MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 16858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021015	CTGT	2	8	175833	175840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_021015	TC	3	6	176081	176086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_021015	TGC	2	6	176096	176101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021015	CT	3	6	177518	177523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_021015	A	6	6	177530	177535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021015	ATTA	2	8	177540	177547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021015	TTG	2	6	177563	177568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021015	T	6	6	177576	177581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021015	TTGA	2	8	177632	177639	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021015	TTC	2	6	177689	177694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021015	TCT	2	6	177775	177780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_021015	CAT	3	9	177799	177807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021015	T	6	6	177833	177838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021015	TTTTC	2	10	177918	177927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_021015	TCA	2	6	178119	178124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021015	AAAT	2	8	178140	178147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021015	ATA	2	6	178175	178180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021015	CAA	2	6	178252	178257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021015	CTA	2	6	178273	178278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021015	TTTC	2	8	178289	178296	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_021015	TTC	2	6	178304	178309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021015	TC	3	6	182179	182184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_021015	CTA	2	6	182185	182190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021015	T	6	6	187367	187372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021015	T	6	6	187377	187382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021015	T	6	6	187409	187414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021015	CTG	2	6	190244	190249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021015	CAT	2	6	190263	190268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021015	AGA	2	6	190269	190274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021015	TTTC	2	8	190290	190297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_021015	GAA	2	6	190324	190329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021015	TGT	2	6	190344	190349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021015	A	6	6	190383	190388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021015	TCGTT	2	10	190459	190468	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1035	NC_021015	CGGT	2	8	190526	190533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_021015	ATA	2	6	190551	190556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021015	ATCCA	2	10	190566	190575	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_021015	TCC	2	6	190653	190658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_021015	TTC	2	6	190702	190707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_021015	TTC	2	6	190720	190725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021015	TGT	2	6	190845	190850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021015	CAT	2	6	190859	190864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021015	ATT	2	6	190872	190877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021015	CAT	2	6	190895	190900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_021015	TCT	2	6	190924	190929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_021015	CATGC	2	10	191189	191198	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1047	NC_021015	ATA	3	9	191199	191207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021015	TGT	2	6	191318	191323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021015	TCT	2	6	191326	191331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021015	T	7	7	191336	191342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021015	TGC	2	6	191415	191420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_021015	ACTT	2	8	191442	191449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_021015	CAC	2	6	191523	191528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_021015	GCT	2	6	191536	191541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021015	CAA	2	6	191573	191578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021015	TTCTG	2	10	191611	191620	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_021015	ATT	2	6	191640	191645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021015	CTT	2	6	191696	191701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_021015	T	6	6	191710	191715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021015	ATTG	2	8	191763	191770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021015	TA	3	6	191807	191812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021015	TTTC	2	8	191820	191827	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_021015	TG	3	6	191902	191907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021015	TGC	2	6	191928	191933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_021015	CTC	2	6	191963	191968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_021015	ACTG	2	8	191970	191977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_021015	TCC	2	6	192036	192041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_021015	CAT	2	6	192093	192098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_021015	TGTT	2	8	192164	192171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021015	CT	3	6	192274	192279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_021015	CTGT	2	8	192409	192416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_021015	TA	3	6	192455	192460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021015	TAT	2	6	192494	192499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021015	TCT	2	6	192538	192543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021015	TTA	2	6	192628	192633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021015	GT	3	6	192708	192713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021015	TCA	2	6	192857	192862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_021015	TGA	2	6	192915	192920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021015	TCTG	2	8	192926	192933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_021015	ACCA	2	8	193076	193083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_021015	ATA	2	6	193167	193172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021015	CAC	2	6	193296	193301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_021015	ATA	2	6	193383	193388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021015	TGA	2	6	193470	193475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021015	GCT	2	6	193476	193481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021015	CTCC	2	8	193499	193506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1087	NC_021015	T	6	6	193555	193560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021015	TTCC	2	8	193673	193680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_021015	ATT	2	6	193776	193781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021015	TCC	2	6	193797	193802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_021015	CAT	2	6	193835	193840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_021015	CAC	2	6	193955	193960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_021015	CTT	2	6	194041	194046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021015	CTGC	2	8	194081	194088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_021015	A	6	6	194206	194211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_021015	GCT	2	6	194225	194230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021015	GCC	2	6	194233	194238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_021015	TCC	2	6	194260	194265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_021015	TGT	2	6	194355	194360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021015	T	8	8	194396	194403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021015	TCC	2	6	194421	194426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_021015	TAA	2	6	194444	194449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021015	A	6	6	194448	194453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021015	TCC	3	9	195255	195263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_021015	TAT	2	6	195293	195298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021015	CTT	2	6	195305	195310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_021015	ATC	2	6	195352	195357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021015	AGC	2	6	195481	195486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021015	TGCTA	2	10	195502	195511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_021015	CTT	2	6	195531	195536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021015	CTG	2	6	195555	195560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_021015	GCA	2	6	195584	195589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021015	AT	3	6	195645	195650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021015	T	7	7	195650	195656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021015	T	6	6	195716	195721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021015	T	7	7	195755	195761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021015	CCA	2	6	195778	195783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_021015	TCC	2	6	195817	195822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_021015	TC	3	6	195867	195872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_021015	TTTTTC	2	12	195876	195887	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1121	NC_021015	GAAAAA	2	12	195912	195923	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021015	T	6	6	195953	195958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021015	CAT	2	6	195959	195964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021015	AGAAC	2	10	195983	195992	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_021015	A	6	6	196002	196007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021015	ATCC	2	8	196423	196430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_021015	TCCT	2	8	196431	196438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_021015	A	8	8	196480	196487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021015	CCT	2	6	196551	196556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_021015	AT	3	6	196562	196567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021015	T	6	6	196626	196631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021015	T	6	6	196635	196640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021015	ATA	2	6	196674	196679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021015	TCG	2	6	196686	196691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_021015	TCC	2	6	196709	196714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1136	NC_021015	GAA	2	6	196786	196791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021015	T	7	7	196820	196826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_021015	CCT	2	6	197023	197028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1151	NC_021015	TA	3	6	204615	204620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1156	NC_021015	GTT	2	6	204800	204805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1159	NC_021015	T	6	6	204828	204833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_021015	ATTTG	2	10	209821	209830	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1186	NC_021015	T	6	6	210993	210998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1269	NC_021015	TTTC	2	8	221061	221068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1270	NC_021015	GAT	2	6	221107	221112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1272	NC_021015	CTT	2	6	221222	221227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1276	NC_021015	A	6	6	224391	224396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_021015	T	7	7	224625	224631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1278	NC_021015	ATTT	2	8	224636	224643	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_021015	T	6	6	224646	224651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1280	NC_021015	T	6	6	224659	224664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1281	NC_021015	A	6	6	224700	224705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1282	NC_021015	TCCA	2	8	224740	224747	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1283	NC_021015	TCT	2	6	224786	224791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1284	NC_021015	AAC	2	6	224801	224806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1285	NC_021015	T	6	6	227369	227374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1286	NC_021015	CTGG	2	8	227446	227453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1287	NC_021015	T	6	6	227497	227502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1288	NC_021015	AGAT	2	8	227532	227539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1289	NC_021015	TGT	2	6	227592	227597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1292	NC_021015	TTAA	2	8	230947	230954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1293	NC_021015	T	6	6	230980	230985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1294	NC_021015	A	6	6	231039	231044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1295	NC_021015	TAT	2	6	231076	231081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1299	NC_021015	TCC	2	6	232301	232306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1301	NC_021015	A	6	6	232433	232438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1302	NC_021015	T	6	6	233943	233948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1307	NC_021015	AAT	2	6	234120	234125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1322	NC_021015	TCT	2	6	234780	234785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1403	NC_021015	TTG	2	6	248001	248006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_021015	A	6	6	248078	248083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_021015	AGA	2	6	248097	248102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_021015	TCAG	2	8	248142	248149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1408	NC_021015	AGA	2	6	248197	248202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_021015	T	7	7	248220	248226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_021015	ATA	2	6	248227	248232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_021015	AAT	2	6	248359	248364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_021015	GAAA	2	8	250424	250431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_021015	CAA	2	6	252413	252418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1450	NC_021015	ATT	2	6	255212	255217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_021015	ATA	2	6	255370	255375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_021015	TGA	2	6	255408	255413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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