MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus champanellensis 18P13

Total Repeats: 11264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021039	TCC	2	6	551393	551398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2502	NC_021039	TGC	2	6	551403	551408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_021039	ATC	2	6	551450	551455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_021039	AGC	2	6	551481	551486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_021039	TGC	2	6	551520	551525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_021039	AGG	2	6	551655	551660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021039	CGC	2	6	552162	552167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_021039	CTTTT	2	10	552173	552182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2509	NC_021039	T	6	6	552212	552217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_021039	ATC	2	6	552325	552330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_021039	A	6	6	553513	553518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_021039	TTC	2	6	553561	553566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_021039	TGC	2	6	553586	553591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_021039	ATC	2	6	553633	553638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_021039	CGG	3	9	553680	553688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_021039	TCTG	2	8	553729	553736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_021039	TTG	2	6	553828	553833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021039	CTG	2	6	553834	553839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_021039	A	6	6	553891	553896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_021039	AGG	2	6	553908	553913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_021039	T	6	6	554379	554384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_021039	GGGT	2	8	554401	554408	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_021039	T	7	7	554410	554416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021039	ATGC	2	8	554435	554442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_021039	TCAG	2	8	554469	554476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2526	NC_021039	T	7	7	554574	554580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2531	NC_021039	AGG	2	6	556871	556876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_021039	GAT	2	6	556879	556884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_021039	A	6	6	557628	557633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_021039	GGA	2	6	557634	557639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021039	A	6	6	557884	557889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_021039	CTT	2	6	559269	559274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2539	NC_021039	TA	3	6	560049	560054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2541	NC_021039	CGG	2	6	560156	560161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_021039	A	7	7	560214	560220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2544	NC_021039	TTTG	2	8	560823	560830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_021039	T	6	6	560866	560871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2548	NC_021039	TGT	2	6	565389	565394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_021039	A	6	6	565449	565454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_021039	CCT	2	6	566102	566107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_021039	CCT	2	6	567540	567545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_021039	A	6	6	567552	567557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_021039	ATTTT	2	10	567613	567622	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_021039	CAA	2	6	567657	567662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2556	NC_021039	AAAT	2	8	567719	567726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_021039	GTT	2	6	568407	568412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_021039	GCAG	2	8	568588	568595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2559	NC_021039	CTCA	2	8	568738	568745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2560	NC_021039	TCCAGC	2	12	568775	568786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2561	NC_021039	CTG	2	6	568813	568818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_021039	GCA	2	6	568875	568880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_021039	GCA	2	6	568958	568963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_021039	CCG	2	6	569019	569024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_021039	CCGT	2	8	569030	569037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2566	NC_021039	CTC	2	6	569056	569061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_021039	CTG	2	6	569125	569130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2568	NC_021039	CCTC	2	8	569318	569325	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2572	NC_021039	TCG	2	6	569588	569593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2599	NC_021039	TGC	3	9	574277	574285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2601	NC_021039	ATC	2	6	574336	574341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_021039	TTC	2	6	574387	574392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2603	NC_021039	AAG	2	6	574417	574422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_021039	GCT	3	9	574452	574460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2606	NC_021039	CGA	2	6	574548	574553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2608	NC_021039	CTG	2	6	574644	574649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_021039	TAC	2	6	574657	574662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2611	NC_021039	CTG	2	6	574705	574710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2614	NC_021039	CGG	2	6	574970	574975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_021039	TG	3	6	575005	575010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_021039	AT	3	6	575078	575083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_021039	GCC	2	6	575092	575097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2618	NC_021039	AAAG	2	8	575105	575112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2622	NC_021039	T	8	8	582551	582558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2626	NC_021039	CCTGC	2	10	584047	584056	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2627	NC_021039	TGA	2	6	584123	584128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2629	NC_021039	TAT	2	6	584185	584190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_021039	GGA	2	6	584196	584201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_021039	CTTTAT	2	12	586135	586146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2632	NC_021039	TAT	2	6	586170	586175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_021039	N	393	393	586216	586608	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2635	NC_021039	T	6	6	586644	586649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2772	NC_021039	GCG	2	6	630189	630194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2779	NC_021039	CAT	2	6	630429	630434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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