MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1d

Total Repeats: 1143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021908	CG	3	6	220978	220983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_021908	GAG	2	6	221005	221010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021908	ATG	2	6	221011	221016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021908	GCCA	2	8	221046	221053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
505	NC_021908	TCG	2	6	221072	221077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021908	GAA	2	6	221120	221125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021908	GAG	2	6	221145	221150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021908	GGC	2	6	221172	221177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_021908	TGC	2	6	221327	221332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021908	GTC	2	6	221415	221420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021908	CCT	2	6	223730	223735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_021908	CGA	2	6	223769	223774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_021908	TCC	2	6	223813	223818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_021908	GCG	2	6	223835	223840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021908	TC	3	6	223916	223921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_021908	GA	3	6	223935	223940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021908	TGC	2	6	223945	223950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021908	CAA	2	6	224051	224056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_021908	CACT	2	8	224058	224065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_021908	ACG	2	6	224082	224087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021908	AAG	2	6	224095	224100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021908	AGA	3	9	224107	224115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021908	GCC	2	6	224178	224183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_021908	GTC	2	6	224241	224246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021908	CCGC	2	8	224264	224271	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
526	NC_021908	GAT	2	6	224398	224403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021908	TCG	2	6	224450	224455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021908	ACC	2	6	224505	224510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_021908	ACG	2	6	224517	224522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021908	CGA	2	6	224527	224532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021908	AGG	2	6	224576	224581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021908	ATT	2	6	224627	224632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021908	AGG	2	6	224708	224713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021908	CG	3	6	224798	224803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021908	CTT	2	6	224810	224815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021908	TAA	2	6	224842	224847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_021908	AGGAC	2	10	224953	224962	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
538	NC_021908	CCT	2	6	225040	225045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
539	NC_021908	GTCA	2	8	225732	225739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_021908	GCC	2	6	227968	227973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_021908	CGGG	2	8	228028	228035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
542	NC_021908	GGCG	2	8	228038	228045	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
543	NC_021908	GC	3	6	228083	228088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
544	NC_021908	GCG	2	6	228150	228155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021908	CG	3	6	228171	228176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_021908	TGAT	2	8	228233	228240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021908	GCCC	2	8	228245	228252	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
548	NC_021908	GTCG	2	8	228446	228453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_021908	ACTTG	2	10	228462	228471	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
550	NC_021908	CTC	2	6	228522	228527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_021908	GCC	2	6	229294	229299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_021908	CT	3	6	232213	232218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_021908	CTT	2	6	232225	232230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021908	CGA	2	6	232239	232244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021908	CTC	2	6	234225	234230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_021908	CGA	2	6	234240	234245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021908	GCG	2	6	234247	234252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_021908	TCC	2	6	234332	234337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_021908	CTGC	2	8	234340	234347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
560	NC_021908	CTC	2	6	234348	234353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_021908	CGG	2	6	234387	234392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021908	TCC	2	6	235912	235917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021908	TGAA	2	8	236047	236054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021908	AAAT	2	8	236076	236083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021908	ATG	2	6	237086	237091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021908	AGT	2	6	237102	237107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021908	ATG	2	6	237113	237118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021908	ACGAC	2	10	237131	237140	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
569	NC_021908	GCA	2	6	237141	237146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021908	TGG	2	6	237160	237165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021908	AGCG	2	8	237193	237200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
572	NC_021908	GCC	2	6	237209	237214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_021908	ATGTA	2	10	237252	237261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021908	GT	3	6	237314	237319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021908	GCA	2	6	241196	241201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_021908	AGCT	2	8	241214	241221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_021908	CT	3	6	241223	241228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
578	NC_021908	GGC	2	6	241252	241257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021908	CGAC	2	8	241278	241285	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_021908	TTGC	2	8	242176	242183	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_021908	CCT	2	6	242189	242194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_021908	GAG	3	9	242211	242219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021908	GGC	2	6	242220	242225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_021908	GC	3	6	244875	244880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
585	NC_021908	GA	3	6	244893	244898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021908	ACCC	2	8	244935	244942	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
587	NC_021908	CCG	2	6	246084	246089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_021908	CG	3	6	246146	246151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
589	NC_021908	GC	3	6	246279	246284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
590	NC_021908	A	6	6	246807	246812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021908	AGG	2	6	246816	246821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021908	GGCC	2	8	246880	246887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_021908	TTTC	2	8	248149	248156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
594	NC_021908	TCC	2	6	248172	248177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_021908	GAT	2	6	248191	248196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021908	GA	3	6	248204	248209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021908	CTT	2	6	248259	248264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021908	TCA	2	6	248297	248302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_021908	ACG	2	6	249149	249154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021908	ACC	2	6	249185	249190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_021908	TCA	2	6	249214	249219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_021908	GTC	2	6	251391	251396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021908	CCT	2	6	253865	253870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_021908	CGA	2	6	254039	254044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021908	GCG	2	6	254086	254091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_021908	GC	3	6	254128	254133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_021908	TTC	2	6	254136	254141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021908	CGC	2	6	254156	254161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_021908	GGC	2	6	254166	254171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021908	TCG	2	6	254226	254231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021908	GCG	2	6	254236	254241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_021908	AGC	2	6	254298	254303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021908	GCCT	2	8	254320	254327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_021908	CGA	2	6	254341	254346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021908	CCCG	2	8	254384	254391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
616	NC_021908	TCA	2	6	254407	254412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021908	GGC	2	6	256465	256470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021908	CGA	2	6	256483	256488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_021908	CGG	2	6	257986	257991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021908	TC	3	6	258024	258029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_021908	TCC	2	6	258054	258059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_021908	GCT	2	6	258091	258096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021908	TCAG	2	8	258961	258968	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_021908	GAA	2	6	261379	261384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021908	T	6	6	261430	261435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021908	GCG	2	6	261976	261981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_021908	CCG	2	6	262052	262057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_021908	GTC	2	6	262059	262064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021908	CGCGA	2	10	262113	262122	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
630	NC_021908	CTGC	2	8	262132	262139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_021908	TTAG	2	8	263234	263241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021908	CTA	2	6	263301	263306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_021908	ATGG	2	8	263343	263350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021908	GGT	2	6	263352	263357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021908	GAAG	2	8	268171	268178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021908	ATCC	2	8	270284	270291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
637	NC_021908	GGC	2	6	270307	270312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_021908	CGTT	2	8	270562	270569	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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683	NC_021908	GCC	2	6	279246	279251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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