MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodanobacter sp. 2APBS1

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020541	GTTACA	2	12	8930	8941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020541	GTGTCG	2	12	31745	31756	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020541	CCGGCT	2	12	32884	32895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020541	CGGGGG	2	12	42725	42736	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020541	CCGGCA	2	12	60804	60815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020541	TGGATG	2	12	63522	63533	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020541	GCTCTT	2	12	71764	71775	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020541	ATGTTG	2	12	93457	93468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020541	GTCACG	2	12	166973	166984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020541	AGCGCA	2	12	189581	189592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020541	GCCCGC	2	12	200314	200325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020541	GGGGCT	2	12	221077	221088	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020541	GCTGGC	2	12	222262	222273	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020541	ATCCTG	2	12	222887	222898	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020541	CCGGCG	2	12	222964	222975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020541	GTGGCG	2	12	223436	223447	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020541	CGCCCA	2	12	244395	244406	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_020541	GAAGCG	2	12	249522	249533	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020541	TATGAG	2	12	281290	281301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020541	ATCAGG	2	12	307992	308003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020541	GCGGAG	2	12	320407	320418	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020541	CCGGCG	2	12	329436	329447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020541	CAACAT	2	12	348201	348212	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020541	CCGAAA	2	12	477508	477519	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020541	TCGTGA	2	12	502941	502952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020541	TTCCCG	2	12	590912	590923	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020541	CTGGCG	2	12	606844	606855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020541	GACTGC	2	12	647269	647280	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020541	GAGCGT	2	12	657665	657676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020541	TCCCCG	2	12	700575	700586	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_020541	TCAAGA	2	12	707547	707558	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020541	CTTGAT	2	12	715711	715722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020541	CCGGCG	2	12	737135	737146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020541	ATCAAG	2	12	767439	767450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020541	GGTGCC	2	12	778571	778582	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020541	CTCCCT	2	12	785492	785503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020541	GGGCCG	2	12	819719	819730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020541	CGGGCG	2	12	833616	833627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020541	CGCCGT	2	12	862727	862738	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020541	CGGCAA	2	12	917934	917945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020541	GCCGGG	2	12	942921	942932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020541	GCGACG	2	12	944967	944978	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020541	CGGCAG	2	12	958821	958832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020541	GTCCAT	2	12	997958	997969	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020541	GCGAGC	2	12	1011649	1011660	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020541	GCTCTA	17	102	1011849	1011950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020541	GCTCTT	13	78	1011951	1012028	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020541	GCAAGA	2	12	1109110	1109121	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020541	TTTTGC	2	12	1127421	1127432	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020541	CGTTTT	2	12	1155794	1155805	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020541	TGCGGC	2	12	1186199	1186210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020541	GGGGCA	2	12	1189343	1189354	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020541	TCTCCC	2	12	1193244	1193255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020541	CAGCTG	2	12	1194527	1194538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020541	CCCGGC	2	12	1194996	1195007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020541	AAAGAG	2	12	1230582	1230593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020541	GCCGGG	2	12	1230639	1230650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020541	CAACGG	2	12	1247367	1247378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020541	AAGGGG	2	12	1272615	1272626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020541	CTGTTC	2	12	1289044	1289055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020541	TCGCCG	2	12	1355723	1355734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020541	CGGCAG	2	12	1578648	1578659	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020541	GCTTGC	2	12	1611327	1611338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020541	GCAAGC	2	12	1611353	1611364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020541	GCCGGT	2	12	1631248	1631259	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020541	CGATGG	2	12	1663478	1663489	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020541	AGGGGA	2	12	1671689	1671700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020541	CAACAG	2	12	1675499	1675510	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020541	CCCGGC	2	12	1675690	1675701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_020541	GCCGTG	2	12	1683357	1683368	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020541	CGGCGC	2	12	1702501	1702512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020541	CCCGGA	2	12	1772773	1772784	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020541	GTGAGG	2	12	1772802	1772813	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020541	GTGAGG	2	12	1782376	1782387	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020541	CCGAGG	2	12	1812875	1812886	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020541	AGCCCA	2	12	1814093	1814104	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020541	CTTTTG	2	12	1873893	1873904	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020541	TGGCTG	2	12	1887702	1887713	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020541	CTGCCG	2	12	1922064	1922075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020541	CGGGGA	2	12	1923326	1923337	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020541	GGACGC	2	12	1952641	1952652	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020541	ACAGGC	2	12	1969564	1969575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020541	GCTGGC	2	12	1982289	1982300	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020541	CTGGCG	2	12	2033043	2033054	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020541	CTTCTC	2	12	2060457	2060468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020541	GTACTC	2	12	2097151	2097162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020541	CGCATG	2	12	2174279	2174290	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020541	TCCGGC	2	12	2176835	2176846	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020541	GTCGCC	2	12	2218404	2218415	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020541	GCCTGC	2	12	2218966	2218977	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020541	GAACAG	2	12	2259004	2259015	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020541	GCAGGC	2	12	2264832	2264843	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020541	GGCGAC	2	12	2265394	2265405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020541	CCAGCA	2	12	2307397	2307408	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020541	TCACAT	3	18	2309113	2309130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020541	GCAGTT	2	12	2322963	2322974	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020541	CGCCGG	2	12	2345113	2345124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020541	TCGCCG	2	12	2367525	2367536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020541	CCGCAT	2	12	2367640	2367651	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020541	CGGCGC	2	12	2395938	2395949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020541	GGAACA	2	12	2397217	2397228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_020541	GGGCTT	2	12	2402263	2402274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020541	TGCGCA	2	12	2459036	2459047	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020541	CGTTGC	2	12	2472206	2472217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020541	CCGGCC	2	12	2487339	2487350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020541	TGCTCT	2	12	2521969	2521980	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020541	GCAGCG	2	12	2548588	2548599	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020541	GCTGCG	2	12	2567442	2567453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020541	CCGCGC	2	12	2569610	2569621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_020541	GCCTGC	2	12	2571121	2571132	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020541	GCGCCT	2	12	2594189	2594200	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020541	GCGCGG	2	12	2597877	2597888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020541	GGAGGT	2	12	2622087	2622098	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020541	CAGGCG	2	12	2626775	2626786	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020541	CCGCGG	2	12	2630562	2630573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020541	CGGCTT	2	12	2651094	2651105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020541	CGATGT	2	12	2660049	2660060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020541	CGCGGG	2	12	2677254	2677265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020541	CTCGAC	2	12	2678147	2678158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020541	GACCGG	2	12	2698481	2698492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020541	AGCTTG	2	12	2698530	2698541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_020541	CGGCAC	2	12	2718843	2718854	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020541	TCATTC	2	12	2730136	2730147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020541	GCCGCG	2	12	2773137	2773148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020541	CCATTG	2	12	2780115	2780126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020541	CTGCAC	2	12	2813763	2813774	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020541	CAACCG	2	12	2855114	2855125	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_020541	AGCGGC	2	12	2918060	2918071	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020541	CGCCGG	2	12	2965440	2965451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020541	GACGGC	2	12	3000599	3000610	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020541	CCGGCG	2	12	3004077	3004088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020541	CCGGCA	2	12	3016752	3016763	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020541	AACCTC	2	12	3099522	3099533	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020541	GCCGGG	2	12	3117171	3117182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020541	GAACTT	2	12	3174617	3174628	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_020541	ATCCGG	2	12	3203204	3203215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020541	AGAGCA	2	12	3232090	3232101	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_020541	GCCGGG	2	12	3264539	3264550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020541	CCATGG	2	12	3290165	3290176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020541	CCGCGC	2	12	3305504	3305515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_020541	AGACGA	2	12	3364071	3364082	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_020541	CAACCA	2	12	3369764	3369775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020541	TGAACC	2	12	3376866	3376877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020541	CGCGTT	2	12	3377181	3377192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020541	ACCGCG	2	12	3391482	3391493	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_020541	CTGGCG	2	12	3397407	3397418	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020541	TGCCGC	2	12	3405092	3405103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020541	CAAGCC	2	12	3417908	3417919	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020541	CTCCCG	2	12	3454179	3454190	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_020541	TCATTT	2	12	3462139	3462150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_020541	GCCTGC	2	12	3540064	3540075	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020541	GAGTCA	2	12	3570174	3570185	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_020541	GCTGCG	2	12	3674233	3674244	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020541	TCAGCT	2	12	3702212	3702223	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_020541	GCCCAC	2	12	3724416	3724427	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_020541	GTTGCT	2	12	3758272	3758283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_020541	GATGCC	2	12	3758390	3758401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_020541	CTCTTT	2	12	3758491	3758502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_020541	GCTCTT	2	12	3769439	3769450	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_020541	GGGTGA	2	12	3830361	3830372	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020541	CCGGCG	2	12	3848298	3848309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_020541	GGCCTT	2	12	3855385	3855396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_020541	CGTAGA	2	12	3855882	3855893	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_020541	CGATGG	2	12	3856368	3856379	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_020541	CTGCCG	2	12	3869950	3869961	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
166	NC_020541	ACCGGC	2	12	3883234	3883245	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
167	NC_020541	CTCCAG	2	12	3891685	3891696	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
168	NC_020541	TTTCCG	2	12	3908090	3908101	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_020541	CGCAGA	2	12	3959582	3959593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_020541	CCCAAG	2	12	3987239	3987250	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
171	NC_020541	CGTTTT	2	12	4006936	4006947	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_020541	TGGTGA	3	18	4038232	4038249	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020541	CATTCG	2	12	4067375	4067386	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_020541	TCGTTT	2	12	4156170	4156181	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
175	NC_020541	TGGGGT	2	12	4163371	4163382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.