MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 12706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021013	TTC	2	6	624093	624098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_021013	ACT	2	6	624117	624122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_021013	A	6	6	624131	624136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021013	CGAAA	2	10	624141	624150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3505	NC_021013	A	7	7	624148	624154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021013	T	6	6	624170	624175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021013	CCA	2	6	624250	624255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_021013	AT	3	6	624265	624270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021013	CCG	2	6	624304	624309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_021013	ACC	2	6	624336	624341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_021013	TAT	2	6	624469	624474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_021013	T	7	7	624502	624508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021013	T	6	6	624512	624517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021013	A	6	6	624519	624524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021013	CTTTT	2	10	625579	625588	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3516	NC_021013	ATT	2	6	627097	627102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021013	TAC	2	6	627109	627114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_021013	T	7	7	627182	627188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021013	A	6	6	627193	627198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021013	GTATT	2	10	627250	627259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021013	TTA	2	6	627306	627311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_021013	CAT	2	6	628194	628199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_021013	AAC	2	6	628200	628205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021013	TTA	2	6	628252	628257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021013	T	6	6	628362	628367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021013	ACAA	2	8	628441	628448	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3527	NC_021013	AC	3	6	628555	628560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_021013	ATA	2	6	628593	628598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021013	AAT	2	6	628620	628625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_021013	TAA	2	6	628644	628649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021013	T	7	7	628652	628658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021013	GTTT	2	8	630475	630482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021013	TTC	2	6	630497	630502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_021013	GAA	2	6	630523	630528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_021013	CTTG	2	8	630535	630542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_021013	CTTC	2	8	630637	630644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_021013	T	6	6	630656	630661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021013	T	6	6	630670	630675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021013	CAA	2	6	630703	630708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_021013	TTC	2	6	630734	630739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_021013	AAG	2	6	630824	630829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021013	CCGA	2	8	630864	630871	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_021013	CTT	2	6	630880	630885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_021013	TCA	2	6	630903	630908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_021013	TCGGTA	2	12	630993	631004	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3546	NC_021013	TAT	2	6	631013	631018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021013	TCT	2	6	631061	631066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_021013	CAA	2	6	631075	631080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_021013	CCG	2	6	631089	631094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_021013	CT	3	6	631146	631151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_021013	TCA	2	6	631173	631178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_021013	CGGTT	2	10	631200	631209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3553	NC_021013	ACC	2	6	631295	631300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3554	NC_021013	T	7	7	631304	631310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021013	CT	3	6	631322	631327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_021013	GTA	2	6	631389	631394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_021013	AAC	2	6	631446	631451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_021013	GAA	2	6	631473	631478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021013	T	6	6	631479	631484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021013	CTA	2	6	631493	631498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_021013	TGT	2	6	631501	631506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021013	GTC	2	6	631517	631522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_021013	TTCAAT	2	12	631548	631559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3564	NC_021013	TTC	2	6	631583	631588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021013	ATA	2	6	631626	631631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021013	GGA	2	6	631702	631707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021013	GAT	2	6	631713	631718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_021013	ATA	2	6	631728	631733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021013	CT	3	6	631770	631775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_021013	GAA	2	6	631829	631834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_021013	CAA	2	6	631889	631894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_021013	AACTT	2	10	631912	631921	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3573	NC_021013	CAA	2	6	631973	631978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_021013	TTTC	2	8	631986	631993	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_021013	ATT	2	6	632071	632076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_021013	T	6	6	632177	632182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_021013	T	7	7	632198	632204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021013	ATT	2	6	632250	632255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021013	AC	3	6	632365	632370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_021013	AAAAC	2	10	632441	632450	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3582	NC_021013	T	6	6	632566	632571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_021013	T	6	6	632636	632641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021013	TTG	2	6	632688	632693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021013	AATT	2	8	632770	632777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021013	CGA	2	6	632785	632790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3588	NC_021013	ATT	2	6	632826	632831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021013	CTC	2	6	632927	632932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_021013	GAA	2	6	632944	632949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021013	TTG	2	6	632968	632973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_021013	TCGCT	2	10	633072	633081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3594	NC_021013	GGC	2	6	633181	633186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_021013	TGAT	2	8	633262	633269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021013	GA	3	6	633273	633278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3598	NC_021013	TAT	2	6	633434	633439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021013	GTT	2	6	633460	633465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021013	T	6	6	633483	633488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_021013	AAG	2	6	633489	633494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021013	A	6	6	633520	633525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021013	A	6	6	637516	637521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021013	ATT	2	6	637545	637550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021013	TTC	2	6	637557	637562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_021013	GCC	2	6	637657	637662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_021013	TGT	3	9	637671	637679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021013	CCG	2	6	637682	637687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_021013	AAC	2	6	637726	637731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_021013	AAT	2	6	637798	637803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_021013	TCT	2	6	637804	637809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_021013	AAGC	2	8	637866	637873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_021013	T	6	6	637905	637910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021013	TGT	2	6	637950	637955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021013	CAA	2	6	637968	637973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_021013	TTTC	2	8	638073	638080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_021013	TC	3	6	638123	638128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_021013	T	6	6	638209	638214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_021013	CT	3	6	638223	638228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_021013	GCT	2	6	638271	638276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_021013	T	6	6	638276	638281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021013	CTT	2	6	638325	638330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021013	ACC	2	6	639969	639974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_021013	A	6	6	639992	639997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_021013	ACC	2	6	640003	640008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_021013	TCT	2	6	640021	640026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_021013	CCCT	2	8	640172	640179	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3628	NC_021013	CAA	2	6	640231	640236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_021013	ATTTTT	2	12	640239	640250	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021013	T	7	7	640246	640252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_021013	TTTTGA	2	12	640281	640292	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021013	CAG	2	6	640297	640302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_021013	ATT	2	6	640306	640311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_021013	AT	3	6	640332	640337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_021013	AC	4	8	640354	640361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3636	NC_021013	TA	3	6	640362	640367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3638	NC_021013	TAA	4	12	640407	640418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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