MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1b

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021907	GC	3	6	208793	208798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_021907	CTC	3	9	208821	208829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_021907	GTG	2	6	208845	208850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021907	TCGA	2	8	208915	208922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
505	NC_021907	CGA	2	6	208934	208939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021907	CGAC	2	8	208973	208980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
507	NC_021907	GCG	2	6	209045	209050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021907	CG	3	6	209049	209054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_021907	AGC	2	6	209083	209088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021907	GCA	2	6	209108	209113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021907	GA	3	6	209122	209127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021907	GGTG	2	8	209134	209141	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021907	GCCG	2	8	209168	209175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_021907	CGT	2	6	209218	209223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021907	CGA	2	6	209257	209262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021907	CGC	2	6	209297	209302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_021907	TGA	2	6	209307	209312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021907	CGA	2	6	209347	209352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_021907	TCG	2	6	209385	209390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021907	GAA	2	6	209405	209410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021907	GAC	2	6	209498	209503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021907	CGG	2	6	209569	209574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021907	GTC	2	6	209651	209656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021907	CGG	2	6	209673	209678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021907	CGC	2	6	209695	209700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_021907	CGA	2	6	209748	209753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_021907	GCG	2	6	209870	209875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021907	CGCC	2	8	209878	209885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
529	NC_021907	CGC	2	6	209899	209904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_021907	TCGACG	2	12	209940	209951	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021907	GC	3	6	209953	209958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_021907	CG	3	6	210007	210012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_021907	GGCGC	2	10	210019	210028	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
534	NC_021907	GC	4	8	210025	210032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_021907	G	6	6	210450	210455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021907	CTC	2	6	211510	211515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_021907	TTGC	2	8	211620	211627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NC_021907	A	7	7	211629	211635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021907	TTA	2	6	211701	211706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021907	GAC	2	6	212730	212735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021907	CGG	2	6	214067	214072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_021907	GCTTT	2	10	216981	216990	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
543	NC_021907	GCT	2	6	217015	217020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021907	CAGGA	2	10	217035	217044	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
545	NC_021907	CGCCTC	2	12	218712	218723	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_021907	ATG	2	6	218761	218766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021907	CA	3	6	218809	218814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_021907	CAA	2	6	219789	219794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021907	ATA	2	6	219908	219913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021907	AGG	2	6	219924	219929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_021907	CAA	2	6	220158	220163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021907	CGC	2	6	220212	220217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_021907	CAC	2	6	220241	220246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_021907	AGG	2	6	221150	221155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021907	GCG	2	6	221172	221177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021907	CTG	2	6	222684	222689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021907	TCC	2	6	223779	223784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_021907	TTG	2	6	223785	223790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_021907	GAT	2	6	223791	223796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021907	CAG	2	6	223874	223879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021907	GCC	2	6	223893	223898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_021907	TCG	2	6	223941	223946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_021907	GAAA	2	8	223950	223957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021907	GCCG	2	8	223964	223971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_021907	CAT	2	6	223979	223984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_021907	GTT	2	6	223988	223993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021907	GC	3	6	224010	224015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_021907	CAC	2	6	224027	224032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_021907	TCG	2	6	224045	224050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_021907	AGC	2	6	224145	224150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021907	CGC	2	6	224178	224183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_021907	CTT	2	6	224188	224193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_021907	TTGA	2	8	224235	224242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021907	CA	3	6	224276	224281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
575	NC_021907	GTA	2	6	224327	224332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021907	TAA	2	6	224334	224339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021907	GTT	2	6	224340	224345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021907	GCA	2	6	225128	225133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_021907	CGCC	2	8	225153	225160	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
580	NC_021907	CGG	2	6	225169	225174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021907	T	6	6	225177	225182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021907	GCC	2	6	225190	225195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_021907	GGCG	2	8	225251	225258	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
584	NC_021907	GGA	2	6	225273	225278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021907	TC	3	6	225476	225481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_021907	CGTT	2	8	225571	225578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
587	NC_021907	CCG	2	6	225611	225616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_021907	CTC	2	6	225681	225686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_021907	CT	3	6	225688	225693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_021907	A	6	6	225737	225742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021907	CGC	2	6	225751	225756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_021907	AGG	2	6	225793	225798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021907	CGC	2	6	225799	225804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_021907	GCT	2	6	225805	225810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021907	GAC	2	6	225860	225865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021907	TTC	2	6	225911	225916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_021907	CCG	2	6	225922	225927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_021907	CCATG	2	10	225963	225972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
599	NC_021907	CGG	2	6	225984	225989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021907	GAC	2	6	226008	226013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021907	GAG	2	6	226067	226072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021907	TGC	2	6	226749	226754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021907	AGC	2	6	226776	226781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021907	GGC	2	6	226832	226837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021907	TAGT	2	8	226870	226877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021907	GGA	2	6	226900	226905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021907	CAA	2	6	226914	226919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_021907	GCA	2	6	226977	226982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021907	GAG	2	6	226995	227000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021907	GGAG	2	8	228894	228901	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021907	GGA	2	6	228919	228924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021907	CGC	2	6	229967	229972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_021907	GAC	2	6	233950	233955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021907	CTT	2	6	235039	235044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021907	GGA	2	6	235896	235901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021907	CTC	2	6	237253	237258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_021907	GATC	2	8	237313	237320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_021907	GGA	2	6	237338	237343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021907	CATCT	2	10	237349	237358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
620	NC_021907	TTC	2	6	237386	237391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_021907	GCG	2	6	237409	237414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021907	GCAA	2	8	237491	237498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_021907	CGG	2	6	237503	237508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021907	TGA	2	6	237518	237523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_021907	GAG	2	6	237555	237560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021907	A	6	6	239831	239836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021907	GCTG	2	8	239843	239850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_021907	CCCTC	2	10	239865	239874	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
629	NC_021907	GGC	2	6	240674	240679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021907	TCC	2	6	240683	240688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_021907	TTC	2	6	241419	241424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_021907	CTC	2	6	243581	243586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_021907	TCC	2	6	244673	244678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_021907	CTG	2	6	244716	244721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021907	CTC	2	6	244802	244807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_021907	GC	3	6	244808	244813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
637	NC_021907	TCC	3	9	244842	244850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_021907	TCC	2	6	244854	244859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_021907	CGG	2	6	244874	244879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_021907	TCC	3	9	245772	245780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_021907	TAT	3	9	245824	245832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_021907	GCTC	2	8	245847	245854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
643	NC_021907	CCA	2	6	245863	245868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_021907	T	6	6	245892	245897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_021907	GAT	2	6	245898	245903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
646	NC_021907	GGC	2	6	245916	245921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_021907	GAC	2	6	245927	245932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_021907	CCGA	2	8	246764	246771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
649	NC_021907	TGC	2	6	246831	246836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_021907	CGG	2	6	246851	246856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_021907	CCT	2	6	248003	248008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_021907	ACA	2	6	248060	248065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
653	NC_021907	AAC	2	6	248070	248075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_021907	GGA	2	6	248138	248143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
655	NC_021907	CAGCT	2	10	248264	248273	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
656	NC_021907	TTG	2	6	248353	248358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
657	NC_021907	CCG	2	6	248359	248364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
658	NC_021907	GGTC	2	8	248710	248717	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
659	NC_021907	CGG	2	6	248748	248753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
660	NC_021907	CGTC	2	8	248763	248770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
661	NC_021907	CGC	2	6	248816	248821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
662	NC_021907	T	6	6	248867	248872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_021907	TA	3	6	248890	248895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
664	NC_021907	A	6	6	251240	251245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_021907	CGTCAC	2	12	251255	251266	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

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