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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 2683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021012	GAAG	2	8	35	42	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021012	AGAA	2	8	568	575	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021012	GGCG	2	8	6632	6639	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021012	GAAA	2	8	6997	7004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021012	CCTG	2	8	7027	7034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021012	CCGT	2	8	7278	7285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021012	CAGC	2	8	9946	9953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021012	GCAA	2	8	12800	12807	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021012	TCAA	2	8	15930	15937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021012	ATTT	2	8	15945	15952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021012	GAAA	2	8	16389	16396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021012	CTGT	2	8	20037	20044	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021012	ACAG	2	8	20056	20063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021012	ATGA	2	8	20845	20852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021012	ATTT	2	8	23344	23351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021012	CAGC	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021012	AGAC	2	8	33844	33851	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021012	AGGT	2	8	37785	37792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021012	GGGA	2	8	38945	38952	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021012	CAGG	2	8	40047	40054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021012	TCAA	2	8	40113	40120	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021012	GATG	2	8	43616	43623	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021012	CAGA	2	8	44150	44157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021012	TCTT	2	8	44305	44312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021012	GCAT	2	8	45157	45164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021012	ATCC	2	8	45288	45295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021012	ATCT	2	8	45596	45603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021012	AATG	2	8	45795	45802	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021012	TACA	2	8	46282	46289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021012	ACAG	2	8	47421	47428	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021012	ACAA	2	8	47431	47438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021012	ATAA	2	8	47513	47520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021012	AAAT	2	8	50886	50893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021012	TAAA	2	8	50990	50997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021012	ATTG	2	8	58252	58259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021012	AAAG	2	8	58652	58659	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021012	TTTC	2	8	61180	61187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021012	GGAA	2	8	61507	61514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021012	TATT	2	8	61744	61751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021012	GACA	2	8	61870	61877	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021012	TGTT	2	8	61912	61919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021012	TCTG	2	8	62266	62273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021012	GAAA	2	8	62503	62510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021012	AGGA	2	8	62637	62644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021012	ACAA	2	8	63714	63721	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021012	ATAA	2	8	63727	63734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021012	CAAT	2	8	64556	64563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021012	TAAA	2	8	64607	64614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021012	TTTC	2	8	70495	70502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021012	GCAA	2	8	71877	71884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021012	AAGA	2	8	72389	72396	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021012	GAAA	2	8	74427	74434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021012	GATG	2	8	74553	74560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021012	ATAA	2	8	74761	74768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021012	AGAA	2	8	75046	75053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021012	GTCT	2	8	75661	75668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021012	CAGA	2	8	75678	75685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_021012	TAAA	2	8	78071	78078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021012	GAAA	2	8	86846	86853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021012	ATAA	2	8	86906	86913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021012	GGTG	2	8	93849	93856	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021012	GTAC	2	8	94875	94882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_021012	GGAA	2	8	96180	96187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021012	AGAA	2	8	96302	96309	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021012	ATGA	2	8	96433	96440	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021012	CGGG	2	8	96451	96458	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021012	TGCC	2	8	96533	96540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021012	CAGA	2	8	98698	98705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_021012	TCTG	2	8	99029	99036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021012	CCTT	2	8	99247	99254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021012	AGTA	2	8	100164	100171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021012	ATTT	2	8	103502	103509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021012	ACAA	2	8	106256	106263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021012	CAGC	2	8	106414	106421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021012	TTTA	2	8	109329	109336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021012	TGAA	2	8	111514	111521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021012	TAAA	2	8	111692	111699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021012	GTAA	2	8	111961	111968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021012	TGGA	2	8	123375	123382	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021012	CTTT	2	8	132184	132191	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021012	ACTA	2	8	132213	132220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021012	CAGG	2	8	133537	133544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021012	CCTG	2	8	133555	133562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021012	GAAA	2	8	145592	145599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021012	CCTG	2	8	146570	146577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021012	GACA	2	8	146602	146609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021012	TGGA	2	8	146750	146757	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021012	TCCA	2	8	146779	146786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021012	ACAG	2	8	147186	147193	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021012	TCCT	2	8	150280	150287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_021012	TTCC	2	8	156465	156472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021012	TTTC	2	8	156536	156543	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021012	GTCC	2	8	156722	156729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021012	TTTC	2	8	157050	157057	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021012	TCCC	2	8	160036	160043	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_021012	TATT	2	8	163388	163395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021012	TTCC	2	8	163470	163477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021012	GCCT	2	8	163564	163571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021012	GCGT	2	8	166939	166946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021012	ATTT	2	8	167135	167142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021012	GTCC	2	8	167934	167941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_021012	CTGT	2	8	168070	168077	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021012	CTTT	2	8	168125	168132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021012	AAAT	2	8	169854	169861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021012	CAGA	2	8	169912	169919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_021012	TCCT	2	8	170259	170266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021012	TGCC	2	8	170722	170729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_021012	AGAA	2	8	171022	171029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021012	CCTT	2	8	171354	171361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021012	TAAT	2	8	176474	176481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021012	ATAA	2	8	182247	182254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021012	TTAT	2	8	182318	182325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021012	ATTA	2	8	182504	182511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021012	ACTT	2	8	184641	184648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021012	GAAC	2	8	185049	185056	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021012	TCAA	2	8	185292	185299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021012	TAGA	2	8	185325	185332	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021012	TCTT	2	8	187556	187563	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021012	GCAC	2	8	187924	187931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021012	TTCC	2	8	188633	188640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021012	TCCA	2	8	188710	188717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021012	CTGA	2	8	189041	189048	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_021012	CCTG	2	8	189638	189645	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021012	ATTG	2	8	192612	192619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021012	CCAG	2	8	192682	192689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021012	TGTT	2	8	193732	193739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021012	GCTT	2	8	195005	195012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021012	TTTC	2	8	196718	196725	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021012	TGTT	2	8	199861	199868	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021012	TTTG	2	8	201716	201723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021012	GTAA	2	8	202609	202616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021012	ATTT	2	8	205710	205717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021012	ATTT	2	8	208353	208360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021012	TTGA	2	8	215494	215501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021012	AAAG	2	8	220500	220507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021012	CAAA	2	8	221707	221714	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021012	ATGA	2	8	223146	223153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021012	AATC	2	8	226448	226455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021012	GCAT	2	8	227576	227583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021012	TCCA	2	8	227767	227774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021012	TTGA	2	8	227786	227793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021012	TCCA	2	8	228524	228531	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021012	ATGC	2	8	230129	230136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021012	AGTG	2	8	238458	238465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021012	ACGA	2	8	238482	238489	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021012	TCTT	2	8	238644	238651	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021012	TTTC	2	8	238805	238812	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021012	TTTG	2	8	238875	238882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021012	TCAT	2	8	238962	238969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_021012	TGTT	2	8	243400	243407	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021012	TTAT	2	8	248075	248082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021012	TCAT	2	8	249967	249974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021012	ATTT	2	8	250383	250390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021012	AGAC	2	8	252353	252360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_021012	ATTT	2	8	252542	252549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021012	GATT	2	8	252681	252688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021012	ATTT	2	8	254981	254988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021012	TTTG	2	8	255582	255589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021012	ATTT	2	8	255692	255699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021012	TTAA	2	8	258414	258421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021012	TATT	2	8	258628	258635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_021012	TTTC	2	8	261783	261790	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_021012	TAAA	2	8	296284	296291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_021012	ACAG	2	8	371917	371924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_021012	AATA	2	8	389608	389615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_021012	GAAA	2	8	670906	670913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
450	NC_021012	GATT	2	8	671673	671680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
451	NC_021012	GTTC	2	8	671703	671710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_021012	ACGG	2	8	671995	672002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
453	NC_021012	GTAT	2	8	672024	672031	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021012	AAGA	2	8	673114	673121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_021012	GATA	2	8	679592	679599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_021012	AGGA	2	8	680464	680471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
470	NC_021012	GATT	2	8	680519	680526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_021012	CTTA	2	8	681153	681160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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474	NC_021012	GAAA	2	8	682791	682798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
475	NC_021012	AGGA	2	8	682933	682940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
476	NC_021012	CCAG	2	8	683222	683229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
477	NC_021012	ATTT	2	8	683364	683371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_021012	GCTG	2	8	685694	685701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_021012	AAAT	2	8	687227	687234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_021012	TGAT	2	8	690850	690857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
485	NC_021012	AGGA	2	8	691477	691484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_021012	AAAG	2	8	691633	691640	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_021012	TCAA	2	8	691691	691698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_021012	GAAA	2	8	703608	703615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_021012	CAGG	2	8	703701	703708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_021012	AGGT	2	8	711569	711576	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_021012	GAAA	2	8	713048	713055	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021012	CAGT	2	8	714461	714468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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