MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021040	TCC	2	6	650064	650069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_021040	GAA	2	6	650097	650102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021040	TGG	2	6	650113	650118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021040	AGC	2	6	650128	650133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_021040	TCA	2	6	650153	650158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_021040	TGC	2	6	650200	650205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_021040	ATGA	2	8	650322	650329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021040	A	6	6	650346	650351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021040	A	7	7	650392	650398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_021040	ATA	2	6	650415	650420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_021040	TGT	2	6	651241	651246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021040	N	685	685	651441	652125	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021040	TTGA	2	8	652159	652166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021040	CAT	2	6	652190	652195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_021040	A	6	6	652210	652215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021040	TGAG	2	8	652235	652242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021040	ATA	2	6	652309	652314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021040	ATGTG	2	10	652328	652337	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021040	AGG	2	6	652400	652405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021040	TCCTC	2	10	652410	652419	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3521	NC_021040	AGG	2	6	652454	652459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021040	AGG	2	6	652527	652532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021040	TCA	2	6	654339	654344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021040	TTG	2	6	654347	654352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021040	AGG	2	6	654403	654408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021040	AGG	2	6	654457	654462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021040	A	6	6	654474	654479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021040	GCT	2	6	654515	654520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_021040	AG	3	6	654601	654606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021040	GGA	2	6	654771	654776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021040	CTT	2	6	654819	654824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021040	GCG	2	6	654825	654830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021040	CGA	2	6	654862	654867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021040	GT	3	6	654883	654888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021040	TGC	2	6	654994	654999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_021040	TGC	2	6	655087	655092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021040	ATC	2	6	655164	655169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_021040	CAC	2	6	655180	655185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_021040	TCG	2	6	655189	655194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_021040	TGA	2	6	655198	655203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021040	GTT	2	6	655215	655220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021040	A	6	6	655222	655227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_021040	TCT	2	6	655253	655258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_021040	TTTA	2	8	655308	655315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021040	CAT	2	6	655334	655339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_021040	AAAG	2	8	655391	655398	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021040	TA	3	6	660542	660547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021040	GTA	2	6	664199	664204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021040	A	7	7	664234	664240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021040	A	6	6	664242	664247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021040	CTG	2	6	665510	665515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021040	T	8	8	665581	665588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021040	TA	3	6	665606	665611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021040	T	6	6	667452	667457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021040	A	6	6	667461	667466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021040	A	7	7	667482	667488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021040	GAAAA	2	10	667534	667543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021040	A	6	6	667540	667545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021040	GTT	2	6	667739	667744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021040	AGA	2	6	667788	667793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021040	GGTT	2	8	667869	667876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021040	TG	3	6	667987	667992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_021040	TTAT	2	8	668098	668105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021040	TTA	2	6	668112	668117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021040	TG	3	6	668149	668154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021040	ATTAT	2	10	668186	668195	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021040	GAA	2	6	668213	668218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021040	TTAC	2	8	668232	668239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3569	NC_021040	CAG	2	6	668287	668292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_021040	AG	3	6	668357	668362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021040	GGC	2	6	668381	668386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021040	ATG	2	6	668437	668442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021040	ATT	2	6	668536	668541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021040	GAT	2	6	668571	668576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021040	ATA	2	6	668590	668595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_021040	GTA	2	6	668616	668621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_021040	ATC	3	9	668733	668741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_021040	AG	4	8	668795	668802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021040	A	6	6	668819	668824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021040	TTG	2	6	668827	668832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_021040	AGA	2	6	669053	669058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021040	GCA	2	6	669126	669131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3599	NC_021040	AG	3	6	669867	669872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021040	ACAG	2	8	669919	669926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_021040	A	8	8	670017	670024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021040	CAG	2	6	670046	670051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_021040	ATG	2	6	670052	670057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021040	A	6	6	670060	670065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021040	ACC	2	6	670120	670125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3607	NC_021040	TAA	2	6	670255	670260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3610	NC_021040	ATA	2	6	677229	677234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021040	ATG	2	6	677983	677988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021040	A	6	6	678008	678013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021040	T	6	6	678022	678027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021040	T	7	7	678042	678048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021040	AG	3	6	678056	678061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021040	A	6	6	678094	678099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021040	AAT	2	6	678115	678120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3621	NC_021040	A	6	6	679676	679681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021040	A	8	8	681505	681512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021040	TGC	2	6	681522	681527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3625	NC_021040	T	6	6	681565	681570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021040	CGGG	2	8	681611	681618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3627	NC_021040	AAC	2	6	681731	681736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_021040	T	6	6	684890	684895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021040	T	6	6	684898	684903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021040	A	7	7	684973	684979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021040	AT	3	6	684996	685001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021040	GGA	2	6	685006	685011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_021040	TC	3	6	685041	685046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_021040	AGG	2	6	685056	685061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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