MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 446

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021907	GAT	2	6	34	39	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021907	GAG	2	6	65	70	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021907	GCT	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021907	ACC	2	6	882	887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021907	AGG	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021907	GCT	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021907	ACA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021907	GAC	2	6	9966	9971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021907	CAT	2	6	9993	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021907	AGG	2	6	11309	11314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021907	AGG	2	6	11510	11515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021907	GGC	2	6	11690	11695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021907	GAT	2	6	15250	15255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021907	GGA	2	6	15273	15278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021907	GGA	2	6	16371	16376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021907	AAG	2	6	16459	16464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021907	ATA	2	6	17935	17940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021907	ATA	2	6	18940	18945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021907	CCT	2	6	25299	25304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021907	GCG	2	6	25308	25313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021907	CGC	2	6	25333	25338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021907	GTC	2	6	30676	30681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021907	GCC	2	6	30712	30717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021907	CAT	2	6	30796	30801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021907	CTC	2	6	31461	31466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021907	GAG	2	6	31467	31472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021907	TCC	2	6	35522	35527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021907	CGA	2	6	37886	37891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021907	TCG	2	6	37950	37955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021907	TGG	2	6	37967	37972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021907	CGC	2	6	40960	40965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_021907	GCC	2	6	40968	40973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_021907	GAT	2	6	40997	41002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021907	CGG	2	6	41084	41089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021907	GCC	2	6	41372	41377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021907	GCC	2	6	43978	43983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021907	TCC	2	6	44023	44028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_021907	TAG	2	6	44049	44054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021907	CGC	2	6	44192	44197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021907	CGC	2	6	44219	44224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_021907	TGA	2	6	44276	44281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021907	GCG	2	6	44314	44319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021907	CTG	2	6	44423	44428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021907	ACC	2	6	44882	44887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_021907	GCG	2	6	45630	45635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021907	TCG	2	6	45707	45712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021907	GCG	2	6	45824	45829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021907	TCT	2	6	45839	45844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021907	CGC	2	6	45868	45873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021907	TGT	2	6	45947	45952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021907	ATG	2	6	45977	45982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021907	GCA	2	6	46260	46265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021907	CAG	2	6	46268	46273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021907	CAT	2	6	47316	47321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021907	CAT	2	6	47364	47369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021907	ACC	2	6	47375	47380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_021907	TCC	2	6	47444	47449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021907	CGG	2	6	47465	47470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021907	CTC	2	6	47494	47499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_021907	GCG	2	6	47635	47640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021907	ACA	2	6	47655	47660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021907	CGC	2	6	47739	47744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021907	AGC	2	6	47795	47800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021907	GGC	2	6	47835	47840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021907	CGG	2	6	47892	47897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021907	CAA	2	6	47959	47964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021907	GGA	3	9	48928	48936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021907	GGC	2	6	48990	48995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021907	AGG	2	6	50743	50748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021907	GCG	2	6	50753	50758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021907	ACG	2	6	50896	50901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021907	GCG	2	6	50926	50931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021907	ATC	2	6	50951	50956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021907	GGC	2	6	50991	50996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021907	CGC	2	6	51001	51006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021907	CTG	2	6	51007	51012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021907	GGA	2	6	51045	51050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021907	GCC	2	6	62298	62303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021907	CTC	2	6	65061	65066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021907	GAT	2	6	65209	65214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021907	CTG	2	6	66978	66983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021907	GGA	2	6	66996	67001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021907	GGA	2	6	67018	67023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021907	AGG	2	6	67812	67817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021907	GGA	2	6	70203	70208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021907	CTT	2	6	75129	75134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021907	CTG	2	6	75204	75209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021907	CGG	2	6	75241	75246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021907	ACG	2	6	75301	75306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021907	TCT	2	6	76126	76131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021907	CGT	2	6	76157	76162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021907	GAA	2	6	76297	76302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021907	GTC	2	6	77643	77648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021907	GCA	2	6	77720	77725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021907	AAC	2	6	77785	77790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021907	CCT	2	6	79866	79871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021907	TCG	2	6	79875	79880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021907	AAT	2	6	79931	79936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021907	CCG	2	6	79962	79967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_021907	AAG	2	6	79996	80001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021907	GCG	2	6	80023	80028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021907	AGC	2	6	80077	80082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021907	GCC	2	6	81841	81846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_021907	TCG	2	6	81861	81866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021907	ATG	2	6	81913	81918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021907	TTC	2	6	82015	82020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_021907	CGC	2	6	82070	82075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021907	CGC	2	6	82116	82121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021907	ATG	2	6	82151	82156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021907	CAT	2	6	82212	82217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021907	CCT	2	6	82250	82255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021907	TGA	2	6	82346	82351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021907	GAT	3	9	82359	82367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021907	CGC	2	6	82532	82537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_021907	GCA	2	6	82619	82624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021907	CAG	2	6	82795	82800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021907	CGA	2	6	82815	82820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021907	GTG	2	6	82927	82932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021907	CCA	2	6	82938	82943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_021907	CAC	2	6	83008	83013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021907	TCG	2	6	83019	83024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021907	GGT	2	6	83148	83153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021907	CGA	3	9	83187	83195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021907	CGC	2	6	83400	83405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_021907	CGG	2	6	83613	83618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021907	TCC	2	6	83624	83629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021907	GGC	2	6	83650	83655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021907	AGT	2	6	83659	83664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021907	TCC	2	6	84243	84248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_021907	AAC	2	6	84253	84258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021907	CCT	2	6	89154	89159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_021907	CTC	3	9	90021	90029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021907	CGG	2	6	91437	91442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021907	ATA	2	6	91450	91455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021907	CGG	2	6	91583	91588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021907	AGC	2	6	91620	91625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021907	GAA	2	6	92980	92985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021907	TCG	2	6	93006	93011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021907	GCT	2	6	93034	93039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021907	TGC	2	6	93113	93118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_021907	GGA	2	6	228919	228924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.