MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	GACG	2	8	7900	7907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021907	TTGC	2	8	13567	13574	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021907	GTGA	2	8	16450	16457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021907	TCGG	2	8	31445	31452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021907	GCGA	2	8	37977	37984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021907	CGAA	2	8	40151	40158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021907	CCGC	2	8	41127	41134	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_021907	AGAA	2	8	44256	44263	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021907	CGGT	2	8	44845	44852	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021907	CTGT	2	8	45646	45653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021907	GCAT	2	8	45742	45749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021907	GCAG	2	8	47610	47617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021907	TCTG	2	8	47949	47956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021907	TGGA	2	8	48923	48930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021907	GACG	2	8	57656	57663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021907	GCGA	2	8	76233	76240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021907	GAGG	2	8	80032	80039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021907	CGGC	2	8	81969	81976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021907	CGAC	2	8	82193	82200	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021907	TCTT	2	8	82423	82430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021907	GACG	2	8	83410	83417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021907	ACTA	2	8	84276	84283	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021907	ATCA	2	8	89232	89239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021907	ATGT	2	8	91460	91467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021907	GGAT	2	8	93103	93110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021907	GCAA	2	8	99972	99979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021907	GTGC	2	8	108789	108796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021907	GCAT	2	8	108822	108829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021907	CGAC	2	8	108973	108980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021907	AAAC	2	8	109090	109097	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021907	GCGG	2	8	109369	109376	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021907	AGCG	2	8	109383	109390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021907	GGAC	2	8	116172	116179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021907	GGAC	2	8	116233	116240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021907	CGGC	2	8	117311	117318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021907	GCCG	2	8	117519	117526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021907	GCCA	2	8	117567	117574	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021907	TATC	2	8	117656	117663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021907	ACCC	2	8	117686	117693	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_021907	CTCA	2	8	117877	117884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021907	GCCG	2	8	118162	118169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021907	GGCA	2	8	118361	118368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021907	TGCC	2	8	118420	118427	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021907	TGCC	2	8	118441	118448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021907	CTGG	2	8	118514	118521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021907	GCCC	2	8	118560	118567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_021907	TCTT	2	8	118599	118606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021907	GGCC	2	8	118897	118904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021907	CCGA	2	8	119063	119070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021907	GCTC	2	8	119137	119144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021907	AGCA	2	8	119147	119154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021907	CCGG	2	8	119180	119187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021907	CGCT	2	8	119226	119233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021907	CAAT	2	8	119239	119246	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021907	GCCG	2	8	120994	121001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021907	TCCC	2	8	128476	128483	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_021907	GCCG	2	8	130673	130680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021907	CGCC	2	8	133359	133366	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_021907	CCGC	2	8	133566	133573	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_021907	TGAT	2	8	133692	133699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021907	GGCG	2	8	133891	133898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021907	CGCC	2	8	136015	136022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_021907	GATC	2	8	140171	140178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021907	CGCC	2	8	164554	164561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_021907	AGGC	2	8	166643	166650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021907	AAAT	2	8	166753	166760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021907	GGAT	2	8	179000	179007	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021907	CGGA	2	8	189146	189153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021907	TTCT	2	8	190184	190191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021907	CGAA	2	8	203565	203572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021907	CCTG	2	8	207561	207568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021907	TCGA	2	8	207597	207604	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021907	TTCC	2	8	207698	207705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021907	GACC	2	8	207936	207943	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021907	GGAG	2	8	208582	208589	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021907	CCAG	2	8	208643	208650	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021907	TCGA	2	8	208915	208922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021907	CGAC	2	8	208973	208980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021907	GGTG	2	8	209134	209141	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021907	GCCG	2	8	209168	209175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021907	CGCC	2	8	209878	209885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_021907	TTGC	2	8	211620	211627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021907	GAAA	2	8	223950	223957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021907	GCCG	2	8	223964	223971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021907	TTGA	2	8	224235	224242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021907	CGCC	2	8	225153	225160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
87	NC_021907	GGCG	2	8	225251	225258	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_021907	CGTT	2	8	225571	225578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021907	TAGT	2	8	226870	226877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021907	GGAG	2	8	228894	228901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021907	GATC	2	8	237313	237320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021907	GCAA	2	8	237491	237498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021907	GCTG	2	8	239843	239850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021907	GCTC	2	8	245847	245854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021907	CCGA	2	8	246764	246771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021907	GGTC	2	8	248710	248717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021907	CGTC	2	8	248763	248770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.