MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus torques L2-14 draft genome

Total Repeats: 16858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021015	CTT	2	6	90916	90921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021015	TAG	2	6	91001	91006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_021015	CTG	2	6	91024	91029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_021015	CTTT	2	8	91053	91060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_021015	T	6	6	91101	91106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021015	CTA	2	6	91190	91195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021015	ACTG	2	8	91320	91327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
508	NC_021015	CGATTA	2	12	91337	91348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
509	NC_021015	GAA	2	6	91349	91354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021015	ATT	2	6	91357	91362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021015	ATT	2	6	91396	91401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021015	T	6	6	91431	91436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021015	TG	3	6	91497	91502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_021015	CCTAT	2	10	95742	95751	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
515	NC_021015	CAA	2	6	95755	95760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021015	CTT	2	6	95773	95778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021015	TCA	2	6	95799	95804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021015	ATG	2	6	95826	95831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021015	TCT	2	6	95833	95838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_021015	T	6	6	95838	95843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021015	ATC	2	6	96033	96038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_021015	CAA	2	6	96148	96153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021015	AAC	2	6	97147	97152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_021015	TCA	2	6	97931	97936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021015	CTT	2	6	98007	98012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021015	TCT	3	9	98042	98050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_021015	CAT	2	6	98133	98138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021015	TCTG	2	8	98174	98181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_021015	TGC	2	6	98239	98244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021015	TCT	2	6	98336	98341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021015	GCT	2	6	98351	98356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021015	CTG	3	9	98382	98390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021015	AAT	2	6	98403	98408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021015	CAA	2	6	98415	98420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_021015	TGC	2	6	98437	98442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021015	TCA	2	6	98529	98534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021015	TGC	2	6	98548	98553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_021015	GAA	2	6	98608	98613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021015	CAC	2	6	98620	98625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_021015	CAC	2	6	98631	98636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_021015	ATT	2	6	98705	98710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021015	AAT	2	6	98734	98739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021015	TGC	2	6	98764	98769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_021015	CTG	2	6	98782	98787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021015	CTG	3	9	98826	98834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021015	GCT	2	6	98852	98857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_021015	GCA	2	6	98912	98917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_021015	TGAA	2	8	99044	99051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021015	GAA	2	6	99093	99098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021015	TCA	2	6	99188	99193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_021015	GCA	2	6	99194	99199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021015	TGC	2	6	99208	99213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021015	TCA	2	6	99338	99343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021015	TGC	2	6	99394	99399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_021015	ATCAG	2	10	99440	99449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
556	NC_021015	CAA	2	6	99456	99461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_021015	CTT	2	6	99462	99467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_021015	CTG	2	6	99473	99478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021015	GTT	2	6	99493	99498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021015	CAA	2	6	99510	99515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021015	CTGA	2	8	99526	99533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
562	NC_021015	TGC	3	9	99553	99561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_021015	TCAT	2	8	99602	99609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_021015	TGT	2	6	99625	99630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021015	ACTG	2	8	99668	99675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_021015	CAT	2	6	99837	99842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_021015	GCA	2	6	99845	99850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_021015	TGCATT	2	12	99937	99948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
569	NC_021015	GTT	2	6	99970	99975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021015	CTG	2	6	99982	99987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021015	CTG	2	6	100041	100046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_021015	TG	3	6	100094	100099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021015	GT	3	6	100107	100112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021015	CTT	2	6	100137	100142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_021015	CATC	2	8	100176	100183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_021015	TGC	2	6	100378	100383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_021015	GCA	2	6	100403	100408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021015	TGAT	2	8	100415	100422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021015	GCT	2	6	100444	100449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021015	CTG	2	6	100474	100479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_021015	ACTGA	2	10	100511	100520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
582	NC_021015	TGT	2	6	100524	100529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021015	GAA	2	6	100728	100733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021015	CTT	2	6	100782	100787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021015	TGT	2	6	101225	101230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021015	A	6	6	101257	101262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021015	TA	3	6	101278	101283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_021015	CA	3	6	101289	101294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_021015	ACC	2	6	104988	104993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_021015	CCTT	2	8	106135	106142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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592	NC_021015	TGAT	2	8	106826	106833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021015	A	6	6	106869	106874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021015	ATT	2	6	107018	107023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_021015	TCA	2	6	109090	109095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_021015	CACCGT	2	12	109100	109111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
599	NC_021015	TTTC	2	8	109151	109158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
600	NC_021015	CTT	3	9	109163	109171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_021015	TCA	2	6	109240	109245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_021015	AAT	2	6	109278	109283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021015	ATTC	2	8	109289	109296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_021015	TCT	2	6	109333	109338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_021015	CCTGT	2	10	109355	109364	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
606	NC_021015	CAT	2	6	109397	109402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_021015	CAT	2	6	109514	109519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021015	TCAA	2	8	109534	109541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
610	NC_021015	TTC	2	6	109666	109671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_021015	TGACT	2	10	109788	109797	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
612	NC_021015	GCA	2	6	109882	109887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021015	GAA	2	6	110058	110063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_021015	GTA	2	6	110151	110156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021015	CCG	2	6	110176	110181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_021015	CTT	2	6	110223	110228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021015	CAG	2	6	110244	110249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021015	AT	3	6	110254	110259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021015	CAA	2	6	110342	110347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021015	TGT	2	6	110351	110356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021015	CAA	2	6	110369	110374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_021015	CAT	2	6	110423	110428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_021015	CAT	2	6	110463	110468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_021015	TGC	2	6	110490	110495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021015	TG	3	6	110528	110533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021015	ATA	2	6	110625	110630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021015	AGT	2	6	110701	110706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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630	NC_021015	A	6	6	112716	112721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021015	ACATT	2	10	112730	112739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
632	NC_021015	A	6	6	112765	112770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021015	A	6	6	112779	112784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021015	CTT	2	6	112791	112796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021015	ACA	2	6	112861	112866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_021015	TGT	2	6	112891	112896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_021015	TCAG	2	8	114334	114341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_021015	TGA	2	6	114359	114364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021015	CTG	2	6	114404	114409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_021015	TTC	2	6	114432	114437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_021015	TCCT	2	8	114483	114490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
642	NC_021015	TTC	2	6	114494	114499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_021015	CCTT	2	8	114519	114526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
644	NC_021015	CCTT	2	8	116954	116961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
645	NC_021015	ACA	2	6	116976	116981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_021015	CAA	2	6	117055	117060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_021015	TGAC	2	8	117249	117256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
648	NC_021015	TCT	2	6	117313	117318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_021015	TCA	2	6	117333	117338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_021015	TGAT	2	8	117342	117349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
651	NC_021015	CCG	2	6	117465	117470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_021015	AAG	2	6	117536	117541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_021015	AAC	2	6	117562	117567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_021015	CAA	2	6	117582	117587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_021015	ATC	2	6	117590	117595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_021015	ATA	2	6	117633	117638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
657	NC_021015	CCGT	2	8	117642	117649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
658	NC_021015	TCT	2	6	117805	117810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
659	NC_021015	TTC	2	6	117828	117833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
660	NC_021015	CTT	2	6	117844	117849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_021015	T	6	6	117864	117869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_021015	GCA	2	6	117870	117875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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664	NC_021015	TGC	2	6	117935	117940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_021015	GCA	2	6	118000	118005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_021015	ACC	2	6	118049	118054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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668	NC_021015	TG	3	6	118138	118143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
669	NC_021015	CTT	2	6	118162	118167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
670	NC_021015	ATATTT	2	12	118196	118207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NC_021015	T	6	6	118205	118210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
672	NC_021015	AAG	2	6	118227	118232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
673	NC_021015	TGCAT	2	10	118356	118365	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
674	NC_021015	T	6	6	118378	118383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_021015	TTG	2	6	118578	118583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
682	NC_021015	TGA	2	6	118589	118594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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684	NC_021015	T	6	6	118612	118617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
685	NC_021015	CAA	2	6	118618	118623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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755	NC_021015	TTG	2	6	132640	132645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
756	NC_021015	TCTTT	2	10	132688	132697	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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760	NC_021015	GCG	2	6	133657	133662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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764	NC_021015	AT	3	6	133796	133801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_021015	A	6	6	133802	133807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
766	NC_021015	CT	3	6	133817	133822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
767	NC_021015	T	6	6	133822	133827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
768	NC_021015	CTT	2	6	133841	133846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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771	NC_021015	TAT	2	6	134136	134141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_021015	ACT	2	6	134231	134236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_021015	T	10	10	134256	134265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_021015	TCTT	2	8	134343	134350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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776	NC_021015	ACT	2	6	134430	134435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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784	NC_021015	ATT	2	6	135887	135892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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786	NC_021015	T	7	7	135929	135935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
787	NC_021015	A	9	9	136423	136431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_021015	A	6	6	166924	166929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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