MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodanobacter sp. 2APBS1

Total Repeats: 10119

< Previous12...9101112131415161718192021Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_020541	TTG	2	6	4163489	4163494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_020541	TGTT	2	8	4163534	4163541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_020541	CCT	2	6	4164977	4164982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_020541	AGA	2	6	4164994	4164999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_020541	AT	3	6	4165015	4165020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_020541	ATG	2	6	4165067	4165072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_020541	CGT	2	6	4165127	4165132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_020541	TTG	2	6	4165189	4165194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_020541	GCC	2	6	4165202	4165207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_020541	TCGT	2	8	4165243	4165250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10011	NC_020541	GTC	2	6	4165259	4165264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_020541	TC	3	6	4165318	4165323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10013	NC_020541	GGTC	2	8	4165326	4165333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_020541	CTG	2	6	4165338	4165343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_020541	CCG	2	6	4165344	4165349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10016	NC_020541	CGCTG	2	10	4165350	4165359	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10017	NC_020541	GC	3	6	4165396	4165401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_020541	CG	3	6	4165502	4165507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10019	NC_020541	GC	3	6	4165536	4165541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10020	NC_020541	CCGA	2	8	4165557	4165564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_020541	GCC	2	6	4166581	4166586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_020541	GCC	2	6	4166624	4166629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_020541	ATG	2	6	4166693	4166698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_020541	CGC	2	6	4166701	4166706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_020541	CGCC	2	8	4166721	4166728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10026	NC_020541	CAT	2	6	4168870	4168875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_020541	ATCG	2	8	4168878	4168885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10028	NC_020541	GC	3	6	4173293	4173298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10029	NC_020541	GC	3	6	4173304	4173309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_020541	CG	3	6	4173338	4173343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_020541	CCA	2	6	4173370	4173375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10032	NC_020541	CGG	2	6	4175459	4175464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_020541	CGA	2	6	4175469	4175474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_020541	CGC	2	6	4176324	4176329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_020541	GGC	2	6	4178217	4178222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_020541	GGC	2	6	4179184	4179189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_020541	CCG	2	6	4179199	4179204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_020541	GCC	3	9	4179208	4179216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_020541	GGAA	2	8	4181580	4181587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_020541	CCG	2	6	4181604	4181609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_020541	GGC	2	6	4181616	4181621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_020541	GTG	2	6	4182366	4182371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_020541	GGC	3	9	4182385	4182393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_020541	GGGCA	2	10	4182394	4182403	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10045	NC_020541	GTGA	2	8	4182404	4182411	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_020541	GCG	2	6	4182420	4182425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_020541	CGC	2	6	4182470	4182475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_020541	GCC	2	6	4184280	4184285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_020541	ACG	2	6	4185430	4185435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_020541	GCG	2	6	4185471	4185476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_020541	GGA	2	6	4187558	4187563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_020541	CCG	2	6	4187623	4187628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10053	NC_020541	GCG	2	6	4187657	4187662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_020541	AGT	2	6	4188161	4188166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_020541	TTC	2	6	4188178	4188183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_020541	AAC	2	6	4188263	4188268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_020541	ACG	2	6	4188320	4188325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_020541	CCG	2	6	4188362	4188367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10059	NC_020541	TCC	2	6	4188376	4188381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_020541	CTG	2	6	4188390	4188395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_020541	CAC	2	6	4188397	4188402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10062	NC_020541	GCCA	2	8	4188421	4188428	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_020541	GAC	2	6	4189584	4189589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_020541	ACT	2	6	4189702	4189707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_020541	CGC	2	6	4192569	4192574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10066	NC_020541	CCGC	2	8	4192584	4192591	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10067	NC_020541	GCGG	2	8	4192597	4192604	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_020541	GC	3	6	4197150	4197155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10069	NC_020541	GC	4	8	4197166	4197173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10070	NC_020541	TCCAA	2	10	4198075	4198084	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10071	NC_020541	GCG	2	6	4198085	4198090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_020541	TGC	2	6	4198890	4198895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_020541	CGCGG	2	10	4200471	4200480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10074	NC_020541	GCG	2	6	4200495	4200500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_020541	C	6	6	4200529	4200534	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10076	NC_020541	CTT	2	6	4200594	4200599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_020541	A	7	7	4200895	4200901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_020541	CGG	2	6	4200910	4200915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_020541	T	8	8	4200917	4200924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_020541	GCC	2	6	4203051	4203056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10081	NC_020541	GCCG	2	8	4203071	4203078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10082	NC_020541	GCG	3	9	4203088	4203096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_020541	CTG	2	6	4204219	4204224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_020541	CGG	2	6	4204271	4204276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_020541	GCC	2	6	4204279	4204284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_020541	ATC	2	6	4204285	4204290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_020541	GGC	2	6	4204314	4204319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_020541	CCA	2	6	4205443	4205448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_020541	GGC	2	6	4205791	4205796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_020541	CAC	2	6	4207302	4207307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_020541	GCC	2	6	4207330	4207335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10092	NC_020541	CGGCA	2	10	4207386	4207395	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10093	NC_020541	CGGCG	2	10	4207430	4207439	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10094	NC_020541	CTGC	2	8	4207471	4207478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_020541	CG	3	6	4208027	4208032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_020541	CG	3	6	4208077	4208082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_020541	CGG	2	6	4208114	4208119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_020541	CG	3	6	4208160	4208165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10099	NC_020541	GCAC	2	8	4208208	4208215	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_020541	CGG	2	6	4208227	4208232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_020541	CGT	2	6	4213912	4213917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_020541	GC	3	6	4213927	4213932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_020541	GCG	2	6	4213939	4213944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_020541	CGG	2	6	4215045	4215050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_020541	GC	3	6	4215056	4215061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_020541	CCGG	2	8	4215080	4215087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10107	NC_020541	GC	3	6	4215091	4215096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10108	NC_020541	CTT	2	6	4215097	4215102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_020541	CCG	2	6	4216737	4216742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_020541	GGC	2	6	4216777	4216782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_020541	GCCA	2	8	4216802	4216809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_020541	CGG	2	6	4217924	4217929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_020541	CTC	2	6	4217951	4217956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_020541	ACC	2	6	4217970	4217975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_020541	CGCCA	2	10	4220680	4220689	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10116	NC_020541	CCCG	2	8	4220724	4220731	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10117	NC_020541	CGG	2	6	4223010	4223015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_020541	CGC	2	6	4224882	4224887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_020541	AGGA	2	8	4224894	4224901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...9101112131415161718192021Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.