MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021014	CAT	2	6	1009956	1009961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_021014	AT	3	6	1009960	1009965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021014	TC	3	6	1010700	1010705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_021014	T	6	6	1010776	1010781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021014	T	6	6	1010784	1010789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021014	C	6	6	1010851	1010856	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6007	NC_021014	CTG	2	6	1010866	1010871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_021014	AT	3	6	1010882	1010887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_021014	TAA	2	6	1012159	1012164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021014	CACTA	2	10	1013224	1013233	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6011	NC_021014	TAT	2	6	1013238	1013243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_021014	CTTTT	2	10	1013255	1013264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_021014	T	6	6	1013302	1013307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_021014	T	6	6	1013351	1013356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_021014	GCA	2	6	1013476	1013481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_021014	T	6	6	1013564	1013569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_021014	AAC	2	6	1014906	1014911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_021014	ATA	2	6	1016101	1016106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021014	ATTT	2	8	1016172	1016179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_021014	A	7	7	1016215	1016221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_021014	AGC	2	6	1016240	1016245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_021014	TTC	2	6	1016281	1016286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_021014	ATT	2	6	1016287	1016292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_021014	ATC	2	6	1017092	1017097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_021014	TCC	2	6	1017099	1017104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_021014	TTC	3	9	1017119	1017127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_021014	AAC	2	6	1017174	1017179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_021014	TCC	2	6	1017297	1017302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_021014	AGA	2	6	1017400	1017405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_021014	GGA	2	6	1017474	1017479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_021014	ATT	2	6	1017498	1017503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_021014	AGAA	2	8	1017541	1017548	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021014	TCA	2	6	1017638	1017643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_021014	GTC	2	6	1017658	1017663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_021014	AAT	2	6	1017732	1017737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_021014	CTG	2	6	1017806	1017811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_021014	AGC	2	6	1017887	1017892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_021014	TCC	2	6	1018027	1018032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_021014	ATTT	2	8	1018039	1018046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_021014	ATTT	2	8	1018075	1018082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021014	TCA	2	6	1018093	1018098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_021014	TG	3	6	1018129	1018134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_021014	AG	3	6	1018136	1018141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_021014	CTT	2	6	1018152	1018157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_021014	TATC	2	8	1018259	1018266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_021014	CTG	2	6	1018415	1018420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_021014	ATG	2	6	1018423	1018428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_021014	CTG	2	6	1018481	1018486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_021014	TGT	2	6	1018575	1018580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021014	GGA	2	6	1018581	1018586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_021014	CAT	2	6	1018598	1018603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_021014	AGA	2	6	1018606	1018611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021014	TCT	2	6	1018616	1018621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_021014	AGA	2	6	1018659	1018664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021014	AAC	2	6	1018761	1018766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_021014	ACCA	2	8	1018824	1018831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_021014	CTC	2	6	1018944	1018949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_021014	TGT	2	6	1018964	1018969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021014	CAT	2	6	1018991	1018996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_021014	TCC	2	6	1019026	1019031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_021014	TCA	3	9	1019048	1019056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_021014	GTT	2	6	1019059	1019064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_021014	GCT	2	6	1019065	1019070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_021014	CTG	2	6	1019072	1019077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_021014	T	6	6	1019093	1019098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021014	CTT	2	6	1019115	1019120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_021014	AAC	2	6	1019170	1019175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_021014	TAA	2	6	1019245	1019250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_021014	TAT	2	6	1019259	1019264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_021014	CTC	2	6	1019318	1019323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6071	NC_021014	GGTTC	2	10	1019334	1019343	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6072	NC_021014	GCC	2	6	1019378	1019383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_021014	CCA	2	6	1019422	1019427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_021014	CT	3	6	1019434	1019439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6075	NC_021014	GTTT	2	8	1019478	1019485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_021014	T	6	6	1019483	1019488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_021014	TGA	2	6	1020921	1020926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_021014	GCT	2	6	1020969	1020974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_021014	T	6	6	1021253	1021258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_021014	TCT	2	6	1022727	1022732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_021014	TCT	2	6	1022760	1022765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_021014	GCA	2	6	1022800	1022805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_021014	T	6	6	1022828	1022833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021014	TGA	2	6	1022866	1022871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_021014	CTG	2	6	1022875	1022880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_021014	TTC	2	6	1023169	1023174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_021014	TCC	2	6	1023240	1023245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_021014	TCA	2	6	1023273	1023278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_021014	AAT	2	6	1023316	1023321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_021014	CTC	2	6	1023344	1023349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_021014	CTG	2	6	1023423	1023428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_021014	TCT	2	6	1023480	1023485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_021014	CCG	2	6	1023598	1023603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_021014	TCT	2	6	1023625	1023630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_021014	CTC	2	6	1023698	1023703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_021014	T	6	6	1023724	1023729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021014	TCA	2	6	1023846	1023851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_021014	AAG	2	6	1023887	1023892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_021014	AAG	2	6	1023992	1023997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_021014	CAT	2	6	1024016	1024021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_021014	TCA	2	6	1024047	1024052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_021014	AGA	2	6	1024080	1024085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_021014	GCA	2	6	1024089	1024094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_021014	CTT	2	6	1024112	1024117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_021014	ATC	2	6	1024121	1024126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_021014	TCC	2	6	1024229	1024234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_021014	GCT	2	6	1024335	1024340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_021014	A	6	6	1024382	1024387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_021014	GGA	2	6	1024400	1024405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021014	CTG	2	6	1024408	1024413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_021014	GA	3	6	1024592	1024597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_021014	TTA	2	6	1024608	1024613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_021014	TC	3	6	1024687	1024692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_021014	GCG	3	9	1024759	1024767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_021014	GAA	2	6	1024873	1024878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_021014	CTT	2	6	1024926	1024931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_021014	AAG	2	6	1024946	1024951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_021014	ATC	2	6	1024952	1024957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_021014	ATG	2	6	1024980	1024985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_021014	CTC	2	6	1025039	1025044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6121	NC_021014	TCC	2	6	1025145	1025150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_021014	ATA	2	6	1025163	1025168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_021014	T	6	6	1025275	1025280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_021014	AGG	2	6	1025853	1025858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_021014	GGA	2	6	1026809	1026814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_021014	GCT	2	6	1026817	1026822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_021014	TTA	2	6	1026848	1026853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_021014	A	6	6	1026853	1026858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_021014	CAA	2	6	1026877	1026882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_021014	T	6	6	1026899	1026904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_021014	TCCC	2	8	1026986	1026993	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6132	NC_021014	TCC	2	6	1028876	1028881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6133	NC_021014	GTA	2	6	1028937	1028942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_021014	T	6	6	1028954	1028959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6135	NC_021014	ATA	2	6	1029023	1029028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_021014	A	6	6	1029040	1029045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_021014	TAT	2	6	1029072	1029077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_021014	TAT	2	6	1029212	1029217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6139	NC_021014	A	6	6	1029226	1029231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_021014	TGCC	2	8	1030376	1030383	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6143	NC_021014	TACC	2	8	1030665	1030672	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6144	NC_021014	CAT	2	6	1030702	1030707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6153	NC_021014	CAT	2	6	1031224	1031229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6155	NC_021014	CTT	2	6	1031286	1031291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6156	NC_021014	ACC	2	6	1031368	1031373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6157	NC_021014	TGA	2	6	1031382	1031387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6161	NC_021014	TG	3	6	1031693	1031698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6162	NC_021014	TCA	2	6	1031702	1031707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6163	NC_021014	TGA	2	6	1031712	1031717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6164	NC_021014	GT	3	6	1031757	1031762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6165	NC_021014	GAA	2	6	1031768	1031773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6166	NC_021014	CAT	2	6	1031812	1031817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6177	NC_021014	ATA	2	6	1033547	1033552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6179	NC_021014	CAGA	2	8	1035126	1035133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6187	NC_021014	CTTTT	2	10	1035527	1035536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6192	NC_021014	AGTC	2	8	1035667	1035674	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6228	NC_021014	ATCC	2	8	1045562	1045569	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6229	NC_021014	T	6	6	1045588	1045593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6231	NC_021014	ATT	2	6	1046846	1046851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6233	NC_021014	TAA	2	6	1047002	1047007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6235	NC_021014	TA	3	6	1047919	1047924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6236	NC_021014	TATTT	2	10	1047972	1047981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6241	NC_021014	AAT	2	6	1048327	1048332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_021014	TAT	2	6	1048336	1048341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_021014	CTT	2	6	1048392	1048397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6244	NC_021014	T	6	6	1048449	1048454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6245	NC_021014	ATA	2	6	1048706	1048711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6246	NC_021014	ATA	2	6	1048724	1048729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_021014	GTA	3	9	1048781	1048789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_021014	TCT	2	6	1048822	1048827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6249	NC_021014	GTA	2	6	1048839	1048844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_021014	TGC	2	6	1048847	1048852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_021014	A	6	6	1048895	1048900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_021014	A	6	6	1048917	1048922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_021014	CATA	2	8	1048938	1048945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6254	NC_021014	TAG	2	6	1049015	1049020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_021014	TCA	2	6	1049042	1049047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6256	NC_021014	TGC	3	9	1049080	1049088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6257	NC_021014	CTG	3	9	1049091	1049099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_021014	GCT	2	6	1049165	1049170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6259	NC_021014	CCG	2	6	1049199	1049204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6260	NC_021014	CTGC	2	8	1049205	1049212	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6261	NC_021014	CTG	2	6	1049217	1049222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_021014	T	6	6	1049260	1049265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_021014	GCT	2	6	1049273	1049278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6264	NC_021014	TCTGC	2	10	1049280	1049289	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6265	NC_021014	GAAGT	2	10	1049318	1049327	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6266	NC_021014	ATGT	2	8	1049328	1049335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6302	NC_021014	A	6	6	1062291	1062296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6395	NC_021014	CTG	2	6	1081311	1081316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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