MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 7893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1004	NC_020992	AAT	2	6	174560	174565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020992	ATT	2	6	174585	174590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020992	GCA	2	6	174630	174635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1009	NC_020992	CCA	2	6	174773	174778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_020992	TAC	2	6	174925	174930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1012	NC_020992	T	6	6	174970	174975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020992	TAT	2	6	175001	175006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020992	TAA	2	6	175029	175034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020992	GTATC	2	10	175042	175051	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1017	NC_020992	AAAT	2	8	175120	175127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1019	NC_020992	TAA	2	6	175174	175179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020992	AGTCA	2	10	175226	175235	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1022	NC_020992	TA	3	6	175304	175309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1024	NC_020992	AT	3	6	176457	176462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1027	NC_020992	ATTT	2	8	177816	177823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_020992	TAA	2	6	177862	177867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020992	TAT	2	6	177876	177881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020992	AT	3	6	177880	177885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020992	AGCC	2	8	177909	177916	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_020992	TAT	2	6	177917	177922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020992	TTA	2	6	178000	178005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_020992	AAT	3	9	184289	184297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020992	T	7	7	184309	184315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020992	TTG	2	6	184337	184342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1062	NC_020992	TAC	2	6	186496	186501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1069	NC_020992	TAT	2	6	187167	187172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_020992	AT	3	6	187234	187239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020992	AAT	2	6	187242	187247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1075	NC_020992	A	7	7	187311	187317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_020992	A	8	8	187330	187337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_020992	TCTA	2	8	190320	190327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_020992	GAAT	2	8	190358	190365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_020992	TAC	2	6	190390	190395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1108	NC_020992	A	6	6	190510	190515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020992	AGTCA	2	10	190527	190536	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_020992	TATTT	2	10	190551	190560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_020992	TAA	2	6	192555	192560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020992	ATTA	2	8	192567	192574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020992	CCTT	2	8	192637	192644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1118	NC_020992	TTAGC	2	10	193337	193346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1119	NC_020992	TCA	2	6	193390	193395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1122	NC_020992	T	6	6	193537	193542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020992	AAT	2	6	193570	193575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_020992	ATA	2	6	193579	193584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_020992	TAA	2	6	193603	193608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020992	GTA	2	6	193618	193623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_020992	ATTT	2	8	195059	195066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_020992	ATC	2	6	195157	195162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_020992	T	7	7	195181	195187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020992	TTC	2	6	195197	195202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_020992	AAT	2	6	195320	195325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_020992	AAAATA	2	12	195353	195364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_020992	GATG	2	8	243195	243202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_020992	TG	3	6	243207	243212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_020992	TTTC	2	8	243214	243221	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1415	NC_020992	TTGC	2	8	243282	243289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1416	NC_020992	TAC	2	6	243768	243773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_020992	ATT	3	9	243785	243793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_020992	AAT	2	6	243796	243801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1419	NC_020992	TAC	2	6	243821	243826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1420	NC_020992	T	6	6	243830	243835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_020992	A	6	6	243836	243841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_020992	GTA	2	6	243856	243861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_020992	AGA	2	6	246792	246797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_020992	CTAAT	2	10	246799	246808	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1425	NC_020992	T	6	6	246817	246822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_020992	ATTA	2	8	246854	246861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_020992	TAA	2	6	246875	246880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_020992	AAT	2	6	246886	246891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_020992	AGTGAA	2	12	246897	246908	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_020992	TAA	2	6	246911	246916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_020992	A	6	6	247055	247060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_020992	GTA	2	6	247094	247099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_020992	AGA	2	6	247120	247125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_020992	T	6	6	247233	247238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_020992	AAAT	2	8	247263	247270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_020992	CTA	2	6	247311	247316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_020992	AAT	2	6	247386	247391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_020992	GAT	2	6	247421	247426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_020992	TGT	2	6	247431	247436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_020992	A	6	6	247504	247509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1441	NC_020992	T	6	6	247557	247562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1442	NC_020992	T	6	6	247598	247603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_020992	A	8	8	247605	247612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_020992	ATA	2	6	247631	247636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_020992	AAG	2	6	247653	247658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_020992	CATA	2	8	247676	247683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1447	NC_020992	TTTC	2	8	248470	248477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1448	NC_020992	CT	3	6	249033	249038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1449	NC_020992	ATT	3	9	249040	249048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_020992	TATAA	2	10	249122	249131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_020992	AGA	2	6	249136	249141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_020992	TAA	2	6	250063	250068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_020992	T	6	6	250069	250074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_020992	TAA	2	6	250657	250662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_020992	TGT	2	6	251372	251377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_020992	TGA	2	6	251381	251386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_020992	CAA	2	6	251717	251722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1458	NC_020992	TAA	2	6	251727	251732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1459	NC_020992	TAT	2	6	251739	251744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1460	NC_020992	AATCT	2	10	251748	251757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1461	NC_020992	A	6	6	251776	251781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_020992	TA	3	6	251792	251797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_020992	GAT	2	6	251815	251820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_020992	ATT	2	6	251826	251831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_020992	AT	3	6	252530	252535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1466	NC_020992	TAA	2	6	252545	252550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1467	NC_020992	A	6	6	252590	252595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1468	NC_020992	A	7	7	252611	252617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1469	NC_020992	ATT	2	6	252678	252683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1470	NC_020992	TAA	2	6	252709	252714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1471	NC_020992	TAA	2	6	252733	252738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1472	NC_020992	ACA	2	6	253513	253518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1473	NC_020992	TAA	2	6	253546	253551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1474	NC_020992	TAA	2	6	253641	253646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1475	NC_020992	A	9	9	253650	253658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1476	NC_020992	TAA	2	6	253675	253680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1477	NC_020992	AAT	2	6	253688	253693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1478	NC_020992	AAT	2	6	253730	253735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1479	NC_020992	AT	4	8	254974	254981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1480	NC_020992	A	6	6	255007	255012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1481	NC_020992	AAT	2	6	255015	255020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1482	NC_020992	TAT	2	6	255068	255073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1483	NC_020992	CATTA	2	10	255081	255090	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1484	NC_020992	TTA	2	6	255133	255138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1485	NC_020992	AT	3	6	255171	255176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1486	NC_020992	TTC	2	6	255192	255197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1487	NC_020992	TTA	2	6	255200	255205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1488	NC_020992	ATTA	2	8	255208	255215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1489	NC_020992	AGTT	2	8	255239	255246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_020992	TTA	2	6	255254	255259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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