MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus obeum A2-162 draft genome

Total Repeats: 18975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021022	TGAA	2	8	868061	868068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021022	GAA	2	6	868096	868101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021022	TAT	2	6	868110	868115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021022	CAT	2	6	868123	868128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_021022	AGG	2	6	868263	868268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021022	GCAGG	2	10	868281	868290	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5007	NC_021022	GAT	2	6	868399	868404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021022	ATG	2	6	868418	868423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021022	TAT	2	6	868478	868483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_021022	GCAG	2	8	868539	868546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_021022	AGAC	2	8	868632	868639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_021022	CTT	2	6	868653	868658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_021022	CAGA	2	8	868708	868715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_021022	AGA	2	6	868727	868732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021022	GCA	2	6	868738	868743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_021022	CAG	2	6	868789	868794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_021022	CTT	2	6	868804	868809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021022	CCA	2	6	868818	868823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_021022	ACCG	2	8	868941	868948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5020	NC_021022	TAG	2	6	868949	868954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021022	GGA	2	6	868968	868973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021022	AGA	2	6	868977	868982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_021022	GAA	2	6	868999	869004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_021022	CAGGAA	2	12	869020	869031	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5025	NC_021022	CCAT	2	8	869123	869130	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_021022	AGA	2	6	869151	869156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021022	GCA	2	6	869164	869169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_021022	GGT	2	6	869209	869214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_021022	GAG	2	6	869230	869235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_021022	CAG	2	6	869241	869246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_021022	AGA	2	6	869289	869294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_021022	AGC	2	6	869301	869306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_021022	N	2589	2589	869405	871993	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021022	TTC	2	6	872071	872076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_021022	ACA	2	6	872122	872127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_021022	AAG	2	6	872156	872161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021022	GAAA	2	8	872170	872177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_021022	TGAA	2	8	872184	872191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021022	GAAG	2	8	872282	872289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021022	ACAG	2	8	872294	872301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_021022	AGA	2	6	872314	872319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_021022	CAG	2	6	872337	872342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021022	CAG	2	6	872393	872398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_021022	A	6	6	872438	872443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021022	GTTT	2	8	872508	872515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021022	GT	3	6	877574	877579	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021022	TA	3	6	877625	877630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021022	GAA	2	6	877634	877639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021022	GAA	2	6	877694	877699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021022	AGT	2	6	877706	877711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021022	GAA	2	6	877720	877725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021022	TAA	2	6	877740	877745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021022	AG	3	6	877772	877777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021022	TTA	2	6	877799	877804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021022	GAT	2	6	877843	877848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021022	AGT	2	6	878009	878014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_021022	T	8	8	878017	878024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021022	GA	3	6	878027	878032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021022	TTC	2	6	878053	878058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_021022	AAG	2	6	878132	878137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021022	CTTT	2	8	878151	878158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_021022	T	6	6	878156	878161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_021022	AT	3	6	878186	878191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_021022	A	6	6	878250	878255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_021022	AAC	2	6	882808	882813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021022	TCC	2	6	885020	885025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_021022	TAA	2	6	885044	885049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021022	AT	3	6	885050	885055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_021022	AGA	2	6	885068	885073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5071	NC_021022	GAT	2	6	885090	885095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021022	AT	3	6	885094	885099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021022	TAA	2	6	885112	885117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021022	ATT	2	6	885149	885154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_021022	GA	3	6	885155	885160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_021022	ATATGA	2	12	885316	885327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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5079	NC_021022	A	6	6	885456	885461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_021022	TA	4	8	885486	885493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_021022	TAT	3	9	885558	885566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021022	TCC	2	6	887246	887251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_021022	T	7	7	887258	887264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021022	A	6	6	887269	887274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021022	A	7	7	887281	887287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021022	ATG	2	6	887331	887336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_021022	AGAA	2	8	887613	887620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021022	GAA	2	6	887650	887655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021022	A	6	6	887707	887712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021022	GAAAA	2	10	887776	887785	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5094	NC_021022	GAT	2	6	887853	887858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021022	GAT	2	6	887926	887931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_021022	TAA	2	6	887998	888003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_021022	A	6	6	888002	888007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021022	TGT	2	6	888583	888588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021022	TATC	2	8	888596	888603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_021022	TAT	3	9	888935	888943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021022	TGC	2	6	889031	889036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_021022	AAT	2	6	889048	889053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021022	CTT	2	6	889438	889443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_021022	AAT	2	6	889447	889452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021022	GAAA	2	8	889874	889881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021022	A	6	6	889900	889905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021022	A	6	6	890048	890053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_021022	AAAT	2	8	890056	890063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021022	A	6	6	890096	890101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021022	T	6	6	890168	890173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021022	TATT	2	8	890209	890216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021022	T	6	6	890223	890228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021022	TTC	2	6	890235	890240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5116	NC_021022	AGG	2	6	890324	890329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_021022	TACA	2	8	891105	891112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_021022	AT	3	6	891154	891159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021022	A	6	6	891298	891303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021022	AGG	2	6	891446	891451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021022	AGA	2	6	891454	891459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021022	AT	3	6	891504	891509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021022	GAAAA	2	10	891550	891559	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021022	A	6	6	891680	891685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021022	ATA	2	6	891736	891741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021022	CTT	2	6	891759	891764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_021022	AAAAC	2	10	891792	891801	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5128	NC_021022	ACG	2	6	891812	891817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_021022	A	6	6	891822	891827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021022	TA	3	6	891883	891888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_021022	AAAAG	2	10	891986	891995	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021022	ATG	2	6	892015	892020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5134	NC_021022	A	7	7	892081	892087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_021022	ATA	2	6	892134	892139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_021022	A	7	7	892139	892145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_021022	GAA	2	6	892146	892151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_021022	AGA	2	6	892161	892166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_021022	ATAAA	2	10	892171	892180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_021022	TTA	2	6	892204	892209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_021022	GAT	2	6	892293	892298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_021022	ATG	2	6	892414	892419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_021022	GA	3	6	892521	892526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_021022	ATC	2	6	892540	892545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5146	NC_021022	A	6	6	892725	892730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_021022	CATA	2	8	892842	892849	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5149	NC_021022	TA	3	6	892936	892941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5254	NC_021022	A	7	7	920975	920981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_021022	ACA	2	6	921029	921034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5257	NC_021022	AGAAA	2	10	921113	921122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_021022	AGG	2	6	921164	921169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_021022	TTTG	2	8	926766	926773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_021022	ATAAA	2	10	926793	926802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_021022	A	6	6	926843	926848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_021022	ATT	3	9	929524	929532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_021022	AAATA	2	10	929535	929544	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_021022	TCC	2	6	929558	929563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5265	NC_021022	GGA	2	6	929580	929585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_021022	T	6	6	929586	929591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_021022	T	7	7	929596	929602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_021022	GAG	2	6	929718	929723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5269	NC_021022	TTG	2	6	929772	929777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5270	NC_021022	CGG	2	6	929873	929878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5271	NC_021022	GAT	2	6	929923	929928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5272	NC_021022	GAA	2	6	930029	930034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5273	NC_021022	TTCA	2	8	930078	930085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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