MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus bromii L2-63 draft genome

Total Repeats: 12706

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021013	GAC	2	6	82654	82659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_021013	GCC	2	6	82739	82744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_021013	AGG	2	6	82754	82759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021013	GAC	2	6	82795	82800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021013	TGC	2	6	82832	82837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_021013	CAA	2	6	82857	82862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021013	GGCGCG	2	12	82920	82931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_021013	CGGCG	2	10	82977	82986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
509	NC_021013	AGC	2	6	83006	83011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_021013	TGC	2	6	83021	83026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_021013	GTC	2	6	83254	83259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_021013	TCCG	2	8	83391	83398	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
513	NC_021013	CGG	2	6	83412	83417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_021013	ACG	2	6	83522	83527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_021013	AATCCA	2	12	83634	83645	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_021013	GAC	2	6	83655	83660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_021013	GCG	2	6	83711	83716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021013	GAA	2	6	83781	83786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021013	TCCTT	2	10	84044	84053	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
520	NC_021013	GGC	2	6	84070	84075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_021013	TTGA	2	8	84106	84113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021013	AAG	2	6	84202	84207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_021013	ACC	2	6	84281	84286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_021013	AAAC	2	8	84287	84294	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_021013	AAGGC	2	10	84416	84425	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
526	NC_021013	CGA	2	6	84441	84446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_021013	TGC	2	6	84455	84460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_021013	AGC	2	6	84653	84658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_021013	GCA	3	9	84669	84677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_021013	TCT	2	6	84719	84724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_021013	GAC	2	6	84789	84794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021013	A	6	6	85806	85811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_021013	ACG	2	6	85844	85849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_021013	GAA	2	6	85883	85888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_021013	GCA	2	6	85930	85935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_021013	GCA	2	6	85961	85966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021013	A	6	6	85979	85984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021013	GACGC	2	10	85991	86000	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
539	NC_021013	TTC	2	6	86014	86019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_021013	GGC	2	6	86089	86094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_021013	GCGG	2	8	86113	86120	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
542	NC_021013	AAGA	2	8	86144	86151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021013	AGGCA	2	10	86173	86182	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
544	NC_021013	CCTTT	2	10	86191	86200	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
545	NC_021013	AGAA	2	8	86304	86311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021013	GA	3	6	86352	86357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
547	NC_021013	GCGG	2	8	86360	86367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
548	NC_021013	GGC	2	6	86371	86376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_021013	GGC	2	6	86390	86395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_021013	CGC	2	6	86399	86404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_021013	GCG	2	6	86429	86434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_021013	AGC	2	6	86544	86549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_021013	GCGG	2	8	86582	86589	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
554	NC_021013	A	7	7	86597	86603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021013	GGC	2	6	86623	86628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_021013	GAA	2	6	86629	86634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021013	TGT	2	6	86668	86673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021013	GCT	2	6	86688	86693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021013	TGC	3	9	86721	86729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021013	CGG	2	6	86734	86739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_021013	GGC	2	6	86762	86767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_021013	CAGCGG	2	12	86770	86781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_021013	CGT	2	6	86790	86795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_021013	TC	3	6	86800	86805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_021013	GAA	2	6	87059	87064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021013	GGAC	2	8	87093	87100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
567	NC_021013	TTC	2	6	87147	87152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_021013	CAT	2	6	87196	87201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021013	GAA	2	6	87206	87211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021013	GTC	2	6	87238	87243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_021013	CCCG	2	8	87304	87311	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
572	NC_021013	CGC	2	6	87328	87333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_021013	GCT	2	6	87334	87339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_021013	GGA	2	6	87370	87375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021013	TG	3	6	87403	87408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021013	GCA	2	6	87414	87419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_021013	ACA	2	6	87516	87521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_021013	GGACGG	2	12	87622	87633	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
579	NC_021013	TGC	2	6	87645	87650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_021013	AG	3	6	91975	91980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021013	TTG	2	6	91995	92000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021013	TGA	2	6	92038	92043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021013	T	7	7	95664	95670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021013	CAA	2	6	97477	97482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021013	TGCT	2	8	97514	97521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
586	NC_021013	TTCA	2	8	97997	98004	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_021013	CTTT	2	8	98028	98035	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
588	NC_021013	CA	3	6	98047	98052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_021013	TGT	2	6	98080	98085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_021013	ATAAA	2	10	98111	98120	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_021013	AGG	2	6	98132	98137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021013	A	7	7	98179	98185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021013	T	6	6	98211	98216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021013	A	6	6	98244	98249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021013	ACG	2	6	98253	98258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_021013	TGT	2	6	98301	98306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021013	T	7	7	98362	98368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021013	A	6	6	99627	99632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021013	T	6	6	99649	99654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021013	TAT	2	6	99685	99690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021013	T	6	6	99725	99730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021013	CGG	2	6	99738	99743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_021013	TTTA	2	8	99771	99778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021013	A	7	7	99806	99812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021013	T	6	6	99926	99931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021013	T	6	6	99936	99941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_021013	AG	3	6	99995	100000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021013	AGG	2	6	100039	100044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021013	GGC	2	6	101356	101361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_021013	AGG	2	6	101416	101421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021013	CCT	2	6	103292	103297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_021013	CCT	2	6	109518	109523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_021013	TCC	2	6	109770	109775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_021013	GCT	2	6	110487	110492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_021013	CTTT	2	8	110494	110501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_021013	AAAGG	2	10	111210	111219	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021013	GCC	2	6	111233	111238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
618	NC_021013	CCT	2	6	115491	115496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_021013	A	6	6	115531	115536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_021013	TTTCT	2	10	115564	115573	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
621	NC_021013	AGT	2	6	115589	115594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021013	AAT	2	6	115627	115632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021013	GT	3	6	115667	115672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021013	TC	3	6	115678	115683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
625	NC_021013	ACA	2	6	115733	115738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_021013	TCC	2	6	115835	115840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_021013	CTT	2	6	115888	115893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_021013	GCG	2	6	116068	116073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021013	CAA	2	6	116094	116099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_021013	TCA	2	6	116114	116119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_021013	CTGC	2	8	116174	116181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
632	NC_021013	CCA	2	6	116265	116270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_021013	AAT	2	6	116275	116280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_021013	TCA	2	6	116285	116290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_021013	T	6	6	116348	116353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021013	CAA	2	6	116442	116447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021013	GTT	2	6	116448	116453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_021013	GGT	2	6	116484	116489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021013	CGTC	2	8	116559	116566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
640	NC_021013	TCC	2	6	117411	117416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_021013	A	6	6	117475	117480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_021013	GCC	2	6	117481	117486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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924	NC_021013	GGA	2	6	183343	183348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
925	NC_021013	ACC	2	6	183361	183366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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945	NC_021013	GCA	2	6	184827	184832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
946	NC_021013	AAT	2	6	184834	184839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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949	NC_021013	T	6	6	185368	185373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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954	NC_021013	T	6	6	187276	187281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
955	NC_021013	ATT	2	6	187744	187749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
956	NC_021013	A	6	6	187779	187784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
957	NC_021013	ATA	2	6	187828	187833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
958	NC_021013	CAAAA	2	10	189168	189177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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971	NC_021013	AT	3	6	196716	196721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
972	NC_021013	TA	3	6	196741	196746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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