MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 12706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021013	TTGTT	2	10	2140778	2140787	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_021013	ATA	2	6	2140819	2140824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_021013	TTG	2	6	2140839	2140844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_021013	AGAA	2	8	2140845	2140852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_021013	T	6	6	2140853	2140858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12006	NC_021013	TTTC	2	8	2140899	2140906	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12007	NC_021013	CTT	2	6	2141061	2141066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_021013	AT	3	6	2141086	2141091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12009	NC_021013	T	6	6	2141155	2141160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_021013	CGT	2	6	2141240	2141245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_021013	TACC	2	8	2141297	2141304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12012	NC_021013	TCG	2	6	2141374	2141379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_021013	ACG	2	6	2141501	2141506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_021013	GCG	2	6	2141512	2141517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_021013	CT	3	6	2141525	2141530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12016	NC_021013	CGC	2	6	2141548	2141553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12017	NC_021013	T	6	6	2141554	2141559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_021013	ACA	2	6	2142694	2142699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12019	NC_021013	AGG	2	6	2142702	2142707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_021013	CCG	2	6	2142938	2142943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12021	NC_021013	AGG	2	6	2142963	2142968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_021013	AGC	2	6	2143088	2143093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_021013	AGC	2	6	2143127	2143132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12024	NC_021013	GCCC	2	8	2143253	2143260	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12025	NC_021013	T	7	7	2143271	2143277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_021013	AAG	2	6	2143330	2143335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_021013	GCT	2	6	2143368	2143373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12028	NC_021013	CT	3	6	2143372	2143377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12029	NC_021013	AAG	2	6	2143385	2143390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12030	NC_021013	CTT	2	6	2144439	2144444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12031	NC_021013	AGG	2	6	2144498	2144503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12032	NC_021013	GAAT	2	8	2146410	2146417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12033	NC_021013	AGG	2	6	2147103	2147108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_021013	GGTT	2	8	2147545	2147552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_021013	AGG	2	6	2149529	2149534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12036	NC_021013	TGC	2	6	2151742	2151747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12037	NC_021013	GGC	2	6	2151749	2151754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12038	NC_021013	ATC	2	6	2151861	2151866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12039	NC_021013	TGT	2	6	2151886	2151891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12040	NC_021013	TTC	2	6	2152186	2152191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12041	NC_021013	TATG	2	8	2152286	2152293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_021013	GCT	3	9	2152362	2152370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12043	NC_021013	A	6	6	2152418	2152423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_021013	TGA	2	6	2152424	2152429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_021013	CCG	2	6	2152551	2152556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12046	NC_021013	AT	3	6	2152557	2152562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12047	NC_021013	CTGC	2	8	2152618	2152625	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12048	NC_021013	AGG	2	6	2152670	2152675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_021013	AT	3	6	2152858	2152863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_021013	TAT	2	6	2152902	2152907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_021013	TGGC	2	8	2152939	2152946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12052	NC_021013	AT	3	6	2152963	2152968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_021013	ATT	2	6	2152980	2152985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_021013	CAG	2	6	2152999	2153004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12055	NC_021013	TTA	2	6	2153049	2153054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12056	NC_021013	TG	3	6	2153104	2153109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12057	NC_021013	TAAA	2	8	2153151	2153158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_021013	AT	3	6	2153163	2153168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_021013	GAC	2	6	2153183	2153188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12060	NC_021013	A	7	7	2153197	2153203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12061	NC_021013	CGT	2	6	2153206	2153211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12062	NC_021013	CGG	2	6	2153243	2153248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_021013	GCC	2	6	2153263	2153268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12064	NC_021013	ACG	2	6	2153294	2153299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12065	NC_021013	CGG	2	6	2153321	2153326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12066	NC_021013	AGG	2	6	2153332	2153337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12067	NC_021013	GCC	2	6	2153341	2153346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12068	NC_021013	T	7	7	2153361	2153367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_021013	A	7	7	2153394	2153400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_021013	CAG	2	6	2153410	2153415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12071	NC_021013	T	6	6	2153510	2153515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12072	NC_021013	CCG	2	6	2153577	2153582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12073	NC_021013	A	7	7	2153600	2153606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12074	NC_021013	GGA	2	6	2153614	2153619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12075	NC_021013	AGG	2	6	2154131	2154136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_021013	AAAGA	2	10	2155077	2155086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_021013	AGG	2	6	2155569	2155574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_021013	ATC	2	6	2155610	2155615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12079	NC_021013	AGCGC	2	10	2155617	2155626	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12080	NC_021013	CTG	2	6	2155635	2155640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12081	NC_021013	GCT	2	6	2155649	2155654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12082	NC_021013	AATG	2	8	2155679	2155686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12083	NC_021013	GGC	2	6	2155718	2155723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12084	NC_021013	TGC	2	6	2155743	2155748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12085	NC_021013	CCG	2	6	2155760	2155765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12086	NC_021013	CAGC	2	8	2155825	2155832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12087	NC_021013	CAG	2	6	2155880	2155885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12088	NC_021013	GAAA	2	8	2156011	2156018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12089	NC_021013	GGC	2	6	2156093	2156098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12092	NC_021013	GCC	2	6	2156282	2156287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12093	NC_021013	CGC	2	6	2156344	2156349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12095	NC_021013	GCT	2	6	2156359	2156364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12096	NC_021013	GAAA	2	8	2156365	2156372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12097	NC_021013	AGC	2	6	2156441	2156446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12099	NC_021013	CGCACC	2	12	2156489	2156500	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12100	NC_021013	GCA	2	6	2156572	2156577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12101	NC_021013	A	6	6	2156586	2156591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_021013	ACA	2	6	2156694	2156699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12103	NC_021013	AGC	2	6	2156718	2156723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12105	NC_021013	CGG	2	6	2156796	2156801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12106	NC_021013	GCG	2	6	2156829	2156834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12108	NC_021013	GGA	2	6	2156923	2156928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12110	NC_021013	CA	3	6	2157079	2157084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12111	NC_021013	CCG	2	6	2157091	2157096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12112	NC_021013	CGG	2	6	2157113	2157118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_021013	CTG	2	6	2157708	2157713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12116	NC_021013	ATT	2	6	2157808	2157813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12117	NC_021013	TGCC	2	8	2157909	2157916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12118	NC_021013	GGTG	2	8	2157934	2157941	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12119	NC_021013	A	7	7	2157959	2157965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12120	NC_021013	CCCGTC	2	12	2157977	2157988	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12121	NC_021013	GCG	2	6	2158015	2158020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12122	NC_021013	TGC	2	6	2158034	2158039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12123	NC_021013	CGG	2	6	2158048	2158053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_021013	GAT	2	6	2158070	2158075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12125	NC_021013	GAG	2	6	2158079	2158084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12126	NC_021013	GTCCA	2	10	2158094	2158103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12127	NC_021013	TGT	2	6	2158116	2158121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12128	NC_021013	GGT	2	6	2158125	2158130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12129	NC_021013	GCG	2	6	2158136	2158141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12243	NC_021013	TCA	2	6	2175815	2175820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12248	NC_021013	GCG	2	6	2176000	2176005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12249	NC_021013	CAA	2	6	2176041	2176046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12250	NC_021013	GCCC	2	8	2176069	2176076	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12251	NC_021013	TGC	2	6	2176103	2176108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12252	NC_021013	GGGC	2	8	2176128	2176135	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12253	NC_021013	TATCT	2	10	2176299	2176308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12254	NC_021013	GAA	2	6	2176426	2176431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12256	NC_021013	AGCGA	2	10	2176498	2176507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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