MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021014	GAA	2	6	245837	245842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_021014	AGG	2	6	245881	245886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021014	TGG	2	6	247269	247274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021014	CGGA	2	8	247301	247308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_021014	AAC	2	6	247347	247352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_021014	ACAG	2	8	247519	247526	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_021014	CCT	2	6	247561	247566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_021014	CGG	2	6	247650	247655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_021014	A	6	6	247782	247787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021014	TAC	2	6	247824	247829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_021014	GAA	2	6	247896	247901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021014	AAG	2	6	248037	248042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021014	CCG	2	6	248071	248076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_021014	CT	3	6	248140	248145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_021014	GGA	2	6	248333	248338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021014	GTAGCT	2	12	248403	248414	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1517	NC_021014	CTG	2	6	248439	248444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_021014	CCG	2	6	248507	248512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_021014	GAT	2	6	248616	248621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021014	GA	3	6	248654	248659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021014	AGA	2	6	252173	252178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021014	GAAA	2	8	252216	252223	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_021014	A	6	6	252221	252226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021014	GCTG	2	8	252228	252235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1525	NC_021014	GC	3	6	252250	252255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_021014	TTA	2	6	252266	252271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021014	CGG	2	6	252278	252283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_021014	GCC	2	6	252299	252304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_021014	TCAA	2	8	252572	252579	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_021014	TTG	2	6	252584	252589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021014	TTTC	2	8	252659	252666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_021014	T	6	6	252672	252677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021014	ATA	2	6	252713	252718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021014	GA	3	6	252776	252781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_021014	ATA	2	6	252788	252793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021014	TTA	2	6	252805	252810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_021014	AT	3	6	252822	252827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_021014	GCAGG	2	10	252847	252856	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1539	NC_021014	GAT	2	6	253256	253261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021014	T	6	6	253301	253306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021014	T	6	6	256790	256795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021014	GAG	2	6	256801	256806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_021014	TGG	2	6	258787	258792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021014	GA	3	6	258811	258816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021014	AAT	2	6	258857	258862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021014	ATT	2	6	258869	258874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021014	TGAC	2	8	258884	258891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_021014	AGG	2	6	258937	258942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021014	TAT	2	6	258961	258966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021014	AGGA	2	8	258982	258989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021014	T	6	6	259090	259095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021014	GAA	2	6	259154	259159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021014	A	6	6	259399	259404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021014	ATAC	2	8	259466	259473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_021014	AGC	2	6	259492	259497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021014	ATT	2	6	260691	260696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021014	ACA	2	6	260741	260746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_021014	ATT	2	6	260749	260754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021014	GAC	2	6	260826	260831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_021014	TGA	2	6	260841	260846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021014	ATT	2	6	260859	260864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021014	A	6	6	262844	262849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021014	TGG	2	6	262934	262939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021014	TTG	2	6	262944	262949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021014	TCA	2	6	263043	263048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_021014	AT	3	6	263116	263121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_021014	AGGC	2	8	263151	263158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_021014	AAAAT	2	10	263164	263173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021014	T	6	6	263188	263193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021014	AT	4	8	263235	263242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021014	GGA	2	6	263247	263252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021014	GGA	2	6	264073	264078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021014	CAG	2	6	266196	266201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_021014	TG	3	6	266301	266306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021014	CAGG	2	8	266323	266330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_021014	GAA	2	6	266354	266359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_021014	AGA	2	6	266405	266410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_021014	AGA	2	6	266451	266456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_021014	A	6	6	266503	266508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_021014	ATG	2	6	266603	266608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_021014	N	285	285	266669	266953	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_021014	T	6	6	266980	266985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021014	CAG	2	6	267023	267028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_021014	AGG	2	6	267042	267047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021014	AGGAA	2	10	269456	269465	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021014	T	6	6	269502	269507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021014	AAG	2	6	269527	269532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021014	GTACCA	2	12	270682	270693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_021014	CAAAA	2	10	270711	270720	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1590	NC_021014	T	7	7	270752	270758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_021014	TTC	2	6	270860	270865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_021014	GTG	2	6	270905	270910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_021014	AGG	2	6	271002	271007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_021014	ACAGA	2	10	273607	273616	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1595	NC_021014	AGA	2	6	273644	273649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_021014	TGG	2	6	273665	273670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_021014	TCT	2	6	273691	273696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_021014	GAA	2	6	273734	273739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021014	AGA	2	6	273753	273758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021014	AGT	2	6	273886	273891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_021014	GAAA	2	8	273981	273988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021014	TGG	2	6	274038	274043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021014	AAACAG	2	12	274057	274068	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1604	NC_021014	GAA	2	6	274207	274212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_021014	AAAAAG	2	12	274216	274227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021014	AAGCA	2	10	274229	274238	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1607	NC_021014	AGA	2	6	274292	274297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021014	A	6	6	274340	274345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021014	TGT	2	6	274350	274355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_021014	A	6	6	274357	274362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_021014	GCA	2	6	274381	274386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_021014	GCG	2	6	274423	274428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_021014	AGA	2	6	274449	274454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021014	GCG	2	6	274457	274462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_021014	AAG	2	6	274524	274529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021014	GGC	2	6	274563	274568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_021014	AGA	2	6	274583	274588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_021014	A	6	6	274594	274599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_021014	AGCGA	2	10	274638	274647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1620	NC_021014	ACAG	2	8	274653	274660	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1621	NC_021014	GATT	2	8	274683	274690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021014	AAG	2	6	274696	274701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021014	GGC	2	6	274705	274710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_021014	T	6	6	274723	274728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021014	GTA	2	6	274756	274761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021014	AC	3	6	274898	274903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_021014	CAA	2	6	274932	274937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_021014	GAA	2	6	274948	274953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021014	GATAT	2	10	274973	274982	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021014	TCTG	2	8	275022	275029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_021014	GAA	2	6	275038	275043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_021014	TTGCA	2	10	275084	275093	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1633	NC_021014	AGT	2	6	275172	275177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021014	TGT	2	6	275206	275211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021014	GGA	2	6	275224	275229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021014	AT	3	6	275334	275339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_021014	AGA	2	6	275343	275348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_021014	TAT	2	6	275389	275394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_021014	GCA	2	6	275407	275412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1640	NC_021014	GAT	2	6	275452	275457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1644	NC_021014	AGAA	2	8	275570	275577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1645	NC_021014	TAT	2	6	275665	275670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1646	NC_021014	AGC	2	6	275860	275865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1651	NC_021014	TG	3	6	276102	276107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1659	NC_021014	AGA	2	6	278410	278415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1664	NC_021014	TTG	2	6	278590	278595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1668	NC_021014	GAAAT	2	10	278665	278674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1672	NC_021014	A	7	7	279865	279871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1681	NC_021014	GAAG	2	8	283852	283859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1731	NC_021014	AGT	2	6	291620	291625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1757	NC_021014	GCA	2	6	294919	294924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1758	NC_021014	AG	3	6	294951	294956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1759	NC_021014	AGAA	2	8	294971	294978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1761	NC_021014	ATT	2	6	295025	295030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1762	NC_021014	GAA	2	6	295051	295056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1763	NC_021014	TGG	2	6	295070	295075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1767	NC_021014	ATA	2	6	298541	298546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1768	NC_021014	A	6	6	298593	298598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1769	NC_021014	T	7	7	298604	298610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1770	NC_021014	AC	3	6	298643	298648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1771	NC_021014	T	7	7	298985	298991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1952	NC_021014	ATT	3	9	319987	319995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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