MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. NMRC Madrid E

Total Repeats: 7893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020992	TAA	2	6	98273	98278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020992	TTA	2	6	99177	99182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020992	ATG	2	6	99207	99212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020992	TAAA	2	8	99222	99229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020992	TTA	2	6	99258	99263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020992	TACT	2	8	99264	99271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
507	NC_020992	GTA	2	6	99334	99339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020992	ATT	2	6	100667	100672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020992	AAC	2	6	100678	100683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_020992	A	6	6	101270	101275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020992	ATA	2	6	102845	102850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020992	TAA	2	6	102858	102863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020992	TTA	2	6	102864	102869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020992	T	6	6	102882	102887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020992	TAA	2	6	102910	102915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020992	ACA	2	6	102982	102987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_020992	ATT	2	6	102990	102995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020992	TTA	2	6	103481	103486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020992	ATTTT	2	10	103520	103529	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020992	TAA	2	6	103533	103538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020992	TAA	2	6	103562	103567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020992	A	6	6	103584	103589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020992	A	6	6	103659	103664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020992	TTTA	2	8	104245	104252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020992	TAA	2	6	104255	104260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020992	ATT	2	6	104281	104286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020992	TACAA	2	10	104287	104296	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
528	NC_020992	A	6	6	104308	104313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020992	ACT	2	6	104320	104325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_020992	TAA	2	6	104342	104347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020992	TA	3	6	104356	104361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020992	TATAT	2	10	104408	104417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020992	TTAA	2	8	104433	104440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020992	TAT	2	6	104473	104478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020992	ATA	2	6	104483	104488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020992	ATT	2	6	104493	104498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020992	ATT	2	6	105880	105885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020992	ATT	2	6	105888	105893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020992	TAT	2	6	105908	105913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020992	TTA	2	6	106028	106033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020992	T	6	6	106038	106043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020992	AGA	2	6	106077	106082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020992	TAA	2	6	106084	106089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020992	AAT	3	9	106094	106102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020992	TAC	2	6	106121	106126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_020992	ATAA	2	8	106137	106144	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020992	TTA	2	6	108399	108404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020992	TA	3	6	108414	108419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020992	TTGA	2	8	108446	108453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020992	CAC	2	6	109185	109190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_020992	ATTAA	2	10	109224	109233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020992	TTTGT	2	10	112135	112144	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020992	ACA	2	6	112308	112313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020992	AT	3	6	112334	112339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020992	TA	3	6	112340	112345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020992	TTG	2	6	112748	112753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020992	CTA	2	6	112791	112796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020992	AAG	2	6	112808	112813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020992	ATT	2	6	112837	112842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020992	TTA	2	6	112900	112905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020992	ATA	2	6	112922	112927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020992	GCAA	2	8	112930	112937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_020992	ATT	2	6	112951	112956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020992	GTA	2	6	112992	112997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020992	CAT	2	6	113018	113023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_020992	TGC	2	6	113095	113100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_020992	TAGA	2	8	113127	113134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020992	TAA	2	6	113171	113176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020992	ATC	2	6	113229	113234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_020992	ATC	2	6	113282	113287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_020992	CTA	2	6	113291	113296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_020992	TCA	2	6	113357	113362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_020992	TAT	2	6	113386	113391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020992	ATTT	2	8	113404	113411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020992	CA	3	6	113437	113442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_020992	TAGTA	2	10	113455	113464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020992	AT	3	6	113543	113548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020992	ATT	2	6	113613	113618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020992	AT	3	6	113645	113650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020992	GA	3	6	113661	113666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020992	ACA	2	6	113686	113691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_020992	ACA	2	6	113711	113716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_020992	TAT	2	6	113719	113724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020992	TTTCA	2	10	113735	113744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
585	NC_020992	TCT	2	6	113751	113756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_020992	TAT	2	6	113847	113852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020992	A	6	6	113917	113922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020992	ATTA	2	8	113936	113943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020992	TTA	2	6	113953	113958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020992	GAT	2	6	113989	113994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020992	TAT	2	6	114008	114013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020992	ATT	2	6	114027	114032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020992	TAA	2	6	114045	114050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020992	TA	3	6	114074	114079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020992	AATAT	2	10	114080	114089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020992	TAT	2	6	114093	114098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020992	AT	3	6	114128	114133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020992	TAATA	2	10	114137	114146	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020992	TTC	2	6	114147	114152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020992	T	8	8	114172	114179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020992	ATT	2	6	114189	114194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020992	AAT	2	6	114207	114212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020992	AAT	2	6	114241	114246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020992	ATT	2	6	115090	115095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020992	TAA	2	6	115399	115404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020992	TTA	2	6	117106	117111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020992	TAC	2	6	117129	117134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_020992	TA	3	6	117139	117144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020992	TAT	2	6	117149	117154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020992	T	6	6	117213	117218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020992	AT	3	6	117253	117258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020992	TA	4	8	121738	121745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020992	ATT	2	6	121750	121755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020992	CTC	2	6	123188	123193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_020992	T	6	6	123227	123232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020992	T	7	7	123236	123242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020992	TATT	2	8	124759	124766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020992	AT	3	6	124789	124794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020992	CAAA	2	8	124804	124811	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_020992	T	6	6	124816	124821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020992	AGAA	2	8	124824	124831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020992	TTA	2	6	124845	124850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020992	TA	3	6	124898	124903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020992	TAAC	2	8	124912	124919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_020992	ATT	2	6	125064	125069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020992	GCA	2	6	125136	125141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020992	ATG	2	6	125142	125147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020992	TAA	2	6	125421	125426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020992	AT	3	6	125441	125446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020992	TAA	2	6	125449	125454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020992	ATT	2	6	125456	125461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020992	GAT	2	6	125465	125470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020992	AATA	2	8	125495	125502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020992	ATT	2	6	125524	125529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020992	TGA	2	6	125563	125568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020992	TAAT	2	8	125585	125592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020992	T	6	6	125597	125602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020992	ATG	2	6	125608	125613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_020992	ATT	2	6	125711	125716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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