MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus sp. SR1/5 draft genome

Total Repeats: 21901

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021014	AGT	2	6	830773	830778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_021014	TAA	2	6	830824	830829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_021014	ATTT	2	8	830848	830855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_021014	AGGA	2	8	831106	831113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_021014	GAA	2	6	831139	831144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_021014	CTT	2	6	831213	831218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_021014	AGT	2	6	831292	831297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_021014	AT	3	6	831313	831318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_021014	TTCC	2	8	831338	831345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_021014	A	7	7	831425	831431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_021014	AGGA	2	8	831450	831457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_021014	AGA	2	6	833248	833253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_021014	GAA	2	6	833258	833263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_021014	GAT	2	6	833284	833289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_021014	AAG	2	6	833306	833311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_021014	GGA	2	6	833325	833330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_021014	TGCTCT	2	12	833338	833349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_021014	GGAA	2	8	833402	833409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_021014	T	6	6	833456	833461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_021014	ATG	2	6	833462	833467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_021014	AGGG	2	8	833536	833543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_021014	CTT	2	6	833548	833553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_021014	GCT	2	6	833579	833584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_021014	GT	3	6	833601	833606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_021014	GAGGC	2	10	833613	833622	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5026	NC_021014	TTG	2	6	833631	833636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_021014	ATG	2	6	833648	833653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_021014	CAT	2	6	833713	833718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_021014	CGG	2	6	833815	833820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_021014	TGCA	2	8	833916	833923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_021014	CTT	2	6	833963	833968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_021014	A	6	6	833990	833995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_021014	TGA	2	6	834057	834062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_021014	GAAA	2	8	834069	834076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_021014	GAAA	2	8	834145	834152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_021014	A	6	6	834167	834172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_021014	CAGG	2	8	834292	834299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5038	NC_021014	A	6	6	834315	834320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_021014	GAT	2	6	834339	834344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_021014	ACAG	2	8	834378	834385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_021014	GGC	2	6	834461	834466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_021014	CTT	2	6	834682	834687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_021014	AGA	2	6	834732	834737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_021014	A	6	6	834796	834801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_021014	GTTA	2	8	834822	834829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_021014	GCT	2	6	834898	834903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_021014	TGGG	2	8	834944	834951	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021014	GAT	2	6	835327	835332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021014	GAA	2	6	835399	835404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021014	GAT	2	6	835459	835464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021014	TAA	2	6	835548	835553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021014	TGA	2	6	835598	835603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_021014	GA	3	6	835646	835651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_021014	TGG	2	6	835688	835693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_021014	T	7	7	835725	835731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_021014	AGC	2	6	836745	836750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_021014	A	7	7	841505	841511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_021014	TAT	2	6	841542	841547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_021014	CTG	2	6	841567	841572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_021014	AGG	2	6	841575	841580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_021014	GCA	2	6	841624	841629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_021014	ACCG	2	8	841686	841693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_021014	AACC	2	8	841739	841746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_021014	CTG	2	6	841763	841768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_021014	CTG	2	6	841799	841804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_021014	AACC	2	8	841811	841818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5067	NC_021014	ACCG	2	8	841884	841891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_021014	AGC	2	6	841909	841914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_021014	TA	4	8	841934	841941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_021014	CTGG	2	8	842052	842059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5071	NC_021014	GAA	3	9	842065	842073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_021014	AAAG	2	8	842143	842150	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_021014	ATT	2	6	842255	842260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_021014	CAGAC	2	10	842279	842288	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5075	NC_021014	CCG	2	6	842290	842295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_021014	A	7	7	842302	842308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_021014	CAG	2	6	842316	842321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_021014	AGT	2	6	842343	842348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_021014	AG	3	6	842437	842442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_021014	GTG	2	6	842509	842514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_021014	CAG	2	6	842535	842540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_021014	AGAA	2	8	842569	842576	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_021014	AAC	2	6	842578	842583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_021014	TGG	2	6	842643	842648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_021014	AAT	2	6	842683	842688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_021014	GAA	2	6	842767	842772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_021014	A	7	7	842812	842818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_021014	AAAG	2	8	842844	842851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_021014	A	6	6	842857	842862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021014	AGA	2	6	842886	842891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021014	AGA	2	6	842897	842902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021014	AG	3	6	842937	842942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_021014	TCC	2	6	842967	842972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5094	NC_021014	GAA	2	6	842979	842984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_021014	TCA	2	6	846894	846899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_021014	TTC	2	6	846934	846939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_021014	GAAA	2	8	846984	846991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_021014	A	6	6	847033	847038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_021014	AGT	2	6	847044	847049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_021014	TAAA	2	8	847053	847060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_021014	T	7	7	847113	847119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_021014	TA	3	6	847125	847130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_021014	AAT	2	6	847155	847160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_021014	GAT	2	6	847199	847204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_021014	ATT	2	6	847555	847560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_021014	T	6	6	847579	847584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_021014	ATC	2	6	848132	848137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_021014	TGG	2	6	848142	848147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_021014	ATG	2	6	848162	848167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_021014	A	6	6	848190	848195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_021014	ATT	2	6	848216	848221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_021014	GAA	2	6	848232	848237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_021014	GAG	2	6	848245	848250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_021014	GAAA	2	8	848837	848844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_021014	TAA	2	6	849881	849886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_021014	CAA	2	6	849888	849893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_021014	AAT	2	6	850657	850662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_021014	AAGT	2	8	850751	850758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_021014	T	6	6	850831	850836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_021014	GTT	2	6	850878	850883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021014	TAA	2	6	850890	850895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021014	TAA	2	6	850953	850958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021014	A	6	6	851041	851046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021014	A	7	7	851058	851064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021014	A	6	6	851103	851108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_021014	A	6	6	851149	851154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_021014	TG	3	6	851208	851213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_021014	AGC	2	6	851223	851228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_021014	A	8	8	851240	851247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_021014	CATA	2	8	851264	851271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5131	NC_021014	ATT	2	6	851736	851741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_021014	TAT	2	6	851751	851756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_021014	ATA	2	6	851765	851770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_021014	A	6	6	851788	851793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_021014	A	6	6	851827	851832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_021014	ACA	2	6	851874	851879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_021014	AGG	2	6	851895	851900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_021014	TAC	2	6	852266	852271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5140	NC_021014	T	6	6	852303	852308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5154	NC_021014	AAAT	2	8	854367	854374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5166	NC_021014	AAG	2	6	856687	856692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5185	NC_021014	TGG	2	6	859613	859618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5252	NC_021014	TAT	3	9	871107	871115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_021014	AG	3	6	871140	871145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_021014	ATA	2	6	871204	871209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_021014	AT	3	6	871217	871222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5258	NC_021014	TTG	2	6	871334	871339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_021014	AT	3	6	871349	871354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_021014	ATT	2	6	871374	871379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5261	NC_021014	AGA	2	6	871487	871492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5262	NC_021014	T	6	6	871504	871509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5263	NC_021014	A	6	6	871539	871544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_021014	GGA	2	6	871552	871557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_021014	AAT	2	6	871565	871570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_021014	A	6	6	871595	871600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5267	NC_021014	GGT	2	6	872066	872071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5270	NC_021014	TGA	2	6	874616	874621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_021014	TCT	2	6	874691	874696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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