MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseburia intestinalis XB6B4 draft genome

Total Repeats: 20928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021012	ATA	2	6	587167	587172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_021012	ATAA	2	8	587229	587236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_021012	A	6	6	587243	587248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_021012	AC	3	6	587252	587257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_021012	TAT	2	6	587258	587263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_021012	AGA	2	6	588406	588411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_021012	CAG	2	6	589916	589921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_021012	AT	3	6	593231	593236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_021012	A	6	6	593237	593242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_021012	TATT	2	8	593243	593250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_021012	TA	4	8	593273	593280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_021012	AGGAG	2	10	593292	593301	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_021012	CAG	2	6	594556	594561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_021012	AAAT	2	8	594598	594605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_021012	TCTG	2	8	594637	594644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_021012	GTT	2	6	594660	594665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_021012	AGA	2	6	594692	594697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_021012	ATATG	2	10	598492	598501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_021012	GTTT	2	8	598526	598533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_021012	AAGA	2	8	598549	598556	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_021012	AGC	2	6	598594	598599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_021012	GAA	2	6	600151	600156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_021012	TAGAA	2	10	600162	600171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_021012	AATA	2	8	600465	600472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_021012	AATC	2	8	600518	600525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3026	NC_021012	T	6	6	600625	600630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_021012	AT	3	6	601041	601046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_021012	N	958	958	601053	602010	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_021012	CTTT	2	8	602046	602053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_021012	CA	3	6	602104	602109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_021012	ACT	2	6	602129	602134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_021012	ATG	2	6	602180	602185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_021012	ACAAA	2	10	602216	602225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_021012	AGT	2	6	602241	602246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_021012	GAAA	2	8	602253	602260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_021012	AGA	2	6	602286	602291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_021012	GAA	2	6	602346	602351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_021012	CAT	2	6	602378	602383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_021012	CTG	2	6	602412	602417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_021012	TGG	3	9	602429	602437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_021012	TC	3	6	602451	602456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3042	NC_021012	TGA	2	6	602582	602587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_021012	GGA	2	6	602661	602666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_021012	A	6	6	602772	602777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_021012	TGGA	2	8	602806	602813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_021012	T	6	6	602838	602843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_021012	GTTTG	2	10	602859	602868	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_021012	CAA	2	6	602937	602942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_021012	T	6	6	602984	602989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_021012	TAC	2	6	602995	603000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_021012	A	9	9	603024	603032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_021012	GAA	2	6	603579	603584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_021012	TAA	2	6	603605	603610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_021012	GGA	2	6	603657	603662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_021012	TTA	2	6	603665	603670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_021012	TAA	2	6	603686	603691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_021012	CGA	2	6	603729	603734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_021012	AT	3	6	603757	603762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_021012	TAATA	2	10	603788	603797	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_021012	TGC	2	6	603806	603811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_021012	A	6	6	603843	603848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_021012	TCC	2	6	603992	603997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_021012	AAG	2	6	604023	604028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_021012	GAA	2	6	604094	604099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_021012	CAA	2	6	604110	604115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_021012	GAAAA	2	10	604130	604139	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_021012	GTAT	2	8	604158	604165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_021012	ATG	2	6	604170	604175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_021012	TTA	3	9	604176	604184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_021012	TTG	2	6	604185	604190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_021012	AAGA	2	8	606724	606731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_021012	A	6	6	606731	606736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_021012	CAA	2	6	606761	606766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_021012	A	6	6	606765	606770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_021012	TTA	2	6	606797	606802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_021012	ACAG	2	8	606815	606822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_021012	ACA	2	6	606831	606836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_021012	A	6	6	606899	606904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_021012	ATG	2	6	606995	607000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_021012	CAT	2	6	607019	607024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_021012	AAAAG	2	10	607028	607037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_021012	GTA	2	6	608270	608275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_021012	T	6	6	608281	608286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_021012	GTA	2	6	608337	608342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_021012	CAT	2	6	608380	608385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_021012	GAAA	2	8	608409	608416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_021012	T	7	7	609951	609957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_021012	AGTA	2	8	610007	610014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_021012	TTTA	2	8	610337	610344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_021012	T	7	7	610354	610360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_021012	GAT	2	6	610370	610375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_021012	TCT	2	6	610427	610432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_021012	CA	3	6	610437	610442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_021012	CCT	2	6	614730	614735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_021012	A	6	6	614761	614766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_021012	A	8	8	614797	614804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_021012	T	6	6	614810	614815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_021012	TGA	2	6	614877	614882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_021012	TAG	2	6	614883	614888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_021012	ATT	2	6	614906	614911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_021012	TCC	2	6	614923	614928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3102	NC_021012	ATGA	2	8	614944	614951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_021012	ATAA	2	8	614961	614968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_021012	GCG	2	6	615077	615082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_021012	GTT	2	6	615124	615129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_021012	ATT	2	6	617758	617763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_021012	T	6	6	619939	619944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_021012	CAA	2	6	619955	619960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_021012	A	6	6	619959	619964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_021012	ATA	2	6	620025	620030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_021012	T	6	6	623766	623771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_021012	ATG	2	6	625670	625675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_021012	ATGG	2	8	626956	626963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_021012	A	7	7	626985	626991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_021012	T	7	7	627010	627016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_021012	ACA	2	6	628374	628379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_021012	A	6	6	628379	628384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_021012	CATT	2	8	628411	628418	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_021012	A	6	6	628493	628498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_021012	A	6	6	628510	628515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_021012	AATG	2	8	628519	628526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_021012	A	6	6	628556	628561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_021012	GAA	2	6	628598	628603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_021012	AAT	2	6	628632	628637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_021012	CAT	2	6	629751	629756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_021012	AGAT	2	8	629757	629764	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_021012	TAA	2	6	629771	629776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_021012	TAA	2	6	629788	629793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_021012	TAA	2	6	629805	629810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_021012	TAA	2	6	629843	629848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_021012	ACAG	2	8	630372	630379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_021012	GGT	2	6	631713	631718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_021012	GAG	2	6	631773	631778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_021012	TG	3	6	633897	633902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_021012	TGT	2	6	633908	633913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_021012	GAA	2	6	633945	633950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3137	NC_021012	AGC	2	6	633996	634001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3138	NC_021012	AAAT	2	8	635167	635174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3272	NC_021012	A	6	6	654926	654931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_021012	ATT	2	6	654942	654947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3393	NC_021012	AGA	2	6	669568	669573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3395	NC_021012	A	6	6	669635	669640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3396	NC_021012	A	6	6	669670	669675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3400	NC_021012	TAT	2	6	669986	669991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3401	NC_021012	CA	3	6	669998	670003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3402	NC_021012	TGAT	2	8	670041	670048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3405	NC_021012	A	6	6	670174	670179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3406	NC_021012	GGA	2	6	670270	670275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3407	NC_021012	AGA	2	6	670276	670281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3410	NC_021012	ATG	2	6	670359	670364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3411	NC_021012	GAA	2	6	670397	670402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3412	NC_021012	TTG	2	6	670404	670409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3413	NC_021012	ACAG	2	8	670410	670417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3414	NC_021012	CGG	2	6	670421	670426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3415	NC_021012	GCGG	2	8	670438	670445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3416	NC_021012	GAAGCA	2	12	670537	670548	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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3418	NC_021012	TAT	2	6	670629	670634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3420	NC_021012	GAA	2	6	670682	670687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3421	NC_021012	GGA	2	6	670712	670717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3422	NC_021012	ACA	2	6	670721	670726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3423	NC_021012	ATAAC	2	10	670827	670836	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3424	NC_021012	GAAA	2	8	670906	670913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3425	NC_021012	AAT	2	6	671078	671083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3426	NC_021012	CAG	2	6	671103	671108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3428	NC_021012	N	279	279	671227	671505	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3430	NC_021012	TGA	3	9	671534	671542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3432	NC_021012	GGA	2	6	671604	671609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3433	NC_021012	GAA	2	6	671624	671629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3434	NC_021012	TTA	2	6	671645	671650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3435	NC_021012	GATT	2	8	671673	671680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_021012	GTTC	2	8	671703	671710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3437	NC_021012	TG	3	6	671779	671784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3438	NC_021012	AAG	2	6	671897	671902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3439	NC_021012	TGG	2	6	671909	671914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3440	NC_021012	CGG	2	6	671936	671941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3441	NC_021012	GGA	2	6	671961	671966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3442	NC_021012	TTC	2	6	671972	671977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3443	NC_021012	ACGG	2	8	671995	672002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3444	NC_021012	GGA	2	6	672003	672008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3447	NC_021012	GAG	2	6	672064	672069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3448	NC_021012	TTC	2	6	672139	672144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3449	NC_021012	AGG	2	6	672158	672163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3450	NC_021012	GTT	2	6	672178	672183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3451	NC_021012	T	7	7	672264	672270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3452	NC_021012	GAA	2	6	672276	672281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3453	NC_021012	ATG	2	6	673104	673109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3454	NC_021012	AAGA	2	8	673114	673121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3455	NC_021012	GA	3	6	673120	673125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3456	NC_021012	A	6	6	673773	673778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3457	NC_021012	TA	3	6	673811	673816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3458	NC_021012	ATT	2	6	673825	673830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3463	NC_021012	A	7	7	674345	674351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3465	NC_021012	GTCA	2	8	674397	674404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3469	NC_021012	ATG	2	6	674732	674737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3470	NC_021012	TGT	2	6	674811	674816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3471	NC_021012	TTTA	2	8	674884	674891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3472	NC_021012	GACA	2	8	674948	674955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3473	NC_021012	AAC	2	6	675018	675023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3475	NC_021012	T	6	6	675171	675176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3476	NC_021012	CAA	2	6	675185	675190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3481	NC_021012	TTA	2	6	675476	675481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3500	NC_021012	TGG	2	6	676211	676216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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