MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021022	TA	3	6	316047	316052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021022	TCTA	2	8	316058	316065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_021022	GAA	2	6	316159	316164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021022	ACAG	2	8	316185	316192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_021022	GA	3	6	317780	317785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021022	GA	3	6	318719	318724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021022	AT	3	6	320799	320804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021022	A	7	7	320833	320839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_021022	AGG	2	6	320918	320923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021022	TTTA	2	8	321771	321778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_021022	AG	3	6	321798	321803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021022	ATA	2	6	321814	321819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021022	ATA	2	6	321824	321829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021022	AT	3	6	321835	321840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_021022	AAT	2	6	321886	321891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021022	TAA	2	6	321932	321937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021022	AAAG	2	8	321938	321945	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021022	CAA	2	6	321946	321951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_021022	AGG	2	6	321955	321960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021022	GTAG	2	8	322268	322275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021022	AAT	2	6	322400	322405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021022	AGG	2	6	322410	322415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021022	ATT	2	6	324109	324114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021022	T	6	6	324655	324660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021022	AATCAA	2	12	324672	324683	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1526	NC_021022	AAC	2	6	324684	324689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_021022	ATA	2	6	324690	324695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021022	GGA	2	6	324700	324705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021022	TAT	2	6	326208	326213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_021022	TGA	2	6	326297	326302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021022	A	6	6	326370	326375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021022	A	6	6	328304	328309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021022	ACC	2	6	328323	328328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_021022	GGT	2	6	328400	328405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021022	TA	3	6	328409	328414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021022	AT	3	6	328472	328477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021022	ATA	2	6	328490	328495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021022	TAA	2	6	328524	328529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_021022	ATT	2	6	328537	328542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021022	A	6	6	328549	328554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021022	TAAA	2	8	328579	328586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021022	CG	3	6	328635	328640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_021022	GT	3	6	328678	328683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021022	ATA	2	6	328702	328707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021022	T	7	7	328734	328740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021022	A	6	6	328742	328747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021022	TTG	2	6	329476	329481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_021022	GAAAA	2	10	329492	329501	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021022	GAA	2	6	329633	329638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021022	A	6	6	329637	329642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021022	AGA	2	6	329738	329743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021022	AACAA	2	10	329745	329754	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1553	NC_021022	CAGA	2	8	329766	329773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_021022	GCTG	2	8	329879	329886	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_021022	GCAGT	2	10	329914	329923	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1556	NC_021022	ATGG	2	8	329932	329939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021022	GAA	2	6	330033	330038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021022	GGAA	2	8	330078	330085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021022	AT	3	6	330203	330208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021022	AGA	3	9	330248	330256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021022	TGAT	2	8	330259	330266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021022	GAA	2	6	330330	330335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021022	AGA	2	6	330353	330358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021022	AGC	2	6	330386	330391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_021022	GT	3	6	330421	330426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021022	CTG	2	6	330458	330463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_021022	ACG	2	6	330507	330512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_021022	AGA	2	6	330590	330595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021022	ATA	2	6	332013	332018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021022	AT	3	6	332027	332032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021022	A	6	6	332056	332061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021022	A	7	7	332085	332091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021022	TC	3	6	332142	332147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_021022	TAA	2	6	332151	332156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021022	T	6	6	332186	332191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_021022	TAT	2	6	332205	332210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021022	TA	3	6	333192	333197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021022	AAC	2	6	333207	333212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_021022	TAA	2	6	335213	335218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021022	GGA	2	6	335386	335391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021022	CATA	2	8	336490	336497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_021022	AAG	2	6	336503	336508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021022	CTC	2	6	341036	341041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_021022	GAAAA	2	10	341097	341106	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021022	TA	4	8	341236	341243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021022	TTGTT	2	10	341254	341263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021022	TAA	2	6	341360	341365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021022	T	6	6	341372	341377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021022	TAA	2	6	341396	341401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021022	CTGT	2	8	341486	341493	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_021022	T	7	7	341503	341509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021022	ATG	2	6	341516	341521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021022	ATC	2	6	341538	341543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_021022	AG	3	6	341559	341564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021022	AAT	2	6	341565	341570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021022	A	8	8	341580	341587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021022	AGA	2	6	341696	341701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_021022	TTA	2	6	341716	341721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021022	CCA	2	6	341742	341747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1600	NC_021022	GGC	2	6	341798	341803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_021022	TGT	2	6	341837	341842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021022	GAA	2	6	341858	341863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021022	A	6	6	341862	341867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021022	TGG	2	6	341872	341877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021022	GA	3	6	341884	341889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021022	TGA	2	6	341930	341935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021022	GGT	2	6	341972	341977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021022	GA	3	6	342087	342092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021022	AG	3	6	342129	342134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021022	ATG	2	6	342217	342222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021022	GAA	2	6	342240	342245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_021022	GAT	2	6	342285	342290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_021022	GAA	2	6	342327	342332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021022	GAT	2	6	342378	342383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1617	NC_021022	GAA	2	6	347946	347951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021022	ATA	2	6	347967	347972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021022	AGAA	2	8	347978	347985	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_021022	A	6	6	350936	350941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021022	T	6	6	353800	353805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021022	CT	3	6	353876	353881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_021022	TGA	2	6	353938	353943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021022	AAT	2	6	353999	354004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021022	AGG	2	6	354031	354036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021022	AGT	2	6	357807	357812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021022	T	6	6	357855	357860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_021022	CTTTT	2	10	357925	357934	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1629	NC_021022	AATC	2	8	359330	359337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_021022	TCTT	2	8	359407	359414	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_021022	AAG	2	6	359445	359450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021022	TGG	2	6	359509	359514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021022	ATT	2	6	359590	359595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021022	ATGA	2	8	359694	359701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021022	GTT	2	6	359756	359761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021022	AGAA	2	8	359797	359804	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_021022	TTC	2	6	359830	359835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_021022	AGA	2	6	359855	359860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_021022	TGG	2	6	359941	359946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1910	NC_021022	ATG	2	6	393730	393735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1911	NC_021022	ATG	2	6	393775	393780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1912	NC_021022	GCA	2	6	393841	393846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1913	NC_021022	CAG	2	6	393849	393854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_021022	TTG	2	6	393885	393890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_021022	TGA	2	6	393899	393904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_021022	AGA	2	6	394009	394014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_021022	AAC	2	6	394079	394084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1918	NC_021022	GTT	2	6	394095	394100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_021022	CCA	2	6	394165	394170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1920	NC_021022	TA	3	6	394246	394251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1921	NC_021022	TCAAA	2	10	394256	394265	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1922	NC_021022	GA	3	6	394288	394293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_021022	GAAAGA	2	12	394340	394351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_021022	GAT	2	6	394385	394390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_021022	AGG	2	6	394412	394417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1926	NC_021022	TGTT	2	8	394833	394840	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1927	NC_021022	AGA	2	6	394867	394872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1928	NC_021022	T	6	6	394925	394930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1929	NC_021022	ATT	2	6	394958	394963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1930	NC_021022	A	6	6	394978	394983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1931	NC_021022	ATG	2	6	395013	395018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_021022	ATT	2	6	395024	395029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_021022	TGA	2	6	395030	395035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1934	NC_021022	GATT	2	8	395072	395079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_021022	TG	3	6	395102	395107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_021022	AGG	2	6	395109	395114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1937	NC_021022	ATG	2	6	395285	395290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1938	NC_021022	TAA	2	6	395317	395322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_021022	CTG	2	6	395345	395350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1941	NC_021022	A	6	6	395381	395386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1942	NC_021022	CGG	2	6	397201	397206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1943	NC_021022	CCG	2	6	397225	397230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1944	NC_021022	T	7	7	397235	397241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_021022	T	6	6	397287	397292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_021022	AAG	2	6	397348	397353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1947	NC_021022	TAT	2	6	397407	397412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_021022	N	507	507	397449	397955	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_021022	GATCG	2	10	398098	398107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1953	NC_021022	AGG	2	6	398139	398144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_021022	CGG	2	6	400544	400549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1955	NC_021022	GGC	2	6	400550	400555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1956	NC_021022	TGC	2	6	400559	400564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1957	NC_021022	T	6	6	400570	400575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_021022	A	6	6	400587	400592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_021022	CAG	2	6	400696	400701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1964	NC_021022	GAC	2	6	401522	401527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1966	NC_021022	TA	3	6	405103	405108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1967	NC_021022	ATG	2	6	405173	405178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1970	NC_021022	CCG	2	6	406116	406121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1971	NC_021022	TCTT	2	8	406199	406206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1972	NC_021022	AGCGC	2	10	406588	406597	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1973	NC_021022	CAG	2	6	406649	406654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1979	NC_021022	GAA	2	6	406848	406853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1980	NC_021022	CGG	2	6	406946	406951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1981	NC_021022	TGA	2	6	406975	406980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1983	NC_021022	GCG	2	6	407027	407032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1992	NC_021022	CTG	2	6	407445	407450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1994	NC_021022	GCT	2	6	407555	407560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1998	NC_021022	GCA	2	6	407900	407905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_021022	GGAG	2	8	407974	407981	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

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