MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1

Total Repeats: 1616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021905	ATCC	2	8	151	158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021905	GCCA	2	8	5292	5299	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021905	CAGG	2	8	11938	11945	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021905	GCCG	2	8	12020	12027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021905	CGAT	2	8	12363	12370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021905	CGTT	2	8	12888	12895	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021905	CTGC	2	8	15967	15974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021905	GTGA	2	8	20586	20593	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021905	CCGG	2	8	38823	38830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021905	ATTA	2	8	39824	39831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021905	GTTC	2	8	44042	44049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021905	ACGG	2	8	50442	50449	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021905	TGAA	2	8	52898	52905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021905	CCGC	2	8	62126	62133	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_021905	GGTT	2	8	62243	62250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021905	CACT	2	8	62260	62267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021905	GAAC	2	8	62629	62636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021905	GTGA	2	8	62972	62979	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021905	GATC	2	8	63131	63138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021905	TTGG	2	8	63677	63684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021905	TCTT	2	8	64259	64266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021905	CACG	2	8	64297	64304	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021905	GTTT	2	8	64517	64524	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021905	GCCG	2	8	64822	64829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021905	AGGA	2	8	64853	64860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021905	GACT	2	8	65084	65091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021905	GCGA	2	8	65598	65605	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021905	CAAG	2	8	65932	65939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021905	CGTC	2	8	66297	66304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021905	AAAG	2	8	66420	66427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021905	CAAA	2	8	68273	68280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021905	GGGC	2	8	68685	68692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021905	GCCG	2	8	69024	69031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021905	CCGG	2	8	69371	69378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021905	CCAA	2	8	69954	69961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021905	CTTC	2	8	70374	70381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021905	CGAC	2	8	70551	70558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021905	TCCT	2	8	70843	70850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021905	GCAA	2	8	89013	89020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021905	CGAA	2	8	105269	105276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021905	GTGC	2	8	111637	111644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021905	TTGA	2	8	112054	112061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021905	GTCC	2	8	112998	113005	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021905	CGAC	2	8	115121	115128	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021905	ATGA	2	8	115782	115789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021905	CTTG	2	8	115796	115803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021905	CATC	2	8	115840	115847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021905	TTTG	2	8	118533	118540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021905	CAAT	2	8	121874	121881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021905	GGTT	2	8	122021	122028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021905	GCGA	2	8	125477	125484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021905	TCGA	2	8	125579	125586	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021905	CGCC	2	8	125775	125782	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_021905	CTTC	2	8	125832	125839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021905	TGAT	2	8	126236	126243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021905	GTCG	2	8	126301	126308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021905	CCTT	2	8	126671	126678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021905	AGCG	2	8	126839	126846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021905	CGGC	2	8	126851	126858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021905	GCCT	2	8	127135	127142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021905	TGCG	2	8	127163	127170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021905	TCGC	2	8	127349	127356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021905	TTCG	2	8	135761	135768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021905	AAGC	2	8	138286	138293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_021905	TTCC	2	8	145141	145148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021905	TTTG	2	8	146820	146827	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021905	GCAG	2	8	146911	146918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021905	AAGC	2	8	154919	154926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021905	AGCG	2	8	157842	157849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021905	TTTC	2	8	158854	158861	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021905	GCCG	2	8	159108	159115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021905	AGGC	2	8	160572	160579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021905	CTGA	2	8	160706	160713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021905	GGAA	2	8	167047	167054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021905	CCTT	2	8	167063	167070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021905	TGAG	2	8	167104	167111	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021905	GCCG	2	8	175046	175053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021905	GGCA	2	8	191284	191291	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021905	CTGG	2	8	198547	198554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021905	CCGG	2	8	198620	198627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021905	CCAA	2	8	198634	198641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021905	CGGC	2	8	199050	199057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021905	GTCG	2	8	199118	199125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021905	TACA	2	8	199219	199226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021905	AGGC	2	8	199957	199964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021905	AGGG	2	8	200051	200058	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021905	CCAG	2	8	200991	200998	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021905	TCCT	2	8	209601	209608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021905	TTCT	2	8	210398	210405	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021905	TTTC	2	8	210414	210421	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021905	CTGC	2	8	214043	214050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021905	CGTT	2	8	214063	214070	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021905	CCGA	2	8	214199	214206	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021905	CCGG	2	8	214316	214323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021905	TGAA	2	8	214873	214880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021905	CCGG	2	8	214940	214947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021905	CATT	2	8	215119	215126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021905	ACCC	2	8	231837	231844	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_021905	GCTC	2	8	232008	232015	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021905	CGGG	2	8	235116	235123	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021905	GTCT	2	8	235457	235464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021905	GGCA	2	8	238533	238540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021905	TGAA	2	8	239682	239689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021905	TCAT	2	8	245481	245488	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_021905	AAAC	2	8	246027	246034	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021905	TCCT	2	8	246108	246115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021905	TTCC	2	8	249682	249689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021905	ACGC	2	8	250641	250648	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_021905	CGAG	2	8	251257	251264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021905	CTTG	2	8	251741	251748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021905	GGCA	2	8	252361	252368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021905	TATT	2	8	252693	252700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021905	AGCC	2	8	253874	253881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021905	GCGG	2	8	256832	256839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021905	GAGG	2	8	261570	261577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021905	TCGC	2	8	265137	265144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021905	TCTT	2	8	271505	271512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021905	GCCG	2	8	275558	275565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021905	CCGG	2	8	275577	275584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021905	GATC	2	8	276681	276688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021905	ATGC	2	8	276694	276701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021905	CGAT	2	8	278244	278251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021905	CCGC	2	8	294014	294021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_021905	GCGG	2	8	296495	296502	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021905	GCGG	2	8	297984	297991	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021905	GGCC	2	8	299516	299523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021905	GGCC	2	8	299534	299541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021905	CAAA	2	8	300171	300178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021905	GAAT	2	8	313307	313314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021905	AGGA	2	8	317387	317394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021905	GCGG	2	8	326764	326771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_021905	GTGC	2	8	328347	328354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_021905	GCCC	2	8	328593	328600	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_021905	CAAT	2	8	330385	330392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021905	TGCC	2	8	330427	330434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021905	TGCC	2	8	330441	330448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021905	ATCT	2	8	332187	332194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021905	CGGG	2	8	332377	332384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021905	CAGT	2	8	335618	335625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021905	GGAA	2	8	335734	335741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021905	ACCC	2	8	343911	343918	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_021905	TCGA	2	8	343943	343950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021905	TCGA	2	8	343963	343970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021905	CGAA	2	8	344310	344317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_021905	CGGC	2	8	346523	346530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_021905	CCAG	2	8	346987	346994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021905	CGTC	2	8	348498	348505	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021905	CCTT	2	8	348691	348698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021905	CCGG	3	12	351206	351217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021905	GCCG	2	8	351243	351250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021905	TTCG	2	8	352107	352114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_021905	GCCG	2	8	360695	360702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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467	NC_021905	CCCT	2	8	1227185	1227192	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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480	NC_021905	TGAG	2	8	1255526	1255533	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_021905	CCCG	2	8	1256896	1256903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
484	NC_021905	TTGC	2	8	1263333	1263340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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487	NC_021905	GCCA	2	8	1265171	1265178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
488	NC_021905	GATG	2	8	1265243	1265250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
489	NC_021905	TCTG	2	8	1267046	1267053	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
490	NC_021905	CCGA	2	8	1267357	1267364	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_021905	CGAC	2	8	1267884	1267891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_021905	GGCA	2	8	1268061	1268068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_021905	GACA	2	8	1269106	1269113	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_021905	TTGA	2	8	1279276	1279283	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
495	NC_021905	CGTT	2	8	1280412	1280419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_021905	GAAC	2	8	1280428	1280435	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_021905	AACG	2	8	1282577	1282584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_021905	AGCC	2	8	1282631	1282638	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_021905	CGCC	2	8	1283765	1283772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
500	NC_021905	AGGC	2	8	1285472	1285479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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