MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021022	GAA	2	6	470578	470583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021022	ATGG	2	8	470834	470841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_021022	GATCT	2	10	470917	470926	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2504	NC_021022	AC	3	6	470945	470950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2505	NC_021022	ATG	2	6	470989	470994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_021022	GTC	2	6	471068	471073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_021022	AGG	2	6	471082	471087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_021022	AAG	2	6	472124	472129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_021022	AGT	2	6	472158	472163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_021022	T	6	6	472174	472179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_021022	A	7	7	472190	472196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_021022	AGG	2	6	474302	474307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_021022	TGGA	2	8	474389	474396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_021022	GTG	2	6	474531	474536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_021022	TGA	2	6	474556	474561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_021022	GCA	2	6	474568	474573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_021022	AG	3	6	474663	474668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021022	GAA	2	6	474707	474712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_021022	GAA	2	6	474779	474784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_021022	TGC	2	6	474805	474810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2522	NC_021022	GAA	2	6	474935	474940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_021022	CCTT	2	8	474987	474994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_021022	TGAT	2	8	475029	475036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021022	GAA	2	6	475067	475072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_021022	TAA	2	6	475111	475116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2532	NC_021022	AAG	2	6	475264	475269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_021022	GGA	2	6	475297	475302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2536	NC_021022	AG	3	6	475511	475516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_021022	AGA	2	6	475558	475563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_021022	GAA	2	6	475583	475588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_021022	AGC	3	9	475657	475665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2542	NC_021022	CGGG	2	8	475733	475740	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2543	NC_021022	ATC	2	6	475754	475759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2547	NC_021022	TGA	2	6	476107	476112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_021022	GGA	2	6	476113	476118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_021022	TATC	2	8	476137	476144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_021022	GAA	2	6	476165	476170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_021022	TGAA	2	8	476202	476209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_021022	GAA	2	6	476237	476242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_021022	TAT	2	6	476251	476256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_021022	CAT	2	6	476264	476269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2556	NC_021022	GCAGG	2	10	476422	476431	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2557	NC_021022	CTG	2	6	476453	476458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_021022	GAT	2	6	476540	476545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_021022	ATG	2	6	476559	476564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_021022	ATT	2	6	476572	476577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_021022	TAT	2	6	476619	476624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_021022	GCAG	2	8	476680	476687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2563	NC_021022	GGA	2	6	476788	476793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021022	CTT	2	6	476794	476799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2565	NC_021022	AAGAA	2	10	476812	476821	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_021022	ATG	2	6	476822	476827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2571	NC_021022	TCA	2	6	476959	476964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2573	NC_021022	GGA	2	6	477109	477114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2576	NC_021022	CAGGAA	2	12	477161	477172	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2580	NC_021022	AGA	2	6	477391	477396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_021022	ATG	2	6	477414	477419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2589	NC_021022	GCA	2	6	477827	477832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_021022	GTAT	2	8	477882	477889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2595	NC_021022	TGAA	2	8	480429	480436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_021022	GAAG	2	8	480527	480534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_021022	AGA	2	6	480559	480564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_021022	CAG	2	6	480582	480587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_021022	CAG	2	6	480638	480643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_021022	A	6	6	480683	480688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_021022	GTTT	2	8	480753	480760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_021022	TGA	2	6	487307	487312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_021022	TAAAA	2	10	487313	487322	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_021022	A	7	7	487319	487325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021022	T	6	6	487333	487338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_021022	ATATC	2	10	487346	487355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2607	NC_021022	ATA	2	6	487356	487361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_021022	ATTTT	2	10	487414	487423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_021022	TGC	2	6	488432	488437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_021022	A	6	6	488514	488519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_021022	TTC	2	6	488659	488664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_021022	TGTT	2	8	488675	488682	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_021022	CTGGT	2	10	488804	488813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2614	NC_021022	TGC	2	6	488830	488835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_021022	ATC	2	6	488842	488847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_021022	TGTA	2	8	488870	488877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_021022	CTG	2	6	488941	488946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2618	NC_021022	CTG	2	6	489073	489078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_021022	TCT	2	6	489089	489094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_021022	TCT	2	6	489146	489151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2621	NC_021022	TTCC	2	8	489170	489177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2622	NC_021022	AT	3	6	489182	489187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_021022	T	7	7	489187	489193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_021022	GAT	2	6	489238	489243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2626	NC_021022	GCA	2	6	489299	489304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_021022	TCA	2	6	489305	489310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_021022	TCTG	2	8	489335	489342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2629	NC_021022	TTTC	2	8	489351	489358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2630	NC_021022	TCT	2	6	489371	489376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2631	NC_021022	CAG	2	6	489456	489461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2632	NC_021022	CTT	2	6	489489	489494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2634	NC_021022	TGA	2	6	489795	489800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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