MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 7893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020992	ATG	2	6	256428	256433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020992	TTA	2	6	256446	256451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020992	T	6	6	256494	256499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020992	GTA	2	6	256521	256526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020992	ATT	2	6	256537	256542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020992	TAC	2	6	256785	256790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020992	AT	3	6	256802	256807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020992	TC	3	6	256814	256819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_020992	TTC	2	6	256859	256864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_020992	TTA	2	6	256890	256895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020992	TAAAA	2	10	256920	256929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020992	A	7	7	256926	256932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020992	ATT	2	6	256947	256952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020992	A	6	6	256994	256999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020992	T	6	6	257003	257008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020992	TAA	2	6	257048	257053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020992	ATT	2	6	257073	257078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020992	ATAA	2	8	257144	257151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020992	ATA	2	6	257192	257197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020992	TTAAT	2	10	259386	259395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020992	T	6	6	259429	259434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020992	TAA	2	6	259456	259461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020992	TAA	2	6	259505	259510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020992	A	6	6	259526	259531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020992	TTATG	2	10	259676	259685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020992	TA	3	6	259886	259891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020992	TAT	2	6	259908	259913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020992	ATT	2	6	259935	259940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020992	AAT	2	6	259941	259946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020992	ATTT	2	8	259969	259976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020992	TTTA	2	8	260033	260040	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020992	T	6	6	260109	260114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020992	ATT	2	6	260146	260151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020992	TAA	2	6	260183	260188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020992	TAT	2	6	260209	260214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020992	TAA	2	6	260233	260238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_020992	TAACAA	2	12	260314	260325	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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1541	NC_020992	TAA	2	6	260362	260367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020992	ATT	2	6	260390	260395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020992	TAG	2	6	260406	260411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020992	TAT	2	6	260416	260421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020992	TGT	2	6	260434	260439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020992	TAC	2	6	260443	260448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1548	NC_020992	ATC	3	9	260536	260544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020992	TAC	2	6	260555	260560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_020992	CT	3	6	260625	260630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_020992	TAA	2	6	260743	260748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020992	TAA	2	6	260789	260794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020992	CAGTAA	2	12	260797	260808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1554	NC_020992	ATA	2	6	260818	260823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020992	GTA	2	6	260844	260849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020992	TAA	2	6	260883	260888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020992	ATT	2	6	260895	260900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020992	CAA	2	6	260918	260923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_020992	TAT	2	6	260926	260931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020992	ATT	2	6	260949	260954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020992	AG	3	6	260967	260972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020992	ACTG	2	8	260991	260998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_020992	TGG	2	6	261019	261024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020992	ATT	2	6	261029	261034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020992	TAA	2	6	261062	261067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020992	ATG	2	6	261077	261082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020992	T	6	6	261112	261117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020992	ATT	2	6	261127	261132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020992	TC	3	6	261146	261151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_020992	TTACT	2	10	261183	261192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1571	NC_020992	TAAA	2	8	261200	261207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020992	T	6	6	261235	261240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020992	AG	3	6	261275	261280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020992	TAT	2	6	261322	261327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020992	TTA	2	6	261343	261348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1577	NC_020992	TA	3	6	261433	261438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020992	GTAG	2	8	261439	261446	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020992	TAC	2	6	261450	261455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_020992	AGT	2	6	261497	261502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_020992	T	8	8	261533	261540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020992	TA	3	6	261548	261553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020992	TAA	2	6	261733	261738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020992	TGT	2	6	261740	261745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020992	TAA	2	6	261750	261755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1589	NC_020992	ATT	2	6	261799	261804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_020992	TAT	2	6	262016	262021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020992	TA	3	6	262031	262036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020992	TAT	2	6	262077	262082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020992	TA	3	6	262086	262091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020992	TA	3	6	262095	262100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020992	T	6	6	262142	262147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020992	A	6	6	262150	262155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020992	TAA	2	6	262156	262161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020992	TA	3	6	262169	262174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020992	T	8	8	262189	262196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020992	ACC	2	6	262246	262251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_020992	T	6	6	262263	262268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1612	NC_020992	TGT	2	6	263927	263932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020992	AATA	2	8	263983	263990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1616	NC_020992	CTT	2	6	267325	267330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_020992	TAT	2	6	267334	267339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020992	TAC	2	6	267389	267394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_020992	TAA	3	9	267395	267403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_020992	TAAAT	2	10	268568	268577	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020992	T	6	6	268592	268597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020992	GTATT	2	10	268598	268607	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020992	AAT	2	6	268669	268674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020992	A	6	6	268697	268702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020992	ATTAAT	2	12	269639	269650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020992	TA	3	6	269673	269678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020992	TTA	2	6	269679	269684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020992	ATA	2	6	269712	269717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020992	TTTA	2	8	270167	270174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020992	TTTG	2	8	271105	271112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020992	GA	3	6	271126	271131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020992	ATTA	2	8	271195	271202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020992	TA	3	6	271212	271217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020992	TAT	2	6	271221	271226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020992	AT	4	8	271274	271281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_020992	A	7	7	271339	271345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_020992	TA	3	6	271424	271429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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