MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021040	TTTTG	2	10	126	135	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021040	TATAA	2	10	5299	5308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021040	AAATA	2	10	6622	6631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021040	AGAAA	2	10	12108	12117	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021040	ATCAA	2	10	12186	12195	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_021040	AGGCT	2	10	13124	13133	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021040	GGAAA	2	10	13441	13450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021040	ACAAA	2	10	37662	37671	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021040	CAGGT	2	10	39658	39667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021040	AGATT	2	10	42985	42994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021040	GTTAT	2	10	66530	66539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021040	TGATC	2	10	67785	67794	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021040	AGAAT	2	10	72488	72497	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021040	GCAGC	2	10	78087	78096	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021040	ACGGA	2	10	78117	78126	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021040	ATTAA	2	10	79071	79080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021040	AAAAG	2	10	80713	80722	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021040	GACAT	2	10	90369	90378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021040	AGAAT	2	10	95123	95132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021040	CAGTA	2	10	98353	98362	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_021040	ATTCA	2	10	98599	98608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021040	TAAAA	2	10	120838	120847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021040	GTCTT	2	10	127646	127655	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021040	GATAT	2	10	127690	127699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021040	CTGAA	2	10	128735	128744	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021040	TGATT	2	10	139619	139628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021040	CGTCC	2	10	139766	139775	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_021040	GGTTT	2	10	141379	141388	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021040	TCCTC	2	10	151443	151452	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_021040	TCCTC	2	10	151496	151505	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_021040	GAGAT	2	10	156295	156304	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021040	CAATG	2	10	156854	156863	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_021040	AGAAA	2	10	157127	157136	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021040	AAAAT	2	10	160496	160505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021040	AGGGC	2	10	162567	162576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021040	GGAAA	2	10	165697	165706	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021040	TTCAC	2	10	166314	166323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_021040	TTCCA	2	10	166361	166370	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021040	ATATG	2	10	166685	166694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021040	ATTTT	2	10	167447	167456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021040	AAATA	2	10	169757	169766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021040	AAAGC	2	10	170809	170818	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021040	TGGTA	2	10	171284	171293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021040	ATTTT	2	10	175428	175437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021040	AGAAA	2	10	176968	176977	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021040	TTGAC	2	10	187840	187849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021040	TAAAT	2	10	188054	188063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021040	AAGGA	2	10	188311	188320	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021040	AAAAG	2	10	195962	195971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021040	AAAAT	2	10	199279	199288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021040	AGCGA	2	10	199314	199323	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021040	GCTGC	2	10	202712	202721	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_021040	AAATG	2	10	203948	203957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021040	TATCA	2	10	209871	209880	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021040	GATAA	2	10	209964	209973	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021040	CAGGG	2	10	222675	222684	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021040	AAAAT	2	10	227884	227893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021040	AATGA	2	10	240496	240505	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021040	CAAAA	2	10	258848	258857	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021040	ATTTT	2	10	260328	260337	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021040	TTATG	2	10	261119	261128	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021040	TGAAG	2	10	273056	273065	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021040	AAGAA	2	10	279847	279856	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021040	CAAAA	2	10	282133	282142	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021040	GCAGA	2	10	294398	294407	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021040	GCAAG	2	10	296033	296042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021040	GAGAT	2	10	302107	302116	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021040	AGCGG	2	10	302457	302466	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_021040	CATCT	2	10	306521	306530	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_021040	TGGAG	2	10	311055	311064	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021040	CTATT	2	10	316262	316271	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021040	AAAAT	2	10	321010	321019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021040	AGGAA	2	10	322141	322150	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021040	TATGA	2	10	331279	331288	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021040	AAAGG	2	10	332381	332390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021040	TATGA	2	10	337829	337838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021040	CAGCG	2	10	339012	339021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_021040	TTATA	2	10	339361	339370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021040	TTTTA	2	10	341786	341795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021040	CATAT	2	10	346313	346322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021040	TAATC	2	10	347133	347142	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_021040	GAAAG	2	10	350792	350801	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021040	GGGAG	2	10	350937	350946	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021040	CCGTA	2	10	352036	352045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_021040	AGAGG	2	10	352264	352273	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021040	TATAA	2	10	353706	353715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021040	GAAAA	2	10	355066	355075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021040	GAAAA	2	10	366726	366735	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021040	ATCAA	2	10	375606	375615	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021040	TAAAA	2	10	375829	375838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021040	AGCAT	2	10	377697	377706	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021040	TCATA	2	10	383030	383039	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021040	TAAAA	2	10	402726	402735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021040	AGCAT	2	10	402741	402750	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_021040	ATTGT	2	10	404933	404942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021040	GAAAA	2	10	404983	404992	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021040	GATCA	2	10	405786	405795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021040	AGGAA	2	10	414824	414833	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021040	TTTAT	2	10	415374	415383	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021040	ATTTT	2	10	420705	420714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021040	GGAAA	2	10	423815	423824	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021040	TTTGA	2	10	467238	467247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021040	GAAAA	2	10	471124	471133	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021040	AAAAG	2	10	479493	479502	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021040	GAATG	2	10	481369	481378	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021040	TTATG	2	10	485788	485797	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021040	GTTAT	2	10	495496	495505	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021040	ATGAA	2	10	499024	499033	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021040	TAAAA	2	10	500405	500414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021040	GATAT	2	10	505255	505264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021040	ATTGC	2	10	514066	514075	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_021040	TCATT	2	10	514348	514357	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_021040	AGGAT	2	10	515657	515666	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021040	TGTTT	2	10	520863	520872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021040	ATATT	2	10	523237	523246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021040	AATTA	2	10	531301	531310	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021040	CAATC	2	10	534075	534084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021040	ATGAA	2	10	542391	542400	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021040	TCAAA	2	10	560535	560544	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_021040	ATCAA	2	10	567562	567571	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021040	ATTAC	2	10	573849	573858	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021040	TTCTT	2	10	573882	573891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_021040	GAAAT	2	10	574209	574218	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021040	GTAAT	2	10	575646	575655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021040	ATATA	2	10	577190	577199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021040	ATTGT	2	10	579610	579619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021040	AGTAT	2	10	579687	579696	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021040	TGTAT	2	10	581636	581645	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021040	TGATC	2	10	583269	583278	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021040	GGATA	2	10	590546	590555	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021040	TGAAA	2	10	591485	591494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021040	GAAAT	2	10	591721	591730	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021040	CATTG	2	10	596183	596192	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021040	CTTTA	2	10	599901	599910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021040	TTATC	2	10	601983	601992	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021040	GCTTT	2	10	604486	604495	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_021040	TGAAA	2	10	607642	607651	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021040	ATAAA	2	10	624088	624097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021040	CAATA	2	10	625710	625719	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_021040	TCAGT	2	10	630826	630835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021040	TCTGG	2	10	641957	641966	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021040	GATCA	2	10	643337	643346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021040	GATCT	2	10	643822	643831	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021040	AAAAG	2	10	648092	648101	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021040	ATATC	2	10	649871	649880	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021040	ATGTG	2	10	652328	652337	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021040	TCCTC	2	10	652410	652419	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
148	NC_021040	GAAAA	2	10	667534	667543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021040	ATTAT	2	10	668186	668195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021040	AACGC	2	10	689648	689657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_021040	AGATG	2	10	717515	717524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021040	TGATT	2	10	725610	725619	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021040	AGAAA	2	10	727031	727040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021040	TAAAA	2	10	734131	734140	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021040	TTGAA	2	10	734151	734160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021040	GATAT	2	10	736381	736390	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021040	AAAAG	2	10	736631	736640	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021040	ATAAA	2	10	743145	743154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021040	GATAT	2	10	753522	753531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021040	ATCGT	2	10	758006	758015	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_021040	TTAAA	2	10	768289	768298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021040	TTGGG	2	10	768439	768448	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021040	AAGAA	2	10	774642	774651	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021040	ATATA	2	10	777360	777369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021040	ATTTC	2	10	779688	779697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_021040	AGAGG	2	10	795667	795676	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_021040	AGATT	2	10	854373	854382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021040	AGCGA	2	10	873617	873626	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
183	NC_021040	TCATT	2	10	877005	877014	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_021040	AACAG	2	10	879268	879277	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_021040	TTCCA	2	10	880365	880374	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_021040	TCGTG	2	10	890167	890176	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_021040	AAATA	2	10	890199	890208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_021040	ATAGC	2	10	908582	908591	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_021040	ATGGG	2	10	930248	930257	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_021040	CCTGT	2	10	1238729	1238738	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
272	NC_021040	GGCCG	2	10	1239837	1239846	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
273	NC_021040	GCCCA	2	10	1239855	1239864	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
274	NC_021040	AGGGC	2	10	1241806	1241815	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_021040	TTGCA	2	10	1279930	1279939	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_021040	TGAAA	2	10	1283873	1283882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021040	GAAGA	2	10	1287922	1287931	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_021040	TTGTT	2	10	1361697	1361706	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
299	NC_021040	AAAAT	2	10	1365288	1365297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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