MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021014	T	6	6	496576	496581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021014	T	6	6	498251	498256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021014	TAAA	2	8	498260	498267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021014	A	6	6	498325	498330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_021014	T	6	6	498350	498355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021014	TAAA	2	8	498360	498367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021014	ATA	2	6	498402	498407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_021014	TAT	2	6	498414	498419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021014	A	6	6	498422	498427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021014	CT	3	6	498482	498487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_021014	CAG	2	6	498549	498554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_021014	AGA	2	6	498566	498571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021014	GAT	2	6	499027	499032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_021014	T	6	6	499072	499077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021014	ATA	2	6	499110	499115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_021014	A	6	6	499119	499124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021014	GAAA	2	8	499129	499136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021014	ATA	2	6	499162	499167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021014	ATA	2	6	499200	499205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021014	T	6	6	499208	499213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021014	AGG	2	6	499226	499231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_021014	A	6	6	499232	499237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021014	TGCT	2	8	502817	502824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_021014	T	6	6	502873	502878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021014	GA	3	6	502888	502893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_021014	ACG	2	6	504066	504071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3031	NC_021014	A	6	6	504970	504975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_021014	A	6	6	505019	505024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021014	GAA	2	6	505048	505053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_021014	GAAA	2	8	505090	505097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021014	CAG	2	6	505107	505112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_021014	TCT	2	6	505195	505200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_021014	TGA	2	6	505273	505278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021014	GAA	2	6	505313	505318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_021014	CAGA	2	8	505319	505326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3041	NC_021014	TCCAT	2	10	505421	505430	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_021014	A	6	6	505464	505469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021014	GTAT	2	8	505491	505498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021014	A	6	6	505513	505518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021014	GGCA	2	8	505519	505526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_021014	AAAG	2	8	505642	505649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021014	CGG	2	6	510500	510505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_021014	CTT	2	6	510598	510603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_021014	AGTGCC	2	12	510654	510665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3051	NC_021014	CTC	2	6	510784	510789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_021014	AGA	2	6	512063	512068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021014	GAT	2	6	512813	512818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021014	TTC	2	6	512819	512824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_021014	GGA	2	6	512836	512841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3057	NC_021014	GAC	2	6	512870	512875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3059	NC_021014	GAT	2	6	513878	513883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021014	TG	3	6	513899	513904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_021014	CAG	2	6	513945	513950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3063	NC_021014	GGT	2	6	514002	514007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021014	CTG	2	6	514035	514040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_021014	GCA	2	6	514095	514100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_021014	GAC	2	6	514116	514121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_021014	CGTT	2	8	514160	514167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3068	NC_021014	TTATAA	2	12	514173	514184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021014	T	6	6	514843	514848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021014	TAT	2	6	514888	514893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021014	T	6	6	514897	514902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021014	AAAT	2	8	514919	514926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021014	CG	3	6	515012	515017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3077	NC_021014	TAT	2	6	515150	515155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_021014	A	6	6	515166	515171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021014	GAT	2	6	516604	516609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_021014	TTA	2	6	517938	517943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021014	ATT	2	6	518017	518022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021014	ATT	2	6	518049	518054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021014	CAT	2	6	518135	518140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_021014	ATT	2	6	518163	518168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_021014	TAA	2	6	518190	518195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021014	GAT	2	6	518258	518263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021014	ATA	2	6	518280	518285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021014	CAG	2	6	518300	518305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_021014	TTG	2	6	518310	518315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021014	AGG	2	6	518406	518411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3094	NC_021014	AAT	2	6	520623	520628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3096	NC_021014	AGG	2	6	520663	520668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021014	ACA	2	6	521306	521311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_021014	TA	3	6	521316	521321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021014	ACAG	2	8	521344	521351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_021014	AGCA	2	8	521446	521453	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_021014	GGATC	2	10	521461	521470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3102	NC_021014	CCT	2	6	522728	522733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_021014	TAT	2	6	522761	522766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021014	AGG	2	6	522790	522795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_021014	TGC	2	6	523324	523329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_021014	CAG	2	6	523335	523340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_021014	A	6	6	523361	523366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021014	GCG	2	6	523482	523487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_021014	AG	4	8	523500	523507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021014	AGGC	2	8	523536	523543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_021014	GAACA	2	10	523605	523614	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_021014	AG	3	6	523625	523630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021014	CAG	2	6	523631	523636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_021014	GAA	2	6	523706	523711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021014	TGA	2	6	523774	523779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021014	CGG	2	6	523804	523809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021014	A	6	6	523848	523853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021014	GAA	2	6	523892	523897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_021014	CTG	2	6	523908	523913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_021014	ATA	2	6	525003	525008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021014	T	6	6	525040	525045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021014	AGG	2	6	525057	525062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021014	ATCCTG	2	12	525663	525674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_021014	ATA	2	6	525700	525705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021014	A	6	6	525705	525710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_021014	T	6	6	525755	525760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021014	ATA	2	6	526334	526339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021014	GAT	2	6	526437	526442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021014	AGG	2	6	526523	526528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021014	AGG	2	6	527440	527445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021014	AG	3	6	528673	528678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_021014	AAC	2	6	528687	528692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_021014	AGG	2	6	528800	528805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_021014	AGA	2	6	528806	528811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021014	AAAAT	2	10	529460	529469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_021014	N	380	380	530302	530681	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3272	NC_021014	AGC	2	6	562429	562434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3274	NC_021014	TAT	2	6	562674	562679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3275	NC_021014	GAA	2	6	562712	562717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3276	NC_021014	AAGA	2	8	562731	562738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3408	NC_021014	ATC	2	6	582575	582580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3409	NC_021014	ATG	2	6	582602	582607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3410	NC_021014	GCA	2	6	582662	582667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3411	NC_021014	TCA	2	6	582711	582716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3412	NC_021014	CTT	2	6	582815	582820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3413	NC_021014	GAG	2	6	582896	582901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3414	NC_021014	GAG	2	6	582996	583001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3415	NC_021014	CGG	3	9	583003	583011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3416	NC_021014	GGA	2	6	583162	583167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3417	NC_021014	CCAAG	2	10	583173	583182	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3418	NC_021014	CAG	2	6	583197	583202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3419	NC_021014	GGA	2	6	583222	583227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3420	NC_021014	CGG	2	6	583231	583236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3421	NC_021014	TAC	2	6	583722	583727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3422	NC_021014	GTA	2	6	583761	583766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3423	NC_021014	A	6	6	583771	583776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3424	NC_021014	TAA	2	6	583803	583808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3425	NC_021014	AGAA	2	8	583813	583820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3426	NC_021014	GTA	2	6	584615	584620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3428	NC_021014	TG	3	6	584926	584931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3429	NC_021014	TGTA	2	8	584935	584942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3430	NC_021014	AATA	2	8	584944	584951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3431	NC_021014	A	7	7	584973	584979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3432	NC_021014	TAT	2	6	585025	585030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_021014	TGG	2	6	585052	585057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3435	NC_021014	AGG	2	6	586756	586761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_021014	GAA	2	6	586770	586775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3437	NC_021014	AGC	2	6	586848	586853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3438	NC_021014	TCCTG	2	10	586863	586872	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3439	NC_021014	GAA	2	6	586897	586902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3440	NC_021014	GA	3	6	586917	586922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3441	NC_021014	TGA	2	6	587006	587011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3442	NC_021014	ACCG	2	8	587015	587022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3443	NC_021014	TGC	2	6	587081	587086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3445	NC_021014	AAG	2	6	587367	587372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3446	NC_021014	TCC	2	6	587392	587397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3447	NC_021014	TTATG	2	10	587400	587409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3448	NC_021014	T	6	6	587546	587551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3449	NC_021014	TAAA	2	8	590533	590540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3450	NC_021014	A	6	6	590538	590543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3451	NC_021014	AT	4	8	590554	590561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3452	NC_021014	TCC	2	6	590578	590583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3453	NC_021014	GAG	2	6	590586	590591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3454	NC_021014	GCAAGA	2	12	590643	590654	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3455	NC_021014	GA	3	6	590653	590658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3456	NC_021014	ATC	2	6	590706	590711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3462	NC_021014	TCC	2	6	591013	591018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3463	NC_021014	GAA	2	6	591039	591044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3464	NC_021014	GGA	2	6	591077	591082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3472	NC_021014	ATC	2	6	591588	591593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3481	NC_021014	GGA	2	6	594219	594224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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