MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 16858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021015	TAT	2	6	591161	591166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3003	NC_021015	TCC	2	6	591253	591258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_021015	TGC	2	6	591270	591275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_021015	TTC	2	6	591322	591327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_021015	T	6	6	591340	591345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021015	TCT	2	6	591350	591355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021015	CTG	2	6	591392	591397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_021015	TCT	2	6	591419	591424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_021015	T	6	6	591432	591437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021015	AAT	2	6	591474	591479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021015	TG	3	6	591504	591509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021015	TCT	2	6	591598	591603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_021015	A	6	6	591626	591631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021015	AC	3	6	591654	591659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_021015	TGC	2	6	591669	591674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_021015	TCT	2	6	591758	591763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_021015	CTT	2	6	591764	591769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_021015	CTG	2	6	591803	591808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_021015	AAG	2	6	591870	591875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021015	AG	3	6	591901	591906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021015	CCT	2	6	591967	591972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_021015	TATT	2	8	592598	592605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021015	T	6	6	595135	595140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021015	ACC	2	6	595475	595480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_021015	TGT	2	6	595544	595549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3029	NC_021015	TTA	2	6	595702	595707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_021015	T	6	6	595722	595727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_021015	T	6	6	595750	595755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021015	TTA	2	6	595761	595766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021015	T	6	6	595771	595776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021015	ATT	2	6	595798	595803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3041	NC_021015	CT	3	6	597765	597770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_021015	TTC	2	6	597789	597794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_021015	TC	3	6	597801	597806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_021015	CTT	2	6	597856	597861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_021015	TCT	2	6	597862	597867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3047	NC_021015	TCT	2	6	597970	597975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021015	ATA	2	6	597977	597982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_021015	CAA	2	6	598027	598032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3057	NC_021015	TCAAT	2	10	598480	598489	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3058	NC_021015	AGA	2	6	598503	598508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021015	CTG	2	6	598510	598515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3062	NC_021015	GAA	2	6	598707	598712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_021015	ATA	2	6	598754	598759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021015	GCA	2	6	598842	598847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_021015	TTTTCC	2	12	598854	598865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3068	NC_021015	ATAA	2	8	599101	599108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3070	NC_021015	TGAT	2	8	599172	599179	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_021015	GC	3	6	599232	599237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_021015	GCAA	2	8	599286	599293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_021015	AAT	2	6	599328	599333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021015	CTTAC	2	10	599364	599373	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3076	NC_021015	TGAA	2	8	599379	599386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_021015	TA	3	6	599420	599425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021015	A	6	6	599428	599433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_021015	A	6	6	600534	600539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3084	NC_021015	TCA	2	6	600580	600585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_021015	GGAA	2	8	600590	600597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021015	TGC	2	6	600730	600735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_021015	ATT	3	9	600899	600907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021015	AATG	2	8	600918	600925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021015	TGC	2	6	600937	600942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_021015	TCTT	2	8	600943	600950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3093	NC_021015	TA	3	6	601546	601551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_021015	TAT	2	6	606118	606123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021015	A	6	6	606146	606151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021015	A	6	6	606176	606181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_021015	AT	3	6	606232	606237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021015	CAA	2	6	606718	606723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3105	NC_021015	CAA	2	6	608158	608163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_021015	TCT	2	6	609239	609244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3113	NC_021015	CTGAA	2	10	609389	609398	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3114	NC_021015	TG	3	6	609400	609405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_021015	AT	3	6	609601	609606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021015	CCTG	2	8	609619	609626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_021015	TCA	2	6	609670	609675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3122	NC_021015	AGA	2	6	609763	609768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021015	ATC	2	6	609804	609809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_021015	GAT	2	6	609921	609926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021015	GT	3	6	609945	609950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_021015	GAT	2	6	610086	610091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3129	NC_021015	GTC	2	6	610215	610220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_021015	CTTT	2	8	610307	610314	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3131	NC_021015	AAG	2	6	610362	610367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021015	AAC	2	6	610494	610499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_021015	TCT	2	6	610546	610551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_021015	AAT	2	6	610563	610568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021015	ATTG	2	8	610578	610585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_021015	TCT	2	6	611195	611200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_021015	TCT	2	6	611252	611257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_021015	AGA	2	6	611293	611298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_021015	CAA	2	6	611369	611374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_021015	GCT	2	6	611377	611382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_021015	TCT	2	6	611429	611434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_021015	ATC	2	6	611479	611484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_021015	TCAC	2	8	611506	611513	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3144	NC_021015	AGG	2	6	611539	611544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3151	NC_021015	T	6	6	612847	612852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_021015	T	6	6	612858	612863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_021015	T	7	7	612897	612903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_021015	A	9	9	612957	612965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_021015	AAT	2	6	613035	613040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3157	NC_021015	CATAG	2	10	613109	613118	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3159	NC_021015	ATTTT	2	10	613133	613142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3170	NC_021015	AT	3	6	613465	613470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_021015	TAT	3	9	614080	614088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3173	NC_021015	ATA	2	6	614122	614127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3253	NC_021015	TGCA	2	8	634806	634813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3258	NC_021015	ATA	2	6	638777	638782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_021015	CATG	2	8	639911	639918	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_021015	TCATC	2	10	639964	639973	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3261	NC_021015	TCC	2	6	639975	639980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_021015	T	6	6	639981	639986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_021015	CTTT	2	8	640067	640074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3264	NC_021015	T	6	6	640072	640077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_021015	A	7	7	640129	640135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_021015	ATC	2	6	640200	640205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3267	NC_021015	ATT	2	6	640207	640212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_021015	T	6	6	640313	640318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_021015	TAT	2	6	640331	640336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_021015	T	6	6	640339	640344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_021015	CT	3	6	640378	640383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3272	NC_021015	T	6	6	640383	640388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_021015	TCA	2	6	640504	640509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3274	NC_021015	CCG	2	6	640531	640536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3275	NC_021015	AT	3	6	640570	640575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3276	NC_021015	AT	3	6	640589	640594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3291	NC_021015	TCA	2	6	641440	641445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3399	NC_021015	CAGG	2	8	669421	669428	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3402	NC_021015	AGC	2	6	669454	669459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3404	NC_021015	TAA	2	6	669732	669737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3405	NC_021015	TA	3	6	669741	669746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3406	NC_021015	AT	3	6	669764	669769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3407	NC_021015	TAC	2	6	669817	669822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3409	NC_021015	AAGC	2	8	669981	669988	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3410	NC_021015	T	6	6	670180	670185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3412	NC_021015	TGTTC	2	10	670210	670219	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3413	NC_021015	TTTTA	2	10	670246	670255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_021015	CAA	2	6	670273	670278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3415	NC_021015	AT	3	6	670332	670337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3416	NC_021015	ATC	2	6	670356	670361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3420	NC_021015	TC	3	6	670607	670612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3421	NC_021015	TCC	2	6	670719	670724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3422	NC_021015	CTG	2	6	670727	670732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3427	NC_021015	TTC	2	6	671151	671156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3429	NC_021015	CTG	2	6	671253	671258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3432	NC_021015	CAT	2	6	671408	671413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3441	NC_021015	CAG	2	6	671892	671897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3443	NC_021015	CTG	2	6	671916	671921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3445	NC_021015	A	8	8	671954	671961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3446	NC_021015	TCA	2	6	671977	671982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3450	NC_021015	TTC	2	6	672195	672200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3451	NC_021015	TTC	3	9	672240	672248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3452	NC_021015	CAT	2	6	674054	674059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3454	NC_021015	TAT	2	6	674126	674131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3455	NC_021015	TAT	2	6	674137	674142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3456	NC_021015	ATT	2	6	674169	674174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3458	NC_021015	TA	3	6	674182	674187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3471	NC_021015	T	6	6	677564	677569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3472	NC_021015	ATA	2	6	678511	678516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3483	NC_021015	CTTTT	2	10	680527	680536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3484	NC_021015	GCC	2	6	680626	680631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3485	NC_021015	CTTTT	2	10	680646	680655	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3486	NC_021015	ATC	2	6	680667	680672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3492	NC_021015	AT	3	6	680752	680757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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