MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020062	A	6	6	36160	36165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020062	C	6	6	58896	58901	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020062	T	6	6	73153	73158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020062	A	6	6	112480	112485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020062	A	7	7	133483	133489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020062	G	6	6	180931	180936	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020062	A	6	6	186013	186018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020062	A	6	6	223270	223275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020062	A	6	6	238197	238202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020062	G	6	6	255999	256004	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020062	T	6	6	256367	256372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020062	G	6	6	256672	256677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020062	T	6	6	272036	272041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020062	G	6	6	274083	274088	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020062	T	6	6	287824	287829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020062	A	7	7	328037	328043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020062	T	7	7	344030	344036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020062	T	7	7	354807	354813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020062	T	6	6	359828	359833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020062	C	6	6	361889	361894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_020062	C	6	6	374064	374069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
22	NC_020062	A	7	7	389389	389395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020062	A	8	8	403135	403142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020062	T	6	6	433930	433935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020062	A	6	6	487829	487834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020062	A	6	6	510768	510773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020062	A	6	6	515680	515685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020062	C	7	7	519000	519006	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_020062	C	6	6	558626	558631	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30	NC_020062	G	6	6	558661	558666	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020062	G	6	6	558778	558783	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020062	A	7	7	564741	564747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020062	A	6	6	612867	612872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020062	T	6	6	614165	614170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020062	T	6	6	614269	614274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020062	G	6	6	624814	624819	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020062	A	6	6	627828	627833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020062	G	7	7	628683	628689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020062	T	6	6	662826	662831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020062	G	6	6	665058	665063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020062	T	6	6	685871	685876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020062	A	6	6	686095	686100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020062	T	6	6	687785	687790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020062	T	6	6	691021	691026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020062	G	6	6	700687	700692	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020062	A	6	6	708877	708882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020062	A	7	7	712363	712369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020062	T	6	6	746654	746659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020062	T	6	6	777010	777015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020062	T	6	6	799135	799140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020062	T	6	6	799847	799852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020062	A	6	6	817707	817712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020062	T	6	6	818309	818314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020062	T	6	6	856328	856333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020062	A	6	6	857846	857851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020062	T	6	6	879587	879592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020062	A	6	6	904367	904372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020062	T	6	6	904946	904951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020062	A	6	6	921785	921790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020062	T	6	6	931603	931608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020062	A	6	6	954411	954416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020062	G	6	6	956344	956349	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020062	T	6	6	963339	963344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020062	A	6	6	982057	982062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020062	A	6	6	982382	982387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020062	T	6	6	1032979	1032984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020062	T	6	6	1039560	1039565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020062	A	6	6	1051429	1051434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020062	T	7	7	1051444	1051450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020062	C	6	6	1056911	1056916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
71	NC_020062	C	6	6	1063616	1063621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_020062	T	6	6	1083216	1083221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020062	A	6	6	1083596	1083601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020062	A	6	6	1083723	1083728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020062	A	6	6	1087458	1087463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020062	T	6	6	1095386	1095391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020062	A	6	6	1102153	1102158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020062	T	7	7	1115356	1115362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020062	T	6	6	1140598	1140603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020062	T	7	7	1182639	1182645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020062	A	6	6	1182896	1182901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020062	T	6	6	1187685	1187690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020062	A	6	6	1192211	1192216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020062	A	7	7	1201490	1201496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020062	A	7	7	1207766	1207772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020062	T	6	6	1216000	1216005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020062	C	6	6	1246821	1246826	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_020062	A	6	6	1265260	1265265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020062	T	6	6	1284093	1284098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020062	T	6	6	1309116	1309121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020062	A	6	6	1320873	1320878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020062	A	6	6	1334361	1334366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020062	T	7	7	1381182	1381188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020062	T	7	7	1393241	1393247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020062	T	6	6	1394777	1394782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020062	G	6	6	1403430	1403435	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020062	T	6	6	1417894	1417899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020062	A	6	6	1420086	1420091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020062	T	6	6	1428165	1428170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020062	G	6	6	1432855	1432860	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020062	A	6	6	1442903	1442908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020062	T	7	7	1449838	1449844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020062	T	7	7	1468940	1468946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020062	C	6	6	1512172	1512177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
105	NC_020062	A	6	6	1522255	1522260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020062	C	6	6	1522413	1522418	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_020062	A	6	6	1522507	1522512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020062	T	6	6	1536644	1536649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020062	A	7	7	1565100	1565106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020062	A	7	7	1574856	1574862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020062	A	6	6	1615039	1615044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020062	T	6	6	1621260	1621265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020062	T	6	6	1621285	1621290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020062	A	7	7	1633237	1633243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020062	T	6	6	1678756	1678761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020062	T	7	7	1686805	1686811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020062	C	6	6	1697639	1697644	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
118	NC_020062	A	6	6	1697768	1697773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020062	T	6	6	1699010	1699015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020062	A	6	6	1738747	1738752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020062	T	6	6	1775190	1775195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020062	A	6	6	1793550	1793555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020062	C	6	6	1795188	1795193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_020062	T	6	6	1823061	1823066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020062	A	7	7	1824131	1824137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020062	T	6	6	1853014	1853019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020062	C	6	6	1870797	1870802	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
128	NC_020062	T	6	6	1870859	1870864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020062	C	6	6	1880503	1880508	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
130	NC_020062	A	6	6	1896014	1896019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020062	A	6	6	1924228	1924233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020062	T	6	6	1996112	1996117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020062	T	6	6	2018211	2018216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020062	C	6	6	2023065	2023070	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
135	NC_020062	C	7	7	2035475	2035481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
136	NC_020062	T	7	7	2049512	2049518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020062	T	6	6	2059491	2059496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020062	A	6	6	2081829	2081834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.