MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021014	A	7	7	403299	403305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_021014	T	6	6	403332	403337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_021014	A	7	7	403347	403353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_021014	ATA	2	6	403382	403387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_021014	CAT	2	6	403388	403393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_021014	GCT	2	6	405095	405100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_021014	T	6	6	405127	405132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_021014	N	304	304	405159	405462	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_021014	A	6	6	405486	405491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_021014	CAT	2	6	405505	405510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_021014	CAG	2	6	405520	405525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_021014	AGG	2	6	405588	405593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_021014	GAG	2	6	406499	406504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_021014	AAT	2	6	408309	408314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_021014	CCG	2	6	408321	408326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2516	NC_021014	CGG	2	6	408356	408361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_021014	T	6	6	408364	408369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021014	T	7	7	408470	408476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_021014	TCTG	2	8	408559	408566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2520	NC_021014	A	6	6	408699	408704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_021014	GCA	2	6	408719	408724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_021014	AT	3	6	408797	408802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_021014	ACC	2	6	408917	408922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_021014	GCG	2	6	409056	409061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_021014	A	6	6	409139	409144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_021014	T	6	6	409172	409177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_021014	AGA	2	6	409243	409248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_021014	GAT	2	6	409277	409282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_021014	GAA	2	6	409368	409373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_021014	CAG	2	6	409515	409520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_021014	CGT	2	6	409521	409526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_021014	TTG	2	6	409536	409541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_021014	TG	3	6	409561	409566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_021014	TAT	2	6	409587	409592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_021014	TCT	3	9	409598	409606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_021014	ATG	2	6	409609	409614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_021014	CAG	2	6	409679	409684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_021014	AGAA	2	8	409708	409715	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_021014	GAG	2	6	409764	409769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_021014	TACT	2	8	410694	410701	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2541	NC_021014	ATT	2	6	410703	410708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_021014	ACA	2	6	410713	410718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_021014	GGA	2	6	410719	410724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_021014	CAGA	2	8	411387	411394	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2545	NC_021014	GGAG	2	8	411413	411420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_021014	TTATC	2	10	411441	411450	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2547	NC_021014	CTGG	2	8	411480	411487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2548	NC_021014	CGG	2	6	411615	411620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_021014	CTAT	2	8	411646	411653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2550	NC_021014	TGC	2	6	411662	411667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_021014	TTC	2	6	411668	411673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2552	NC_021014	TGC	2	6	411675	411680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_021014	TGG	2	6	411713	411718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_021014	GA	3	6	411752	411757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_021014	GTTT	2	8	411785	411792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_021014	ATG	2	6	411793	411798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_021014	TCT	2	6	411800	411805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2558	NC_021014	AGA	2	6	411831	411836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_021014	GCTG	2	8	411848	411855	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2560	NC_021014	ATCT	2	8	411856	411863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2561	NC_021014	GCG	2	6	411910	411915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_021014	GGGA	2	8	411969	411976	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_021014	TAA	2	6	412005	412010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_021014	TGG	2	6	412082	412087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_021014	TGA	2	6	412112	412117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_021014	GAT	2	6	412140	412145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_021014	GGA	2	6	412147	412152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_021014	CTGC	2	8	412225	412232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2569	NC_021014	T	7	7	412317	412323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_021014	TGC	2	6	412346	412351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_021014	TA	3	6	412361	412366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_021014	TATT	2	8	412374	412381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_021014	CGT	2	6	412477	412482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2575	NC_021014	GGT	2	6	416057	416062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_021014	TGC	2	6	416084	416089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_021014	GGA	2	6	416144	416149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2579	NC_021014	TCT	2	6	416246	416251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_021014	CTT	2	6	416283	416288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_021014	CTA	2	6	416315	416320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2582	NC_021014	AGA	3	9	416345	416353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_021014	GAT	2	6	416528	416533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2585	NC_021014	CTTC	2	8	416591	416598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2586	NC_021014	A	6	6	416681	416686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_021014	GCAC	2	8	416750	416757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_021014	AG	3	6	416802	416807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2591	NC_021014	TAA	2	6	418590	418595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_021014	TAT	2	6	418643	418648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_021014	TAC	2	6	418659	418664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_021014	ATCT	2	8	418718	418725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2595	NC_021014	AGAC	2	8	419291	419298	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2596	NC_021014	TAT	2	6	419456	419461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_021014	TA	3	6	419504	419509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_021014	A	6	6	419511	419516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_021014	AGTAT	2	10	419521	419530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_021014	ATA	2	6	419565	419570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_021014	TAAAA	2	10	419587	419596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_021014	CAGGG	2	10	419650	419659	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2603	NC_021014	CGG	2	6	419673	419678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_021014	TGGA	2	8	419737	419744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021014	AGA	2	6	419745	419750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_021014	ATGA	2	8	419773	419780	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_021014	GTA	2	6	419783	419788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_021014	AAT	2	6	419835	419840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_021014	CATT	2	8	419845	419852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2610	NC_021014	T	6	6	419904	419909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_021014	AAAT	2	8	419931	419938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_021014	CACT	2	8	419943	419950	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2613	NC_021014	AAGA	2	8	420012	420019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_021014	AGG	2	6	421795	421800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2615	NC_021014	AGG	2	6	423043	423048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_021014	TAT	2	6	425395	425400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_021014	TGT	2	6	425452	425457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_021014	AC	3	6	426056	426061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_021014	GGA	2	6	427684	427689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2622	NC_021014	ACG	2	6	427718	427723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2624	NC_021014	GAT	2	6	427786	427791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_021014	GCC	2	6	427821	427826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2626	NC_021014	CTGC	2	8	427851	427858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2627	NC_021014	ATG	2	6	428044	428049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2629	NC_021014	AAAAG	2	10	428115	428124	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_021014	A	6	6	428180	428185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_021014	GGA	2	6	428190	428195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_021014	CTT	2	6	428200	428205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_021014	ATT	2	6	428270	428275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_021014	GGA	2	6	428439	428444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2636	NC_021014	GAGGAA	2	12	428461	428472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2766	NC_021014	TTCAT	2	10	452536	452545	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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