MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021012	ATA	2	6	676252	676257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_021012	AAG	2	6	676280	676285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_021012	GAA	2	6	676361	676366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_021012	TTC	2	6	676381	676386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_021012	TTG	2	6	676719	676724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_021012	AG	3	6	677669	677674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_021012	AGG	2	6	677700	677705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_021012	ATA	2	6	678673	678678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_021012	CTGC	2	8	678685	678692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3510	NC_021012	CAG	2	6	678773	678778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_021012	TGCGAT	2	12	678791	678802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3512	NC_021012	TTAT	2	8	678933	678940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_021012	TAA	2	6	679033	679038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_021012	TTG	2	6	679063	679068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_021012	AGG	2	6	679078	679083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_021012	AAT	2	6	679140	679145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_021012	A	6	6	679163	679168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_021012	TGAA	2	8	679189	679196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_021012	GAA	2	6	679209	679214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_021012	ATTG	2	8	679250	679257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_021012	GGC	3	9	679286	679294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_021012	AGT	2	6	679298	679303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_021012	TGC	2	6	679316	679321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_021012	GCT	2	6	679326	679331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_021012	GGTA	2	8	679352	679359	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021012	GTG	2	6	679552	679557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_021012	GATA	2	8	679592	679599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021012	AT	3	6	679803	679808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_021012	GGC	2	6	679852	679857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_021012	T	7	7	679963	679969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_021012	ATG	2	6	679972	679977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_021012	GAA	2	6	680013	680018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_021012	TGA	2	6	680027	680032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_021012	CTT	2	6	680040	680045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_021012	AAG	2	6	680048	680053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_021012	CAG	2	6	680160	680165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_021012	AGGA	2	8	680228	680235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_021012	TTA	2	6	680403	680408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_021012	AGGA	2	8	680464	680471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_021012	GATT	2	8	680519	680526	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_021012	ATG	2	6	680530	680535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_021012	ACA	2	6	680561	680566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_021012	ATG	2	6	680593	680598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_021012	AT	3	6	680622	680627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_021012	TGACT	2	10	680630	680639	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3546	NC_021012	AAGAG	2	10	680645	680654	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_021012	GAA	2	6	680691	680696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_021012	ATG	2	6	680782	680787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_021012	GGC	2	6	680794	680799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_021012	A	6	6	680810	680815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_021012	AGG	2	6	680822	680827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_021012	ATG	3	9	680848	680856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_021012	TGG	2	6	680923	680928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021012	AG	3	6	681040	681045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021012	A	6	6	681062	681067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_021012	CTTA	2	8	681153	681160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_021012	AAG	2	6	681245	681250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_021012	GAA	2	6	681321	681326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_021012	ATT	2	6	681409	681414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_021012	ATT	2	6	681499	681504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_021012	TAA	2	6	681533	681538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_021012	GGCAG	2	10	681622	681631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3563	NC_021012	ATG	2	6	681652	681657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_021012	GGC	2	6	681743	681748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_021012	TAA	2	6	681827	681832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_021012	AAGT	2	8	681883	681890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_021012	GCT	2	6	681912	681917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_021012	TGT	2	6	681938	681943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_021012	AGG	2	6	682003	682008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_021012	AAC	2	6	682031	682036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_021012	TCAGT	2	10	682052	682061	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3572	NC_021012	GGA	2	6	682227	682232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021012	GGCA	2	8	682254	682261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_021012	ATG	2	6	682270	682275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_021012	GAA	2	6	682292	682297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_021012	AGG	2	6	682410	682415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_021012	GCA	2	6	682466	682471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_021012	TAA	2	6	682477	682482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_021012	TGGAA	2	10	682491	682500	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_021012	GAG	2	6	682605	682610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_021012	A	7	7	682619	682625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_021012	GCAGG	2	10	682629	682638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3583	NC_021012	GAT	2	6	682680	682685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_021012	TAT	2	6	682727	682732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_021012	ATG	2	6	682765	682770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_021012	AAG	2	6	682779	682784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_021012	GAAA	2	8	682791	682798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_021012	GGA	2	6	682826	682831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_021012	ATTCC	2	10	682854	682863	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3590	NC_021012	TAT	2	6	682902	682907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_021012	TAT	2	6	682920	682925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_021012	AGGA	2	8	682933	682940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_021012	GCA	2	6	682949	682954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_021012	GATTG	2	10	682961	682970	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_021012	GGT	2	6	682974	682979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_021012	CGA	2	6	682984	682989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_021012	GA	3	6	683017	683022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_021012	TA	3	6	683076	683081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_021012	TGG	2	6	683171	683176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_021012	CCAG	2	8	683222	683229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_021012	TTA	2	6	683270	683275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_021012	TAA	2	6	683321	683326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_021012	AAT	2	6	683346	683351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_021012	ATTT	2	8	683364	683371	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021012	ATA	2	6	683404	683409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_021012	AGT	2	6	683411	683416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_021012	AAATG	2	10	683424	683433	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_021012	GAG	2	6	683454	683459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_021012	AGG	2	6	683551	683556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_021012	ACA	2	6	683566	683571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_021012	TCA	2	6	683577	683582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_021012	TAA	2	6	683986	683991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021012	TGG	2	6	684068	684073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_021012	AAGGA	2	10	684086	684095	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_021012	A	6	6	684729	684734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_021012	A	7	7	684833	684839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_021012	TGG	2	6	684979	684984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_021012	TCT	2	6	685052	685057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_021012	GGA	2	6	685088	685093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_021012	ATT	2	6	685140	685145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_021012	G	6	6	685166	685171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_021012	CTG	2	6	685188	685193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_021012	CAG	2	6	685218	685223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_021012	CAG	2	6	685243	685248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_021012	N	248	248	685373	685620	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_021012	T	6	6	685681	685686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_021012	GCTG	2	8	685694	685701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_021012	CAAG	2	8	685766	685773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_021012	AAG	2	6	685785	685790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_021012	AGAC	2	8	685808	685815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3631	NC_021012	TGAAT	2	10	685892	685901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_021012	GGA	2	6	685914	685919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_021012	T	6	6	685925	685930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3635	NC_021012	CTA	2	6	685951	685956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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