MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021040	ATC	2	6	279362	279367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021040	TCA	2	6	279449	279454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_021040	GTAT	2	8	279518	279525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021040	AG	3	6	279535	279540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021040	AGA	2	6	279568	279573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021040	CTG	2	6	279611	279616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_021040	ATG	2	6	279657	279662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021040	GAG	2	6	279764	279769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021040	AGGA	2	8	279776	279783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021040	GAA	2	6	279818	279823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021040	AAGAA	2	10	279847	279856	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021040	A	6	6	279858	279863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021040	AGA	2	6	279931	279936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021040	ATT	2	6	279947	279952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021040	GGAA	2	8	279957	279964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021040	TGA	2	6	279989	279994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021040	TAA	2	6	280015	280020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021040	A	6	6	280058	280063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021040	AGA	2	6	280091	280096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021040	AAT	2	6	282065	282070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021040	TCT	2	6	282102	282107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_021040	CAAAA	2	10	282133	282142	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1523	NC_021040	AT	3	6	282157	282162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021040	GAAA	2	8	282163	282170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021040	AG	3	6	282271	282276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_021040	TCA	2	6	282301	282306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021040	GTA	2	6	282395	282400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021040	CTG	2	6	282401	282406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_021040	ATA	2	6	282418	282423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021040	T	6	6	282498	282503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021040	GTT	2	6	282506	282511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021040	TCT	2	6	282536	282541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_021040	ACT	2	6	282587	282592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_021040	A	6	6	282598	282603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021040	AAG	2	6	286777	286782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021040	TCC	2	6	286813	286818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_021040	AGC	2	6	286940	286945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_021040	GGA	2	6	286952	286957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021040	TCAG	2	8	287036	287043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_021040	ACTG	2	8	287078	287085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_021040	N	338	338	287197	287534	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021040	GAT	2	6	287582	287587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021040	A	8	8	287739	287746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021040	TC	4	8	287760	287767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_021040	AAAT	2	8	287778	287785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021040	GAAT	2	8	287808	287815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021040	TCC	2	6	287926	287931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_021040	TCC	2	6	288001	288006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_021040	GCAT	2	8	288209	288216	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_021040	ATG	2	6	288282	288287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021040	ATG	3	9	288366	288374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021040	GAG	2	6	288407	288412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021040	AAT	2	6	288413	288418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021040	GCA	2	6	288487	288492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_021040	TGAA	2	8	288549	288556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_021040	AAAG	2	8	288562	288569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021040	AGG	2	6	292894	292899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021040	TACA	2	8	292931	292938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_021040	TAC	2	6	292960	292965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_021040	ATC	2	6	292989	292994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_021040	A	6	6	293043	293048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021040	ACTT	2	8	293100	293107	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_021040	GCA	2	6	293126	293131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_021040	CTG	2	6	293208	293213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_021040	AGA	2	6	293247	293252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021040	GAA	2	6	293255	293260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021040	ATT	2	6	293262	293267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_021040	AT	3	6	293314	293319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021040	CTG	2	6	293325	293330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_021040	T	7	7	293353	293359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021040	ACA	2	6	293492	293497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_021040	TAAT	2	8	293574	293581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021040	ATT	2	6	293589	293594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021040	TGA	2	6	293689	293694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021040	ATA	2	6	293742	293747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021040	TGG	2	6	293771	293776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021040	GGCA	2	8	293784	293791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_021040	TCT	2	6	293829	293834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_021040	GAG	2	6	293900	293905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021040	TAT	2	6	293977	293982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021040	GGT	2	6	294045	294050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021040	GCT	2	6	294100	294105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_021040	TCA	2	6	294136	294141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_021040	TTTA	2	8	294149	294156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021040	CGA	2	6	294157	294162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_021040	TGT	2	6	294169	294174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021040	CTC	2	6	294210	294215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_021040	GGAG	2	8	294220	294227	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021040	GA	3	6	294250	294255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021040	TGC	2	6	294269	294274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_021040	AG	3	6	294287	294292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021040	TAT	2	6	294323	294328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021040	TAG	2	6	294369	294374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021040	CAG	2	6	294387	294392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_021040	GCAGA	2	10	294398	294407	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1596	NC_021040	GCA	2	6	294428	294433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_021040	GAAG	2	8	294442	294449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021040	TAT	2	6	294469	294474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021040	TTCT	2	8	294490	294497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_021040	A	6	6	294530	294535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021040	AAG	2	6	294545	294550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021040	TC	3	6	294583	294588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1603	NC_021040	GAT	2	6	294734	294739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021040	GAA	2	6	294764	294769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021040	A	6	6	294835	294840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021040	A	7	7	294843	294849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021040	N	724	724	294889	295612	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021040	ACCT	2	8	295710	295717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_021040	AGGC	2	8	295764	295771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_021040	TTC	2	6	295899	295904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021040	GGC	2	6	295961	295966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_021040	CAG	2	6	295974	295979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021040	GCAAG	2	10	296033	296042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_021040	GGT	2	6	296123	296128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021040	AGCT	2	8	296159	296166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_021040	AGA	2	6	296293	296298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021040	AAG	2	6	296322	296327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021040	CTTC	2	8	296402	296409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_021040	AGA	2	6	296430	296435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021040	GAA	2	6	296456	296461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021040	AGC	2	6	296472	296477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021040	AAC	2	6	296544	296549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_021040	GAA	2	6	296594	296599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021040	GA	3	6	296633	296638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021040	TGC	2	6	296651	296656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_021040	CGA	2	6	296771	296776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_021040	CTC	2	6	296802	296807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_021040	ATG	3	9	296818	296826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021040	TTGA	2	8	296829	296836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021040	ATC	2	6	296853	296858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_021040	AGA	2	6	296867	296872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021040	TGA	2	6	296884	296889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021040	CAGA	2	8	296955	296962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_021040	ACG	2	6	297022	297027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_021040	TGG	2	6	297034	297039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021040	AAGC	2	8	297084	297091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1637	NC_021040	T	7	7	297119	297125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_021040	TGA	2	6	297135	297140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1641	NC_021040	ATC	2	6	299245	299250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1651	NC_021040	TGA	2	6	299682	299687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1653	NC_021040	GACT	2	8	299771	299778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1654	NC_021040	ACTT	2	8	299817	299824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1655	NC_021040	TAT	2	6	299927	299932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1656	NC_021040	TTC	2	6	299958	299963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1663	NC_021040	CTT	2	6	300189	300194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1664	NC_021040	AACA	2	8	300211	300218	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1665	NC_021040	TTG	2	6	300236	300241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1667	NC_021040	TAC	2	6	300351	300356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1669	NC_021040	CAGA	2	8	300452	300459	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1672	NC_021040	TCGA	2	8	300532	300539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1673	NC_021040	AGA	2	6	300567	300572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1674	NC_021040	AGA	2	6	300578	300583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1678	NC_021040	GTT	2	6	300891	300896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1683	NC_021040	TAC	3	9	300991	300999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1686	NC_021040	ATT	2	6	301201	301206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1697	NC_021040	GTGG	2	8	302585	302592	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1712	NC_021040	TTG	2	6	305695	305700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1737	NC_021040	AGGT	2	8	312450	312457	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1754	NC_021040	TTG	2	6	316552	316557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1756	NC_021040	AG	3	6	316642	316647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1757	NC_021040	ATA	2	6	316648	316653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1763	NC_021040	TTA	2	6	317241	317246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1766	NC_021040	T	6	6	317552	317557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1767	NC_021040	GAA	2	6	317608	317613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1768	NC_021040	AAG	2	6	317976	317981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1769	NC_021040	A	7	7	320898	320904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1770	NC_021040	CTGAAA	2	12	320906	320917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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1990	NC_021040	AG	3	6	350768	350773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1993	NC_021040	GGGAG	2	10	350937	350946	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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