MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-2

Total Repeats: 5693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020125	C	7	7	574187	574193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1502	NC_020125	TGGA	2	8	574275	574282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020125	TACT	2	8	574336	574343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_020125	GTT	2	6	574384	574389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020125	GAG	2	6	574456	574461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020125	GAA	2	6	574526	574531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020125	AAGG	2	8	574656	574663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020125	CGG	2	6	574705	574710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_020125	GTA	2	6	574821	574826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020125	TGG	2	6	574955	574960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020125	GTT	2	6	574965	574970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020125	ACC	2	6	574976	574981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_020125	GTG	2	6	575023	575028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020125	GGT	2	6	575043	575048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020125	CAA	2	6	575147	575152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_020125	GGT	2	6	575187	575192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020125	CGT	2	6	575382	575387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_020125	TCTA	2	8	575402	575409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_020125	TGT	2	6	575484	575489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020125	GCC	2	6	575490	575495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_020125	AGT	2	6	575646	575651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020125	A	6	6	575693	575698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020125	TGA	2	6	575731	575736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020125	AC	3	6	575761	575766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_020125	TA	3	6	575774	575779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020125	GGT	2	6	575791	575796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020125	CCA	2	6	575845	575850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_020125	TAC	2	6	575861	575866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_020125	CGC	2	6	575885	575890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_020125	T	6	6	575934	575939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020125	AAGG	2	8	575958	575965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020125	TAT	2	6	576049	576054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020125	GA	3	6	576089	576094	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_020125	T	6	6	576197	576202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020125	AGTTAT	2	12	576212	576223	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020125	AAT	2	6	576231	576236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020125	AT	3	6	576241	576246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020125	CTT	2	6	576353	576358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_020125	A	7	7	577508	577514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_020125	GTA	2	6	577523	577528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020125	TTTGA	2	10	577545	577554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020125	AAAT	2	8	579981	579988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020125	T	6	6	580011	580016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020125	TTA	2	6	581890	581895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020125	ATA	2	6	581910	581915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020125	A	6	6	581915	581920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020125	T	6	6	581943	581948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020125	ACT	2	6	582724	582729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020125	AAAC	2	8	582759	582766	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_020125	TTTTAT	2	12	582785	582796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020125	ATTGG	2	10	582888	582897	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020125	A	6	6	582930	582935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020125	T	7	7	584353	584359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020125	AAT	2	6	588189	588194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020125	GAA	2	6	594586	594591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020125	TCAAAT	2	12	595348	595359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1557	NC_020125	TTGA	2	8	598590	598597	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020125	CTT	2	6	598598	598603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_020125	AATA	2	8	598616	598623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020125	T	7	7	598636	598642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_020125	AG	3	6	600850	600855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020125	T	6	6	601777	601782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020125	TAA	2	6	609110	609115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020125	CTAA	2	8	609121	609128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_020125	ATG	2	6	609143	609148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020125	TA	3	6	611028	611033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020125	TAT	2	6	611600	611605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020125	CT	3	6	611641	611646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_020125	AAG	2	6	613322	613327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020125	A	7	7	613878	613884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020125	ATT	2	6	613906	613911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020125	ATT	2	6	613914	613919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020125	T	7	7	615443	615449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020125	TTA	2	6	615487	615492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020125	A	8	8	616242	616249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020125	T	6	6	616273	616278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020125	ATT	2	6	616745	616750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020125	TAC	2	6	616784	616789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_020125	A	7	7	616792	616798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020125	AT	3	6	618339	618344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020125	AAT	2	6	619315	619320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020125	T	7	7	620560	620566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020125	AGG	2	6	620593	620598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020125	T	6	6	621134	621139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020125	T	6	6	622101	622106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020125	TGC	2	6	622121	622126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_020125	ATAA	2	8	622142	622149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020125	T	7	7	622160	622166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020125	T	6	6	622168	622173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020125	T	6	6	622176	622181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020125	T	9	9	622219	622227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020125	A	6	6	622229	622234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020125	ATC	2	6	624156	624161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_020125	ATT	2	6	625247	625252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020125	A	6	6	628451	628456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020125	A	6	6	628465	628470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_020125	A	7	7	628492	628498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020125	AAT	2	6	633826	633831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020125	T	8	8	633842	633849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020125	AG	3	6	633908	633913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020125	A	6	6	633939	633944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020125	GGT	2	6	636260	636265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020125	AATG	2	8	636276	636283	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020125	ATT	2	6	636307	636312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020125	AT	3	6	636335	636340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020125	AAAT	2	8	636341	636348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020125	TAT	2	6	636352	636357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020125	AGT	2	6	636367	636372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020125	A	6	6	636417	636422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020125	GTT	2	6	637284	637289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020125	CAG	2	6	637297	637302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_020125	TTA	2	6	637331	637336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020125	GTAA	2	8	637437	637444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020125	TGC	2	6	637519	637524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_020125	TAG	2	6	637539	637544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020125	GCG	2	6	637604	637609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_020125	TGT	2	6	637704	637709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020125	A	6	6	637802	637807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020125	GGT	2	6	637828	637833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_020125	T	7	7	638879	638885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020125	AGAT	2	8	638899	638906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020125	A	7	7	638940	638946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020125	A	7	7	638975	638981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020125	A	6	6	639001	639006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020125	TAA	2	6	639027	639032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020125	TTTAC	2	10	639236	639245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_020125	T	6	6	639272	639277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020125	T	6	6	639284	639289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020125	GTT	2	6	639290	639295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_020125	TATT	2	8	639332	639339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020125	CTA	2	6	642168	642173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_020125	GAA	2	6	642202	642207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020125	T	7	7	642239	642245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020125	AAT	2	6	642839	642844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020125	TTA	2	6	642845	642850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_020125	TA	3	6	644021	644026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_020125	A	9	9	644026	644034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_020125	A	6	6	644630	644635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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