MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_021014	CAGGG	2	10	3390375	3390384	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21002	NC_021014	T	6	6	3390393	3390398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21003	NC_021014	TC	3	6	3394079	3394084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21004	NC_021014	TCC	2	6	3396058	3396063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21005	NC_021014	TA	3	6	3396087	3396092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21006	NC_021014	TA	3	6	3396112	3396117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21007	NC_021014	GTA	2	6	3396133	3396138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_021014	T	6	6	3396167	3396172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21009	NC_021014	GAT	2	6	3397062	3397067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21010	NC_021014	TTC	2	6	3397114	3397119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21011	NC_021014	TTTCA	2	10	3398188	3398197	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21012	NC_021014	CCA	2	6	3398628	3398633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21013	NC_021014	GGT	2	6	3398716	3398721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21014	NC_021014	GCAG	2	8	3398734	3398741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21015	NC_021014	GAG	2	6	3398778	3398783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21016	NC_021014	T	6	6	3398845	3398850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21017	NC_021014	AGG	2	6	3398861	3398866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21018	NC_021014	CATCT	2	10	3399730	3399739	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21019	NC_021014	CTC	2	6	3400793	3400798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21020	NC_021014	N	554	554	3400903	3401456	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21021	NC_021014	ACG	2	6	3401471	3401476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21022	NC_021014	T	6	6	3401508	3401513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21023	NC_021014	CTT	2	6	3402574	3402579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21024	NC_021014	TAAT	3	12	3402595	3402606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21025	NC_021014	A	6	6	3402677	3402682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21026	NC_021014	CTG	2	6	3402687	3402692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21027	NC_021014	A	6	6	3402718	3402723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21028	NC_021014	AAC	2	6	3402738	3402743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21029	NC_021014	GA	3	6	3402812	3402817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21030	NC_021014	A	6	6	3403886	3403891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21031	NC_021014	ATTC	2	8	3403895	3403902	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21032	NC_021014	ACC	2	6	3403995	3404000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21033	NC_021014	TAT	2	6	3404169	3404174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21034	NC_021014	AAG	2	6	3404184	3404189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21035	NC_021014	ATT	2	6	3404213	3404218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21036	NC_021014	AAAGG	2	10	3404227	3404236	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21037	NC_021014	GGATA	2	10	3404312	3404321	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21038	NC_021014	CGG	2	6	3404337	3404342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21039	NC_021014	CTT	2	6	3404369	3404374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21040	NC_021014	ATT	2	6	3404381	3404386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21041	NC_021014	AAATC	2	10	3404419	3404428	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21042	NC_021014	AT	3	6	3404447	3404452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21043	NC_021014	AGG	2	6	3404500	3404505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21044	NC_021014	TTA	2	6	3404506	3404511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21045	NC_021014	ATT	2	6	3404587	3404592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21046	NC_021014	ATT	2	6	3404619	3404624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21047	NC_021014	CAT	2	6	3404705	3404710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21048	NC_021014	ATT	2	6	3404733	3404738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21049	NC_021014	TAA	2	6	3404760	3404765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_021014	GAT	2	6	3404828	3404833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21051	NC_021014	TCT	2	6	3404866	3404871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21052	NC_021014	GAT	2	6	3404893	3404898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21053	NC_021014	AATT	2	8	3404917	3404924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21054	NC_021014	A	6	6	3404930	3404935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21055	NC_021014	GTT	3	9	3404984	3404992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21056	NC_021014	TA	3	6	3404994	3404999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21057	NC_021014	AT	3	6	3405037	3405042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21058	NC_021014	CGCTT	2	10	3405043	3405052	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21059	NC_021014	TGAGAT	2	12	3405061	3405072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21060	NC_021014	ATA	2	6	3405078	3405083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21061	NC_021014	CAG	2	6	3405098	3405103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21062	NC_021014	TTG	2	6	3405108	3405113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21063	NC_021014	GAT	2	6	3405127	3405132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21064	NC_021014	ATA	2	6	3405250	3405255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21065	NC_021014	N	561	561	3405256	3405816	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21066	NC_021014	CCT	2	6	3407093	3407098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21067	NC_021014	AGG	2	6	3407123	3407128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21068	NC_021014	AGG	2	6	3408500	3408505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21069	NC_021014	CTG	2	6	3408986	3408991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21070	NC_021014	TGA	2	6	3409091	3409096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21071	NC_021014	TCTGAT	2	12	3411310	3411321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21072	NC_021014	T	6	6	3411338	3411343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21073	NC_021014	ATC	2	6	3411358	3411363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21074	NC_021014	AT	3	6	3411383	3411388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21075	NC_021014	TATT	2	8	3411394	3411401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21076	NC_021014	CAGT	2	8	3411438	3411445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21077	NC_021014	GCA	2	6	3411526	3411531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21078	NC_021014	AGG	2	6	3411537	3411542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21079	NC_021014	T	6	6	3411543	3411548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21080	NC_021014	ACTT	2	8	3412499	3412506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21081	NC_021014	AGC	2	6	3412550	3412555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21082	NC_021014	A	7	7	3412558	3412564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21083	NC_021014	TATT	2	8	3412614	3412621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21084	NC_021014	ACTT	2	8	3412652	3412659	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21085	NC_021014	TAT	2	6	3412728	3412733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21086	NC_021014	TAA	3	9	3412803	3412811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21087	NC_021014	TCA	2	6	3412836	3412841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21088	NC_021014	AAC	2	6	3412864	3412869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21089	NC_021014	ATC	2	6	3412882	3412887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21090	NC_021014	TTC	2	6	3413010	3413015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21091	NC_021014	CTTTT	2	10	3413023	3413032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21092	NC_021014	TCC	2	6	3413051	3413056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21093	NC_021014	AAT	2	6	3413070	3413075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21094	NC_021014	GCT	3	9	3413105	3413113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21095	NC_021014	TCA	2	6	3413133	3413138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21096	NC_021014	CCT	2	6	3413190	3413195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21097	NC_021014	CGTC	2	8	3413234	3413241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21098	NC_021014	TCC	2	6	3413300	3413305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21099	NC_021014	CTA	2	6	3413394	3413399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21100	NC_021014	CTT	2	6	3413440	3413445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21101	NC_021014	GCA	2	6	3413450	3413455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21102	NC_021014	ACA	2	6	3413459	3413464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21103	NC_021014	GCG	2	6	3413504	3413509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21104	NC_021014	GCA	2	6	3413514	3413519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21105	NC_021014	TCC	2	6	3413522	3413527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21106	NC_021014	TTG	2	6	3413534	3413539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21107	NC_021014	GC	3	6	3413718	3413723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21108	NC_021014	CCA	2	6	3413733	3413738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21109	NC_021014	TGG	2	6	3413757	3413762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21110	NC_021014	TCC	2	6	3413794	3413799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21111	NC_021014	AGA	2	6	3413851	3413856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21112	NC_021014	CTC	2	6	3413872	3413877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21113	NC_021014	ACC	2	6	3413911	3413916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21114	NC_021014	CTT	2	6	3413946	3413951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21115	NC_021014	ACA	3	9	3414089	3414097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21116	NC_021014	CT	4	8	3414145	3414152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21117	NC_021014	TC	3	6	3414234	3414239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21118	NC_021014	GAA	2	6	3414345	3414350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21119	NC_021014	AT	3	6	3414371	3414376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21120	NC_021014	TGT	2	6	3414391	3414396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21121	NC_021014	CTT	2	6	3414431	3414436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21122	NC_021014	GCA	2	6	3414507	3414512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21123	NC_021014	CTG	2	6	3414575	3414580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21124	NC_021014	TC	3	6	3414610	3414615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21125	NC_021014	ATA	2	6	3414655	3414660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21126	NC_021014	CTGC	2	8	3414672	3414679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21127	NC_021014	TCC	2	6	3415096	3415101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21128	NC_021014	AT	3	6	3415104	3415109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21129	NC_021014	ATTTTT	2	12	3415111	3415122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21130	NC_021014	ATT	2	6	3415167	3415172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21131	NC_021014	A	7	7	3415186	3415192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21132	NC_021014	TG	3	6	3415205	3415210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21133	NC_021014	ATCT	2	8	3415277	3415284	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21134	NC_021014	CTT	2	6	3415307	3415312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21137	NC_021014	CTTTT	2	10	3415828	3415837	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21138	NC_021014	T	6	6	3415891	3415896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21152	NC_021014	TTCA	2	8	3421514	3421521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21153	NC_021014	A	7	7	3421528	3421534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21154	NC_021014	ACTT	2	8	3421539	3421546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21164	NC_021014	TTTC	2	8	3422917	3422924	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21391	NC_021014	TC	3	6	3455137	3455142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21392	NC_021014	T	6	6	3455263	3455268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21393	NC_021014	CAT	2	6	3455293	3455298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21423	NC_021014	GAT	2	6	3463663	3463668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21424	NC_021014	GAA	2	6	3463748	3463753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21458	NC_021014	TTTC	2	8	3471321	3471328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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21463	NC_021014	GA	3	6	3471745	3471750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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21469	NC_021014	ATTT	2	8	3472067	3472074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21486	NC_021014	ATA	2	6	3472536	3472541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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