MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis M50/1 draft genome

Total Repeats: 20945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021040	GAT	2	6	2192346	2192351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_021040	GAT	2	6	2192367	2192372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_021040	CAG	2	6	2192454	2192459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_021040	TTG	2	6	2192534	2192539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_021040	GAT	2	6	2192564	2192569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_021040	A	6	6	2192570	2192575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_021040	GA	3	6	2192671	2192676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_021040	ATA	2	6	2192692	2192697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_021040	GTC	2	6	2192719	2192724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_021040	CGC	2	6	2192726	2192731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11011	NC_021040	CAG	2	6	2192759	2192764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_021040	GAAA	3	12	2192772	2192783	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_021040	A	6	6	2192781	2192786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_021040	A	6	6	2192798	2192803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_021040	ATA	2	6	2192965	2192970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_021040	GAA	2	6	2193025	2193030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_021040	A	6	6	2193079	2193084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_021040	GAT	2	6	2193093	2193098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_021040	AAC	2	6	2193150	2193155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_021040	T	6	6	2193231	2193236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_021040	ACT	2	6	2193254	2193259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_021040	T	6	6	2193263	2193268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_021040	TAT	2	6	2193305	2193310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_021040	TTA	2	6	2193311	2193316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_021040	ATCAG	2	10	2196046	2196055	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11026	NC_021040	TAA	2	6	2196063	2196068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_021040	TG	3	6	2198218	2198223	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_021040	CAG	2	6	2198225	2198230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_021040	AAATG	2	10	2198231	2198240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_021040	TG	3	6	2198246	2198251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_021040	AC	3	6	2198260	2198265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_021040	TGG	2	6	2198655	2198660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_021040	GCT	2	6	2198710	2198715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_021040	GGA	2	6	2198728	2198733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_021040	AGA	2	6	2198797	2198802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_021040	GGAAGC	2	12	2198812	2198823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11037	NC_021040	ATCTG	2	10	2198846	2198855	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11038	NC_021040	T	8	8	2198867	2198874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021040	A	6	6	2198878	2198883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_021040	T	6	6	2198890	2198895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_021040	TAT	2	6	2198899	2198904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_021040	TGA	2	6	2198917	2198922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_021040	T	6	6	2198928	2198933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_021040	A	9	9	2200213	2200221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_021040	A	6	6	2200227	2200232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_021040	ATT	2	6	2200304	2200309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_021040	TAG	2	6	2200373	2200378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_021040	TAA	2	6	2202572	2202577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_021040	AT	3	6	2202578	2202583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_021040	A	6	6	2202589	2202594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11052	NC_021040	AGG	2	6	2202996	2203001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_021040	AGG	2	6	2204191	2204196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_021040	TGAT	2	8	2205629	2205636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_021040	TGC	2	6	2205662	2205667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_021040	T	6	6	2205675	2205680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_021040	AAAGA	2	10	2205706	2205715	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_021040	ATC	2	6	2205722	2205727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_021040	ATA	2	6	2207580	2207585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_021040	CAT	2	6	2207608	2207613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_021040	GAT	2	6	2209848	2209853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_021040	A	6	6	2209901	2209906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_021040	TCA	2	6	2212202	2212207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_021040	TGC	2	6	2212272	2212277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_021040	GAA	2	6	2212479	2212484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11068	NC_021040	AGG	2	6	2212705	2212710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_021040	TTAT	2	8	2213344	2213351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11071	NC_021040	GTG	2	6	2213410	2213415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_021040	ACAGA	2	10	2213433	2213442	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11073	NC_021040	GACA	2	8	2213469	2213476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11074	NC_021040	CTT	3	9	2213483	2213491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_021040	T	6	6	2213547	2213552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11077	NC_021040	ATA	2	6	2214688	2214693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_021040	AAAAAG	2	12	2214712	2214723	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_021040	AAT	2	6	2214753	2214758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_021040	A	8	8	2214784	2214791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_021040	ATAGA	2	10	2214863	2214872	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_021040	AAAT	2	8	2216241	2216248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_021040	GAA	2	6	2216259	2216264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_021040	TCA	3	9	2216300	2216308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_021040	ACG	2	6	2216330	2216335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11087	NC_021040	ATTTTA	2	12	2216417	2216428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11089	NC_021040	TGT	2	6	2216512	2216517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11092	NC_021040	ATGT	2	8	2216608	2216615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_021040	CGG	2	6	2216617	2216622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_021040	TCT	2	6	2216668	2216673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_021040	CGAT	2	8	2216706	2216713	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11096	NC_021040	CGC	2	6	2216730	2216735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11097	NC_021040	GCA	2	6	2216738	2216743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_021040	CGCGAT	2	12	2216818	2216829	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_021040	TAT	2	6	2216893	2216898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_021040	CTT	2	6	2216918	2216923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_021040	ACAGC	2	10	2216957	2216966	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11102	NC_021040	GGT	3	9	2216972	2216980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_021040	ATC	2	6	2217047	2217052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_021040	CTG	2	6	2217061	2217066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_021040	ATC	2	6	2217128	2217133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_021040	GAT	2	6	2217154	2217159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_021040	TGGTA	2	10	2217187	2217196	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_021040	AAG	2	6	2217198	2217203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_021040	AGGA	2	8	2217213	2217220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_021040	AGA	2	6	2219999	2220004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_021040	GCT	2	6	2220017	2220022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_021040	TAT	2	6	2220045	2220050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_021040	A	7	7	2220064	2220070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_021040	A	6	6	2220079	2220084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_021040	TTA	2	6	2220088	2220093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_021040	AT	3	6	2220126	2220131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_021040	T	6	6	2220131	2220136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_021040	GTGG	2	8	2220153	2220160	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_021040	A	6	6	2222157	2222162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_021040	A	6	6	2222175	2222180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_021040	T	6	6	2222194	2222199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_021040	TA	4	8	2223698	2223705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_021040	A	6	6	2223726	2223731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_021040	TAC	2	6	2223746	2223751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_021040	A	6	6	2224602	2224607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_021040	ATA	2	6	2224685	2224690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_021040	TA	3	6	2224731	2224736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_021040	ATA	2	6	2224778	2224783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11129	NC_021040	GAA	2	6	2224840	2224845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11130	NC_021040	ATA	2	6	2226387	2226392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11131	NC_021040	ATG	2	6	2226411	2226416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11132	NC_021040	T	6	6	2227700	2227705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11133	NC_021040	TTATTT	2	12	2227725	2227736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_021040	CA	3	6	2228265	2228270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11135	NC_021040	A	6	6	2228304	2228309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11136	NC_021040	CTT	2	6	2229069	2229074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11138	NC_021040	CGG	2	6	2229157	2229162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11143	NC_021040	T	6	6	2229464	2229469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11144	NC_021040	CTG	2	6	2229546	2229551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11146	NC_021040	CAGA	2	8	2229665	2229672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11147	NC_021040	GCG	2	6	2229827	2229832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11150	NC_021040	AG	3	6	2230055	2230060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11151	NC_021040	CAA	2	6	2230193	2230198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11153	NC_021040	TG	3	6	2230319	2230324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11154	NC_021040	TAT	2	6	2230332	2230337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11168	NC_021040	A	6	6	2234676	2234681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11243	NC_021040	A	6	6	2246198	2246203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11251	NC_021040	TGA	2	6	2246597	2246602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11252	NC_021040	A	6	6	2246615	2246620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_021040	AG	3	6	2246625	2246630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_021040	GAT	2	6	2246657	2246662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11256	NC_021040	TTC	2	6	2246689	2246694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11257	NC_021040	ATT	2	6	2246737	2246742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11258	NC_021040	T	6	6	2248672	2248677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11260	NC_021040	A	6	6	2248795	2248800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11262	NC_021040	AAG	2	6	2248902	2248907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11274	NC_021040	TACC	2	8	2251284	2251291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11382	NC_021040	AT	3	6	2262674	2262679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11387	NC_021040	GACA	2	8	2268123	2268130	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11395	NC_021040	ATT	2	6	2268438	2268443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11432	NC_021040	ATT	2	6	2276841	2276846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11434	NC_021040	TGG	2	6	2276872	2276877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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