	TC	3	6	442788	442793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_021908	CGA	2	6	442835	442840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021908	AG	3	6	446163	446168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021908	TTC	2	6	446971	446976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021908	GCT	2	6	447801	447806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021908	ACG	2	6	447869	447874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021908	GTC	2	6	449535	449540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021908	TCG	2	6	449546	449551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021908	CAA	2	6	449634	449639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021908	A	6	6	449723	449728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021908	GAG	2	6	449740	449745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021908	GAG	3	9	449782	449790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021908	CGT	2	6	449794	449799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021908	GAG	2	6	449818	449823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021908	GAG	2	6	449853	449858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021908	AAT	2	6	449876	449881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021908	GAT	2	6	449901	449906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021908	AAAGC	2	10	449978	449987	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1021	NC_021908	GGA	2	6	449997	450002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021908	ATG	2	6	450028	450033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021908	GTCT	2	8	450034	450041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_021908	TTG	2	6	450287	450292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021908	GCA	2	6	450344	450349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_021908	GC	3	6	451382	451387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_021908	AGCGGC	2	12	451430	451441	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021908	GCCG	2	8	452729	452736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_021908	T	6	6	452755	452760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021908	ACGG	2	8	452773	452780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_021908	ATTG	2	8	452873	452880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021908	CGA	2	6	452902	452907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021908	GAG	2	6	452937	452942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021908	CGGA	2	8	454027	454034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1035	NC_021908	A	6	6	454065	454070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021908	GCC	2	6	454071	454076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_021908	GAT	2	6	455984	455989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021908	ACTTT	2	10	456072	456081	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_021908	TG	3	6	456101	456106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021908	GAC	2	6	458535	458540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021908	TCCG	2	8	458548	458555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_021908	TC	4	8	459650	459657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_021908	GAA	2	6	460412	460417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021908	CCG	2	6	460435	460440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_021908	ACG	2	6	460489	460494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021908	GTT	2	6	460520	460525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021908	AAG	2	6	460542	460547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021908	CTCG	2	8	461225	461232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_021908	AGG	2	6	461235	461240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021908	TCACT	2	10	461259	461268	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1051	NC_021908	CT	3	6	461299	461304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_021908	GCA	2	6	461322	461327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021908	TAA	2	6	461372	461377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021908	TG	3	6	462765	462770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021908	CTC	2	6	462779	462784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_021908	GAA	2	6	462796	462801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021908	T	6	6	463896	463901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021908	CCG	2	6	464864	464869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_021908	AAT	2	6	466649	466654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021908	TA	3	6	466666	466671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021908	CTTC	2	8	468509	468516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_021908	TTC	2	6	469916	469921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_021908	CCGG	2	8	469964	469971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_021908	CGC	2	6	472038	472043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_021908	GC	3	6	472057	472062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1066	NC_021908	CCT	2	6	472978	472983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_021908	TCT	2	6	473045	473050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_021908	GCC	2	6	473755	473760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_021908	T	6	6	473764	473769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021908	GAA	2	6	473813	473818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021908	TCCCT	2	10	474835	474844	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1072	NC_021908	TCA	2	6	474849	474854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_021908	CAT	2	6	479918	479923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_021908	CGC	2	6	479950	479955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_021908	TC	3	6	479980	479985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_021908	GC	3	6	480017	480022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_021908	TCG	2	6	480558	480563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021908	ACG	2	6	480564	480569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021908	AAC	3	9	480590	480598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_021908	GTA	2	6	480632	480637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021908	TGC	2	6	480775	480780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_021908	TGA	2	6	480790	480795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021908	GCG	2	6	480821	480826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_021908	CAT	2	6	480960	480965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_021908	TCG	2	6	480979	480984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021908	AGC	2	6	480985	480990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_021908	GGC	2	6	480993	480998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_021908	ACA	2	6	481007	481012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_021908	CAA	2	6	481016	481021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021908	ACA	2	6	481024	481029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021908	GCG	2	6	481159	481164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021908	CAT	2	6	481357	481362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021908	GCC	2	6	481363	481368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_021908	GTGC	2	8	481378	481385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_021908	TCC	2	6	482731	482736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_021908	CGGC	2	8	482768	482775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_021908	GCCG	2	8	482781	482788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_021908	ATGC	2	8	483574	483581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_021908	TC	3	6	483642	483647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_021908	GCCTC	2	10	483682	483691	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1101	NC_021908	CTG	2	6	483696	483701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021908	TTTTCC	2	12	483773	483784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_021908	AGG	2	6	483821	483826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021908	GAG	2	6	484626	484631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021908	AAT	2	6	484650	484655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021908	GGA	3	9	484694	484702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021908	CCG	2	6	485583	485588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_021908	GAT	2	6	485619	485624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021908	C	6	6	485628	485633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1110	NC_021908	T	6	6	485654	485659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021908	GCT	3	9	485660	485668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021908	GAC	2	6	485699	485704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021908	TG	3	6	485729	485734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021908	CGTGTC	2	12	485777	485788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021908	AGG	2	6	485792	485797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021908	ACGG	2	8	486236	486243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_021908	CAC	2	6	486556	486561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_021908	CAT	2	6	486564	486569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021908	TCCC	2	8	490722	490729	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1120	NC_021908	GCAG	2	8	490756	490763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_021908	TCG	2	6	490771	490776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021908	AAG	2	6	490893	490898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021908	CAAC	2	8	491013	491020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_021908	GATC	2	8	491034	491041	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_021908	TAA	2	6	494461	494466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021908	GAAT	2	8	495439	495446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021908	GGC	2	6	495469	495474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021908	TCC	2	6	497936	497941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_021908	GAC	2	6	499086	499091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021908	CAT	2	6	499126	499131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021908	ATC	2	6	500216	500221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021908	GGAT	2	8	500267	500274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021908	TCGC	2	8	500299	500306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_021908	GAG	3	9	500344	500352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021908	GCC	2	6	501205	501210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_021908	ATC	2	6	507479	507484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_021908	GGC	2	6	508392	508397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_021908	TTG	2	6	508408	508413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_021908	ACA	2	6	508501	508506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_021908	CGA	2	6	508516	508521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_021908	A	6	6	510696	510701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_021908	GGT	2	6	510801	510806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_021908	A	6	6	510824	510829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous 1 23Next >