MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899b

Total Repeats: 2950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020061	GTTC	2	8	88381	88388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_020061	GAA	2	6	88894	88899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020061	ACC	2	6	88913	88918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_020061	GAC	2	6	88998	89003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_020061	CTT	2	6	89022	89027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020061	TAG	2	6	89173	89178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020061	AAC	2	6	89190	89195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020061	AGGCGA	2	12	89243	89254	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
509	NC_020061	TGCC	2	8	89279	89286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
510	NC_020061	A	6	6	89366	89371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020061	GA	3	6	89398	89403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020061	GCC	2	6	90732	90737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_020061	AGTG	2	8	90745	90752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020061	GCA	2	6	90901	90906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_020061	AAG	2	6	90910	90915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020061	CGG	2	6	90924	90929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_020061	GCG	2	6	90943	90948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_020061	CGC	2	6	91014	91019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_020061	CGT	2	6	91041	91046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020061	TCG	2	6	91053	91058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020061	TTC	2	6	91103	91108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020061	CGT	2	6	91150	91155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_020061	GC	3	6	91209	91214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_020061	TGCT	2	8	91356	91363	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_020061	GCT	2	6	91389	91394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020061	CTG	2	6	91404	91409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_020061	TGC	2	6	91450	91455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_020061	TGG	2	6	91519	91524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020061	GCCC	2	8	91526	91533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
530	NC_020061	CTTGT	2	10	91539	91548	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
531	NC_020061	GTC	2	6	92603	92608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_020061	TC	3	6	92607	92612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_020061	CAT	2	6	92653	92658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_020061	GAC	2	6	92666	92671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_020061	CTGG	2	8	92692	92699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
536	NC_020061	TCA	2	6	92762	92767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_020061	TCG	2	6	92798	92803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_020061	CTT	2	6	92817	92822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020061	TAT	2	6	92824	92829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020061	CCGTT	2	10	92852	92861	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
541	NC_020061	TCA	2	6	92883	92888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_020061	ATC	2	6	92921	92926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020061	TTGT	2	8	92953	92960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020061	CGT	2	6	92997	93002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_020061	CGT	2	6	93006	93011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_020061	ACA	2	6	93098	93103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020061	CAC	2	6	93118	93123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_020061	CAT	2	6	93136	93141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_020061	ACG	2	6	93166	93171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_020061	CGG	2	6	93359	93364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_020061	GTTC	2	8	93379	93386	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_020061	TGG	2	6	93438	93443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020061	AGG	2	6	93455	93460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020061	TGA	2	6	93504	93509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020061	CG	3	6	93733	93738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_020061	CAA	2	6	93740	93745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_020061	CTTT	2	8	94067	94074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_020061	CCA	2	6	94076	94081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_020061	GAA	2	6	94139	94144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020061	GAG	2	6	94197	94202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020061	TACA	2	8	94224	94231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
562	NC_020061	GATA	2	8	94239	94246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020061	TAT	2	6	95251	95256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020061	CGC	2	6	95294	95299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_020061	TGC	2	6	95307	95312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_020061	GTCT	2	8	95444	95451	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_020061	TTG	2	6	95506	95511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020061	CCG	2	6	95559	95564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_020061	GAT	2	6	95572	95577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020061	CTG	2	6	95600	95605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_020061	GAA	2	6	95684	95689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020061	CGGCG	2	10	95724	95733	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
573	NC_020061	CAT	2	6	96363	96368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_020061	GAG	2	6	96397	96402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020061	GTT	2	6	96449	96454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020061	ACG	2	6	97583	97588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_020061	CGA	2	6	98913	98918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_020061	GCA	2	6	98921	98926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_020061	ATC	2	6	98930	98935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_020061	CGAC	2	8	99159	99166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_020061	CTC	2	6	99677	99682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_020061	CCG	2	6	99689	99694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_020061	ATC	2	6	99716	99721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_020061	TGC	2	6	99736	99741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_020061	GGTG	2	8	100130	100137	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020061	CAG	2	6	100142	100147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_020061	GCCGC	2	10	100297	100306	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
588	NC_020061	GCC	2	6	100311	100316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_020061	GGT	2	6	100339	100344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020061	TGC	2	6	100389	100394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_020061	CG	3	6	100494	100499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_020061	AGG	2	6	100512	100517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020061	ACC	2	6	100559	100564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_020061	GCG	2	6	100569	100574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020061	GGA	2	6	100630	100635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020061	TCCA	2	8	100640	100647	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_020061	TCGG	2	8	100684	100691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_020061	CCGG	2	8	100696	100703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
599	NC_020061	GCC	2	6	100724	100729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_020061	GCACG	2	10	100888	100897	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
601	NC_020061	CGG	2	6	101025	101030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_020061	TGA	2	6	102456	102461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020061	GAGC	2	8	102478	102485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
604	NC_020061	GCCA	2	8	102495	102502	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_020061	ATC	2	6	102548	102553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_020061	GGTC	2	8	102574	102581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
607	NC_020061	ATCC	2	8	102637	102644	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
608	NC_020061	TGC	2	6	102663	102668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_020061	TGG	2	6	102682	102687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020061	GCG	2	6	102709	102714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_020061	ATC	2	6	102746	102751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_020061	GGT	2	6	102799	102804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
613	NC_020061	TCA	2	6	102909	102914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_020061	GTT	2	6	103024	103029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020061	CGT	2	6	103031	103036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_020061	ATG	2	6	103067	103072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020061	CGATGG	2	12	103086	103097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_020061	CTT	2	6	103115	103120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_020061	GGC	2	6	103141	103146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_020061	AT	3	6	103187	103192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020061	GCA	2	6	103270	103275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020061	TGAATC	2	12	103342	103353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
623	NC_020061	A	6	6	104463	104468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020061	GAT	2	6	104488	104493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020061	CAG	2	6	104517	104522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_020061	GAA	2	6	104551	104556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020061	TGC	2	6	104653	104658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020061	TCG	2	6	104743	104748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_020061	GCG	2	6	104780	104785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020061	TGC	2	6	104800	104805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_020061	TCGG	2	8	104880	104887	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
632	NC_020061	CGA	2	6	105017	105022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_020061	GCG	3	9	105029	105037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_020061	GCC	2	6	105105	105110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_020061	GGTGT	2	10	105132	105141	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020061	GGC	2	6	105289	105294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_020061	ATC	2	6	105381	105386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_020061	GGAA	2	8	105395	105402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_020061	CGC	2	6	105428	105433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
640	NC_020061	GCT	2	6	105494	105499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_020061	GCC	2	6	105558	105563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_020061	TCGC	2	8	105567	105574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
643	NC_020061	CAT	3	9	105684	105692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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753	NC_020061	GAA	2	6	121552	121557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
754	NC_020061	AGG	2	6	121565	121570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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765	NC_020061	GAC	2	6	121982	121987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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767	NC_020061	TC	3	6	122003	122008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
768	NC_020061	TCG	2	6	122030	122035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_020061	CGA	2	6	122036	122041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_020061	ATG	2	6	122049	122054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
771	NC_020061	GC	3	6	122133	122138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
772	NC_020061	GTGC	2	8	122151	122158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
773	NC_020061	AGCGGG	2	12	122170	122181	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
774	NC_020061	AAC	2	6	122263	122268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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907	NC_020061	GCC	3	9	143605	143613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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952	NC_020061	GTG	2	6	149315	149320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_020061	GC	3	6	164995	165000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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