MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_019678	AAT	2	6	8535096	8535101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43002	NC_019678	CAG	2	6	8535125	8535130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43003	NC_019678	T	8	8	8535131	8535138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43004	NC_019678	GTATA	2	10	8535158	8535167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43005	NC_019678	T	7	7	8535256	8535262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43006	NC_019678	ATG	2	6	8535399	8535404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43007	NC_019678	AAAT	2	8	8535443	8535450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43008	NC_019678	CTG	3	9	8535476	8535484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43009	NC_019678	GTT	2	6	8535487	8535492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43010	NC_019678	GCTT	2	8	8535583	8535590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43011	NC_019678	AT	3	6	8536176	8536181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43012	NC_019678	CTGT	2	8	8536205	8536212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43013	NC_019678	ATTTA	2	10	8536213	8536222	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43014	NC_019678	TTA	2	6	8536288	8536293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43015	NC_019678	TCA	2	6	8536351	8536356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43016	NC_019678	AT	3	6	8536367	8536372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43017	NC_019678	AATA	2	8	8536377	8536384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43018	NC_019678	TC	3	6	8536422	8536427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43019	NC_019678	AGC	2	6	8536460	8536465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43020	NC_019678	AT	3	6	8536480	8536485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43021	NC_019678	TGC	2	6	8536513	8536518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43022	NC_019678	GTG	2	6	8536525	8536530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43023	NC_019678	GA	3	6	8536538	8536543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43024	NC_019678	GCT	2	6	8537746	8537751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43025	NC_019678	TATT	2	8	8537759	8537766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43026	NC_019678	T	6	6	8537780	8537785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43027	NC_019678	CGC	2	6	8537857	8537862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43028	NC_019678	CCA	2	6	8537899	8537904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43029	NC_019678	TTA	2	6	8537924	8537929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43030	NC_019678	A	7	7	8537954	8537960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43031	NC_019678	GTATA	2	10	8537972	8537981	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43032	NC_019678	T	6	6	8538073	8538078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43033	NC_019678	TTA	2	6	8538090	8538095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43034	NC_019678	AAG	2	6	8538121	8538126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43035	NC_019678	TCA	3	9	8538144	8538152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43036	NC_019678	TA	3	6	8538158	8538163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43037	NC_019678	TGC	2	6	8538235	8538240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43038	NC_019678	TG	3	6	8538252	8538257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43039	NC_019678	TTGC	2	8	8538295	8538302	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43040	NC_019678	A	6	6	8538381	8538386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43041	NC_019678	GGC	2	6	8538418	8538423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43042	NC_019678	AAT	2	6	8538427	8538432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43043	NC_019678	GCC	2	6	8538461	8538466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43044	NC_019678	CAA	2	6	8538545	8538550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43045	NC_019678	ATT	2	6	8538571	8538576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43046	NC_019678	TAAAGC	2	12	8538596	8538607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43047	NC_019678	TTGA	2	8	8538622	8538629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43048	NC_019678	TGC	2	6	8538642	8538647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43049	NC_019678	AAT	2	6	8538670	8538675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43050	NC_019678	AAAG	2	8	8538697	8538704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43051	NC_019678	AAT	2	6	8538771	8538776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43052	NC_019678	AGT	2	6	8538823	8538828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43053	NC_019678	A	6	6	8538870	8538875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43054	NC_019678	ATT	2	6	8538890	8538895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43055	NC_019678	T	6	6	8538894	8538899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43056	NC_019678	AATA	2	8	8538912	8538919	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43057	NC_019678	TAAA	2	8	8538949	8538956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43058	NC_019678	CTTA	2	8	8538996	8539003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43059	NC_019678	AGAT	2	8	8539004	8539011	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43060	NC_019678	AACTAA	2	12	8539080	8539091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43061	NC_019678	TTAA	2	8	8539097	8539104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43062	NC_019678	TAAA	2	8	8539172	8539179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43063	NC_019678	CAAAC	2	10	8539190	8539199	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43064	NC_019678	CTC	2	6	8539249	8539254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43065	NC_019678	ATA	2	6	8539324	8539329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43066	NC_019678	AT	3	6	8539331	8539336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43067	NC_019678	AGT	2	6	8539345	8539350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43068	NC_019678	CAA	2	6	8539361	8539366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43069	NC_019678	TCA	2	6	8539397	8539402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43070	NC_019678	TAT	2	6	8539411	8539416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43071	NC_019678	GGT	2	6	8539422	8539427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43072	NC_019678	AT	3	6	8539438	8539443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43073	NC_019678	TAA	2	6	8539477	8539482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43074	NC_019678	AGT	2	6	8539518	8539523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43075	NC_019678	T	7	7	8539532	8539538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43076	NC_019678	TTTA	2	8	8539676	8539683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43077	NC_019678	T	7	7	8539704	8539710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43078	NC_019678	AAT	2	6	8540880	8540885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43079	NC_019678	AT	3	6	8540926	8540931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43080	NC_019678	TAA	2	6	8541853	8541858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43081	NC_019678	AATT	2	8	8541875	8541882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43082	NC_019678	GAA	2	6	8544709	8544714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43084	NC_019678	AGCA	2	8	8544769	8544776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43085	NC_019678	ATT	2	6	8544783	8544788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43089	NC_019678	AATC	2	8	8548107	8548114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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43095	NC_019678	ACT	2	6	8548567	8548572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43096	NC_019678	TAA	2	6	8548576	8548581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43097	NC_019678	CAA	2	6	8548603	8548608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43098	NC_019678	ACTGA	2	10	8548628	8548637	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43099	NC_019678	ATA	2	6	8548741	8548746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43100	NC_019678	T	6	6	8549015	8549020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43101	NC_019678	ATT	2	6	8549101	8549106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43102	NC_019678	AACCAA	2	12	8552126	8552137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43103	NC_019678	T	6	6	8552183	8552188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43104	NC_019678	TAATG	2	10	8552199	8552208	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43105	NC_019678	TTA	2	6	8552240	8552245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43108	NC_019678	TA	4	8	8552340	8552347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43109	NC_019678	ATT	2	6	8552374	8552379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43110	NC_019678	ATA	2	6	8552405	8552410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43111	NC_019678	TTTTA	2	10	8553234	8553243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43112	NC_019678	AT	3	6	8553292	8553297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43113	NC_019678	ATAA	2	8	8555363	8555370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43114	NC_019678	TAC	2	6	8555373	8555378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43115	NC_019678	TTA	2	6	8555393	8555398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43116	NC_019678	AT	3	6	8555460	8555465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43117	NC_019678	GTC	2	6	8555500	8555505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43118	NC_019678	A	6	6	8555602	8555607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43119	NC_019678	GGT	2	6	8555624	8555629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43120	NC_019678	TTA	2	6	8555679	8555684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43121	NC_019678	T	6	6	8556179	8556184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43122	NC_019678	AT	3	6	8556197	8556202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43123	NC_019678	ATATT	2	10	8556232	8556241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43124	NC_019678	TGT	3	9	8556891	8556899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43125	NC_019678	TTA	2	6	8556910	8556915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43126	NC_019678	CCT	2	6	8556971	8556976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43127	NC_019678	GTA	2	6	8559312	8559317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43128	NC_019678	TATT	2	8	8559334	8559341	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43129	NC_019678	A	6	6	8559354	8559359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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