MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021014	TA	4	8	693699	693706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021014	GAA	2	6	693707	693712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_021014	A	7	7	693744	693750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_021014	TCC	2	6	694193	694198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_021014	TTTA	2	8	694206	694213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_021014	TCA	2	6	694218	694223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_021014	GTCC	2	8	694234	694241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_021014	ATA	2	6	694280	694285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_021014	AACA	2	8	695656	695663	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_021014	AGC	2	6	696053	696058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_021014	TCAC	2	8	696205	696212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_021014	CG	3	6	696231	696236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_021014	ACAA	2	8	696348	696355	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4014	NC_021014	A	6	6	696354	696359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_021014	ATAGT	2	10	696378	696387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_021014	AG	3	6	696430	696435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021014	TAA	2	6	696532	696537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021014	TAT	2	6	696543	696548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021014	AT	4	8	696605	696612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021014	GGT	2	6	696674	696679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021014	ATTTTT	2	12	696723	696734	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021014	TAA	2	6	696762	696767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_021014	AGG	2	6	696791	696796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021014	AGG	2	6	698104	698109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021014	AAC	2	6	698112	698117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_021014	T	7	7	700791	700797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021014	TA	3	6	700840	700845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_021014	GGAG	2	8	700903	700910	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_021014	TTAA	2	8	701141	701148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021014	GAAA	2	8	701174	701181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_021014	GAT	2	6	702344	702349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021014	GACA	2	8	702767	702774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_021014	AT	3	6	702792	702797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_021014	AAT	2	6	702841	702846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021014	GGA	2	6	702877	702882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021014	CTT	2	6	702946	702951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_021014	TCCA	2	8	703012	703019	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_021014	CAT	2	6	703038	703043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_021014	A	6	6	703046	703051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021014	AGA	2	6	703130	703135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_021014	ATG	2	6	703210	703215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_021014	ATA	2	6	703283	703288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021014	T	6	6	703307	703312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021014	CGA	2	6	703329	703334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021014	GGAA	2	8	703352	703359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_021014	CAT	2	6	703506	703511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_021014	CTT	2	6	703558	703563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_021014	AAG	2	6	703628	703633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_021014	AG	3	6	703716	703721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_021014	AGA	2	6	703724	703729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_021014	AGC	2	6	703765	703770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_021014	CCG	2	6	703791	703796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_021014	ACA	2	6	703864	703869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_021014	AGA	3	9	703899	703907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_021014	TGT	2	6	703926	703931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_021014	ATTT	2	8	703962	703969	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_021014	GGA	2	6	704019	704024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_021014	TCT	2	6	704049	704054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_021014	TCC	2	6	704086	704091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_021014	AGA	2	6	704124	704129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_021014	TCT	2	6	704175	704180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_021014	TAT	2	6	704254	704259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_021014	CCCA	2	8	704299	704306	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4064	NC_021014	T	6	6	704404	704409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_021014	TA	3	6	704452	704457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_021014	AGG	2	6	704845	704850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_021014	GAAA	2	8	704855	704862	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_021014	A	6	6	707509	707514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_021014	CAT	2	6	707660	707665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_021014	AGT	2	6	707666	707671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_021014	AG	3	6	707672	707677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_021014	GCT	2	6	709119	709124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_021014	CCT	2	6	709137	709142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_021014	TAA	2	6	709178	709183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_021014	AT	3	6	709190	709195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_021014	ATT	2	6	709232	709237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021014	A	7	7	709266	709272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021014	GCA	3	9	712079	712087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_021014	CT	3	6	712140	712145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_021014	TTCC	2	8	712585	712592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_021014	T	6	6	713383	713388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_021014	A	6	6	713738	713743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_021014	GATT	2	8	713744	713751	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_021014	AAG	2	6	713756	713761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_021014	AAAG	2	8	713774	713781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_021014	TGGTTT	2	12	715735	715746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_021014	T	6	6	715749	715754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_021014	AGA	2	6	715869	715874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_021014	TCAA	2	8	715882	715889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_021014	TATG	2	8	715898	715905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_021014	TGGA	2	8	715943	715950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_021014	ATT	2	6	715969	715974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_021014	AGA	2	6	716133	716138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021014	TCA	2	6	716240	716245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_021014	GAT	2	6	717985	717990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_021014	AAC	2	6	717999	718004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_021014	AGA	2	6	718494	718499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021014	GAT	3	9	718540	718548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_021014	GAAAA	2	10	718615	718624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_021014	T	6	6	718656	718661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_021014	TAT	2	6	718699	718704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021014	GTCA	2	8	718734	718741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4104	NC_021014	AGC	2	6	718752	718757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_021014	A	6	6	718772	718777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021014	GGA	2	6	718782	718787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021014	GAA	2	6	718822	718827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021014	AGA	2	6	718836	718841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021014	A	6	6	718869	718874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_021014	TTA	2	6	721435	721440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021014	GAA	2	6	721571	721576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_021014	GAA	2	6	721698	721703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_021014	CTG	3	9	721713	721721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_021014	AGC	2	6	721730	721735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_021014	ATGG	2	8	721806	721813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_021014	A	7	7	723162	723168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021014	CTG	2	6	723198	723203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_021014	ATT	2	6	723218	723223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_021014	TGC	2	6	723229	723234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_021014	ATA	2	6	723861	723866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_021014	TA	3	6	723865	723870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_021014	AAG	2	6	723873	723878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_021014	A	6	6	723939	723944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021014	TTGG	2	8	723951	723958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021014	A	6	6	724005	724010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021014	A	6	6	724023	724028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021014	TGTC	2	8	724130	724137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_021014	TATGG	2	10	724191	724200	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_021014	A	6	6	724201	724206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_021014	A	6	6	724296	724301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_021014	A	6	6	725309	725314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_021014	AAT	2	6	725373	725378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_021014	AGG	2	6	725397	725402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_021014	T	6	6	725796	725801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_021014	AT	4	8	725821	725828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_021014	TCT	2	6	725834	725839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_021014	TA	3	6	725854	725859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_021014	GAA	2	6	725873	725878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_021014	TA	3	6	742444	742449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_021014	TAT	2	6	742467	742472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_021014	A	6	6	742487	742492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_021014	TA	3	6	742493	742498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_021014	AAG	2	6	742542	742547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_021014	GAA	2	6	742578	742583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_021014	N	1229	1229	742693	743921	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4272	NC_021014	CT	3	6	744171	744176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4273	NC_021014	GAA	2	6	744206	744211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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