MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021014	AGA	2	6	604757	604762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021014	A	6	6	604774	604779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021014	GAAA	2	8	604839	604846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021014	AGA	2	6	604942	604947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_021014	GAT	2	6	604950	604955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021014	TCC	2	6	604956	604961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3507	NC_021014	GAT	2	6	604989	604994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021014	GAG	2	6	605167	605172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021014	GCG	2	6	605210	605215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_021014	GCC	2	6	605224	605229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_021014	TAT	2	6	606235	606240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021014	AGA	2	6	606249	606254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021014	CAA	2	6	606262	606267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_021014	GA	3	6	606332	606337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021014	T	6	6	606885	606890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021014	ATA	2	6	606903	606908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021014	ATA	2	6	606912	606917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021014	GGAA	2	8	606936	606943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021014	GACA	2	8	607900	607907	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3520	NC_021014	TTGA	2	8	607948	607955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021014	TAA	2	6	607977	607982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021014	ATC	2	6	607984	607989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_021014	T	6	6	608001	608006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021014	GTAA	2	8	608036	608043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021014	AAT	2	6	608078	608083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021014	TAT	3	9	608105	608113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021014	T	6	6	608206	608211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021014	CCG	2	6	608239	608244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_021014	TTTC	2	8	608270	608277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_021014	ATC	2	6	608294	608299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_021014	CTG	2	6	610055	610060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_021014	TGC	2	6	610066	610071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_021014	GGCA	2	8	610075	610082	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_021014	GCT	2	6	610100	610105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021014	A	7	7	610185	610191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021014	GAAAT	2	10	610202	610211	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_021014	TTC	2	6	610230	610235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_021014	GAGAT	2	10	610239	610248	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021014	GAT	2	6	610316	610321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021014	TAT	2	6	610400	610405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021014	AAG	2	6	610490	610495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021014	GGC	2	6	610528	610533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021014	AGA	2	6	610578	610583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021014	A	7	7	610625	610631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021014	T	7	7	610697	610703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_021014	TGC	2	6	610774	610779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_021014	TCT	2	6	610785	610790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021014	AAGCTG	2	12	610841	610852	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3549	NC_021014	ATGA	2	8	610862	610869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_021014	TC	3	6	610904	610909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_021014	GGA	3	9	611041	611049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021014	GAAA	2	8	611095	611102	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021014	GCT	2	6	611209	611214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_021014	AGG	2	6	611239	611244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021014	A	6	6	611248	611253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021014	AGA	2	6	611260	611265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021014	TGGC	2	8	611278	611285	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_021014	CTT	2	6	611300	611305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_021014	GCA	2	6	611329	611334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_021014	CAG	2	6	611351	611356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021014	GCA	2	6	611361	611366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_021014	ACAG	2	8	611370	611377	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_021014	GGA	2	6	611382	611387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021014	AGA	2	6	611388	611393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_021014	GGA	2	6	611478	611483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021014	GAA	2	6	611491	611496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021014	ATA	2	6	611504	611509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021014	TGA	2	6	611526	611531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021014	GAA	3	9	611545	611553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021014	GCT	2	6	611560	611565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021014	AAG	2	6	611570	611575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_021014	CAGA	2	8	611608	611615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_021014	GAA	2	6	611641	611646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_021014	GA	3	6	611711	611716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021014	GCA	2	6	611731	611736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_021014	TAT	2	6	611827	611832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021014	TGA	2	6	611946	611951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021014	GAA	2	6	612024	612029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021014	AGT	2	6	612033	612038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021014	GGA	2	6	612088	612093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021014	CAG	3	9	612221	612229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_021014	GCA	3	9	612334	612342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_021014	ATG	2	6	612568	612573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021014	T	6	6	612609	612614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021014	AAG	2	6	612645	612650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021014	ATG	2	6	613230	613235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021014	TCC	2	6	613318	613323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_021014	AGA	2	6	613344	613349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021014	A	6	6	613508	613513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_021014	GTG	2	6	613572	613577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021014	GAA	2	6	613658	613663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021014	CCTTT	2	10	613693	613702	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3593	NC_021014	GAAAAG	2	12	613715	613726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_021014	GGGC	2	8	613846	613853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_021014	AGT	2	6	613939	613944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021014	A	6	6	613951	613956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_021014	AGG	2	6	613986	613991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021014	A	6	6	614003	614008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021014	CAT	2	6	614083	614088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_021014	A	6	6	614089	614094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021014	AGG	2	6	614103	614108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021014	CTA	2	6	614314	614319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_021014	CAT	2	6	614356	614361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_021014	GCT	2	6	614417	614422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_021014	CAAAA	2	10	614432	614441	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3606	NC_021014	A	6	6	614506	614511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021014	A	6	6	614536	614541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021014	AGG	2	6	614545	614550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021014	TA	3	6	614583	614588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021014	A	6	6	614591	614596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021014	A	6	6	614615	614620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021014	AT	4	8	614625	614632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021014	T	6	6	614650	614655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021014	CT	3	6	614678	614683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_021014	AAT	2	6	616766	616771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021014	GAA	2	6	618069	618074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021014	AGGGA	2	10	618085	618094	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021014	GAGAAA	2	12	618538	618549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021014	GCA	2	6	618556	618561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_021014	GCA	2	6	618568	618573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021014	CAG	2	6	618607	618612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_021014	A	6	6	618613	618618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_021014	A	6	6	618649	618654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_021014	GAT	2	6	618742	618747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021014	TTCT	2	8	618770	618777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3626	NC_021014	ATC	2	6	618802	618807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021014	CGG	2	6	618813	618818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_021014	GAT	2	6	618835	618840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_021014	CGGG	2	8	618848	618855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_021014	TGC	2	6	618914	618919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_021014	TGATC	2	10	619005	619014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3632	NC_021014	GAT	2	6	619033	619038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_021014	TAG	2	6	620740	620745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_021014	ACA	2	6	620863	620868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3635	NC_021014	ATG	2	6	620890	620895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_021014	GAA	2	6	620908	620913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_021014	A	7	7	620964	620970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3638	NC_021014	CGCAG	2	10	620997	621006	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3639	NC_021014	GA	3	6	621153	621158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3640	NC_021014	TCC	2	6	621191	621196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3641	NC_021014	ACC	2	6	621202	621207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3642	NC_021014	GAA	2	6	621208	621213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3649	NC_021014	TCC	2	6	623258	623263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3652	NC_021014	TAA	2	6	623647	623652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3654	NC_021014	GTAT	2	8	623852	623859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3655	NC_021014	ATGC	2	8	623901	623908	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3658	NC_021014	CTG	2	6	624076	624081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3668	NC_021014	CTTC	2	8	624491	624498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3678	NC_021014	GTGAG	2	10	625110	625119	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3685	NC_021014	A	6	6	628983	628988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3698	NC_021014	TACT	2	8	631647	631654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3715	NC_021014	TTGT	2	8	634313	634320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3717	NC_021014	CATGTA	2	12	634399	634410	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3723	NC_021014	TGT	2	6	639517	639522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3726	NC_021014	TA	3	6	640767	640772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3738	NC_021014	AGG	2	6	644231	644236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3742	NC_021014	GAT	2	6	644963	644968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3743	NC_021014	CA	3	6	645088	645093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3744	NC_021014	ACCGG	2	10	645104	645113	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3745	NC_021014	GGA	2	6	645130	645135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3752	NC_021014	TCT	2	6	645583	645588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3753	NC_021014	GGA	2	6	645605	645610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3754	NC_021014	ATG	2	6	645650	645655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3756	NC_021014	A	6	6	648285	648290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3757	NC_021014	CTT	2	6	648318	648323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3761	NC_021014	GA	3	6	648511	648516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3762	NC_021014	CATT	2	8	648616	648623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3763	NC_021014	T	6	6	648622	648627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3764	NC_021014	ACA	2	6	648708	648713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3767	NC_021014	ATT	2	6	648934	648939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3768	NC_021014	AGG	2	6	649042	649047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3769	NC_021014	GAG	2	6	649111	649116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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