MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021905	TTTCCG	2	12	12111	12122	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021905	GGCGCA	2	12	35605	35616	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021905	CCTTTT	2	12	50345	50356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021905	CCAAAT	2	12	65184	65195	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021905	GAATAG	2	12	65389	65400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021905	TCCGGG	2	12	67423	67434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021905	CAAACC	2	12	68253	68264	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021905	ATCGTC	2	12	127003	127014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021905	GCCGGC	2	12	127081	127092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021905	CGACCC	2	12	127573	127584	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_021905	CGTTCC	2	12	127687	127698	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021905	AATGAG	2	12	127753	127764	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021905	ATGTTT	2	12	196715	196726	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021905	CGTTTC	2	12	251757	251768	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021905	CGAAGT	2	12	251963	251974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021905	GCCGGA	2	12	252282	252293	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021905	CGCTCA	2	12	268010	268021	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021905	CCCGAG	2	12	346552	346563	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021905	GAATTC	2	12	352134	352145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021905	ATTTTT	2	12	367385	367396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021905	GGATAG	2	12	367767	367778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021905	GTTCAA	2	12	411199	411210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_021905	AGCGGA	2	12	438943	438954	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021905	CGTCAG	2	12	445389	445400	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021905	ACGGGA	2	12	455804	455815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021905	TCGGCC	2	12	482423	482434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021905	GCGCCG	2	12	516744	516755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021905	CGGCAG	2	12	520086	520097	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_021905	AAAACA	2	12	537100	537111	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021905	GTAAAG	2	12	549850	549861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021905	CTTCAT	2	12	622902	622913	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021905	CCAGGG	2	12	623044	623055	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021905	GATGGC	2	12	647958	647969	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_021905	CGATGA	2	12	648525	648536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021905	GACAAG	2	12	653600	653611	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021905	ATCCGG	2	12	717056	717067	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021905	CTTCGA	2	12	761618	761629	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021905	GACGGA	2	12	797805	797816	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021905	AACGGC	2	12	871575	871586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021905	GCCACA	2	12	909846	909857	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021905	CCGGTC	2	12	911731	911742	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021905	AACGAC	2	12	912547	912558	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021905	TTTGCA	2	12	912886	912897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021905	CTTTCA	2	12	988440	988451	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021905	GCGCAA	2	12	1024562	1024573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021905	CCACCC	2	12	1053690	1053701	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
47	NC_021905	GTGCGG	2	12	1077718	1077729	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021905	TCGAGC	2	12	1105692	1105703	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021905	CGACCT	2	12	1125949	1125960	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021905	GATCAA	2	12	1131284	1131295	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021905	CGATGG	2	12	1135745	1135756	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_021905	GCCGGA	2	12	1139045	1139056	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021905	GCCGGA	2	12	1139747	1139758	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021905	CGTCCG	2	12	1143657	1143668	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021905	GAATTC	2	12	1164484	1164495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021905	CTTCGG	2	12	1198538	1198549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021905	AAGGAG	2	12	1199261	1199272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021905	AGCGCA	2	12	1216066	1216077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021905	CATGTC	2	12	1228628	1228639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021905	TCTCCG	2	12	1228900	1228911	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021905	CGGTTC	2	12	1251886	1251897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021905	GCCCGC	2	12	1273188	1273199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_021905	GAATCT	2	12	1347685	1347696	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021905	GAAGGT	2	12	1395355	1395366	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021905	TCCGAT	2	12	1412332	1412343	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021905	GCCCGC	2	12	1426451	1426462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021905	ACCGCC	2	12	1446041	1446052	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021905	AGCGGC	2	12	1458196	1458207	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021905	TGCGTT	2	12	1502948	1502959	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_021905	GATGCT	2	12	1690740	1690751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021905	GCGAAT	2	12	1750859	1750870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021905	CGTTCT	2	12	1781639	1781650	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021905	CGAAAT	2	12	1793004	1793015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021905	CAATTG	2	12	1838677	1838688	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_021905	AGGCAT	2	12	1886604	1886615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_021905	AAGACA	2	12	1933231	1933242	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021905	AAAAAC	2	12	1934479	1934490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_021905	CGGGGA	2	12	1958860	1958871	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021905	CGCTCC	2	12	2053685	2053696	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_021905	TGCCGG	2	12	2075211	2075222	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021905	CGCATA	2	12	2136849	2136860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021905	GAAGAC	2	12	2137354	2137365	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021905	CGCCAG	2	12	2137423	2137434	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021905	GCATAG	2	12	2148669	2148680	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_021905	AGCGCC	2	12	2149170	2149181	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021905	GGCGCG	2	12	2165935	2165946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021905	CTTAAC	2	12	2205216	2205227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021905	AGCAGT	2	12	2214122	2214133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_021905	CGCCGG	2	12	2289368	2289379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021905	AGAGAC	2	12	2343564	2343575	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_021905	GTGATT	2	12	2359830	2359841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021905	TGCGCA	2	12	2375893	2375904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021905	CGGTGG	2	12	2376399	2376410	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021905	GCCAGC	2	12	2377326	2377337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021905	GCCAGC	2	12	2399473	2399484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021905	CGCAAG	2	12	2535938	2535949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021905	CCTTCT	2	12	2550043	2550054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021905	TCCGCT	2	12	2555291	2555302	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021905	ACCCGT	2	12	2562580	2562591	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021905	CGGTCG	2	12	2574515	2574526	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021905	GCCTTG	2	12	2589252	2589263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021905	AGCGAC	2	12	2592924	2592935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021905	ATTTTA	2	12	2594945	2594956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021905	TACGAT	2	12	2611555	2611566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021905	ACCAGG	2	12	2669665	2669676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021905	GACAGT	2	12	2672767	2672778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021905	CGGCAG	2	12	2712633	2712644	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021905	CGCCGA	2	12	2739060	2739071	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021905	TGAGCG	2	12	2937192	2937203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021905	GATGCC	2	12	2942571	2942582	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021905	GTGCGC	2	12	2942890	2942901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021905	ATCCGC	2	12	2949610	2949621	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021905	CAAAAG	2	12	2960561	2960572	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021905	GGTTTC	2	12	3000746	3000757	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021905	GTGCCG	2	12	3111584	3111595	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021905	ACCGCG	2	12	3136160	3136171	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021905	GCGGCC	2	12	3142294	3142305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021905	CCCTCC	2	12	3188869	3188880	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
119	NC_021905	GATTCC	2	12	3211766	3211777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021905	AACCCA	2	12	3273343	3273354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021905	GGCGCT	2	12	3321141	3321152	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021905	CCTATG	2	12	3321641	3321652	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021905	CGTTTT	2	12	3385291	3385302	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_021905	CAGCAT	2	12	3446585	3446596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021905	TGGGTT	2	12	3452250	3452261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021905	CCCGGA	2	12	3453082	3453093	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021905	CTATTC	2	12	3455116	3455127	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021905	ATTTGG	2	12	3455321	3455332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021905	TGGAGA	2	12	3501005	3501016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021905	CGAAAT	2	12	3549179	3549190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021905	GATTCC	2	12	3572598	3572609	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021905	AGATGA	2	12	3600022	3600033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021905	CAAAAT	2	12	3673874	3673885	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021905	TTCCAG	2	12	3720809	3720820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021905	AATTTG	2	12	3734845	3734856	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021905	ATCGCC	2	12	3804961	3804972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021905	AAATCG	2	12	3807456	3807467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_021905	GCACCG	2	12	3829890	3829901	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021905	TGGGTT	2	12	3849488	3849499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021905	CCCGGA	2	12	3850320	3850331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021905	CTATTC	2	12	3852354	3852365	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021905	ATTTGG	2	12	3852559	3852570	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021905	CAATAA	2	12	3861764	3861775	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_021905	GCTAAT	2	12	3872524	3872535	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_021905	GCGCCC	2	12	3886841	3886852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_021905	ACGTAA	2	12	3897423	3897434	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_021905	TTGCGG	2	12	3974633	3974644	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_021905	ACGTAA	2	12	4005905	4005916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_021905	GGAAGC	2	12	4022975	4022986	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_021905	GCCTTT	2	12	4033277	4033288	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021905	TGAATG	2	12	4039201	4039212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021905	ATCGAT	2	12	4203708	4203719	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_021905	CTCGCG	2	12	4209918	4209929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021905	AGGATG	2	12	4268567	4268578	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.