MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019678	CTT	2	6	660320	660325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_019678	ATC	2	6	660369	660374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_019678	A	6	6	660420	660425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_019678	T	7	7	660475	660481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_019678	AAT	2	6	660510	660515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019678	T	6	6	660554	660559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_019678	TTGC	2	8	660676	660683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_019678	TTA	2	6	660831	660836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_019678	TGATT	2	10	660866	660875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_019678	A	6	6	661065	661070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_019678	TAT	2	6	661255	661260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_019678	TCA	2	6	661304	661309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_019678	AAG	2	6	661313	661318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_019678	CT	3	6	661453	661458	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_019678	AGA	2	6	661501	661506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_019678	ATA	2	6	661519	661524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_019678	CAA	2	6	661534	661539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_019678	GTA	2	6	661555	661560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_019678	A	6	6	661587	661592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_019678	ATA	3	9	661609	661617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_019678	CGA	2	6	661671	661676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_019678	AG	3	6	661711	661716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_019678	ATA	2	6	663314	663319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_019678	AAT	2	6	663328	663333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_019678	TAA	2	6	663493	663498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_019678	AGC	2	6	663540	663545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_019678	ATCA	2	8	669065	669072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3528	NC_019678	ATT	2	6	669094	669099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_019678	TTTAAC	2	12	676996	677007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3530	NC_019678	T	7	7	677026	677032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_019678	AGAT	2	8	677033	677040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_019678	GA	3	6	677060	677065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_019678	TAT	2	6	677135	677140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_019678	TTA	2	6	677148	677153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_019678	ATT	2	6	677164	677169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_019678	ATTT	2	8	677185	677192	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_019678	TAA	2	6	677201	677206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_019678	TGT	2	6	677240	677245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_019678	TTC	2	6	677272	677277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_019678	ATT	2	6	677282	677287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_019678	AGT	2	6	677309	677314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_019678	AAT	2	6	678914	678919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_019678	CGA	2	6	679917	679922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_019678	AT	3	6	679983	679988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_019678	ATTT	2	8	680012	680019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_019678	AAT	2	6	680022	680027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_019678	TAAT	2	8	681038	681045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_019678	ATTTT	2	10	681070	681079	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_019678	GCT	2	6	681087	681092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_019678	TTTA	2	8	681117	681124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_019678	CAA	2	6	681180	681185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_019678	GCG	2	6	681229	681234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_019678	CGG	2	6	681238	681243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_019678	ACC	2	6	681265	681270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_019678	CTT	2	6	681299	681304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_019678	CTT	2	6	681306	681311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_019678	CTTC	2	8	681316	681323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_019678	ATT	2	6	681433	681438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_019678	TTG	2	6	683053	683058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_019678	T	7	7	683097	683103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_019678	AAT	2	6	683119	683124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_019678	AAT	2	6	683713	683718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_019678	TA	3	6	683741	683746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_019678	TATC	2	8	683771	683778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3565	NC_019678	CAA	2	6	683826	683831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_019678	TAAC	2	8	683950	683957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3568	NC_019678	AT	4	8	684084	684091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_019678	AAG	2	6	684093	684098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_019678	TGAG	2	8	684140	684147	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_019678	ATA	2	6	684174	684179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_019678	ATC	2	6	684203	684208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_019678	TAA	2	6	684215	684220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_019678	ACTT	2	8	684335	684342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_019678	AAT	2	6	684348	684353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_019678	A	6	6	684367	684372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_019678	GCATA	2	10	684396	684405	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3578	NC_019678	AGT	2	6	684470	684475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3580	NC_019678	GTA	2	6	684546	684551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3582	NC_019678	ATC	2	6	684591	684596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_019678	AT	4	8	684620	684627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_019678	TAT	2	6	684643	684648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_019678	AG	3	6	687084	687089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_019678	TGG	2	6	687113	687118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_019678	T	7	7	689135	689141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_019678	TA	3	6	689198	689203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3593	NC_019678	TTAT	2	8	689244	689251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_019678	ATGATT	2	12	689261	689272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3601	NC_019678	TAT	2	6	691964	691969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_019678	TTA	2	6	693012	693017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_019678	TACT	2	8	693041	693048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_019678	CAA	2	6	693051	693056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_019678	AAT	2	6	693073	693078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_019678	AT	3	6	693126	693131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_019678	T	6	6	693174	693179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_019678	AT	4	8	693204	693211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_019678	CGC	2	6	693236	693241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_019678	A	7	7	693349	693355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_019678	TAAA	2	8	693359	693366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_019678	GTATT	2	10	693370	693379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_019678	CATTG	2	10	693467	693476	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3614	NC_019678	AAAAT	2	10	694781	694790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_019678	TAA	2	6	696257	696262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_019678	TCTTAC	2	12	696280	696291	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_019678	TTGC	2	8	696318	696325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_019678	TAT	2	6	697355	697360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_019678	T	6	6	697372	697377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_019678	TTA	3	9	697435	697443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_019678	ACAA	2	8	697476	697483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_019678	TAA	2	6	697505	697510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_019678	TAT	2	6	697783	697788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_019678	TTAC	2	8	697829	697836	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_019678	A	6	6	700762	700767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_019678	ATT	2	6	700789	700794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_019678	AAT	2	6	700835	700840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_019678	CTT	2	6	700858	700863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_019678	CTAA	2	8	700889	700896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_019678	TATTT	2	10	700909	700918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_019678	TGT	2	6	702119	702124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_019678	ATTT	2	8	702965	702972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_019678	ATT	2	6	702981	702986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_019678	TTGT	2	8	703018	703025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_019678	T	6	6	703041	703046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_019678	AAT	2	6	703050	703055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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