MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3003	NC_019678	GAA	2	6	570817	570822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019678	T	6	6	570853	570858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019678	TGAT	2	8	570862	570869	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_019678	CTT	2	6	572023	572028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_019678	AAT	2	6	572037	572042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019678	TTGTT	2	10	572136	572145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_019678	ATT	2	6	572153	572158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_019678	TGTA	2	8	572159	572166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_019678	ATAA	2	8	572182	572189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_019678	TTGTA	2	10	572285	572294	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_019678	TGCT	2	8	572375	572382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_019678	CTT	2	6	573221	573226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_019678	CAGT	2	8	573235	573242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_019678	A	7	7	573319	573325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_019678	CTTAT	2	10	573336	573345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3018	NC_019678	TAA	2	6	573379	573384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_019678	ATC	2	6	573385	573390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_019678	GCA	2	6	573415	573420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_019678	CAA	2	6	573449	573454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_019678	AAGA	2	8	574242	574249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_019678	TAATCT	2	12	574250	574261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3024	NC_019678	AAG	2	6	574268	574273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_019678	TTCC	2	8	574282	574289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_019678	ATC	2	6	574297	574302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_019678	T	6	6	574310	574315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019678	ATCAC	2	10	575247	575256	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3029	NC_019678	T	8	8	575260	575267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_019678	AGG	2	6	575283	575288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_019678	GA	3	6	575335	575340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3033	NC_019678	TCT	2	6	575388	575393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3039	NC_019678	AT	3	6	577830	577835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_019678	ATA	2	6	579017	579022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019678	TAA	2	6	579039	579044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019678	TGA	2	6	581000	581005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_019678	TA	3	6	581030	581035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_019678	AAC	2	6	582045	582050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_019678	AC	3	6	582049	582054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_019678	CATT	2	8	582117	582124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_019678	T	7	7	582174	582180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3053	NC_019678	AATT	2	8	582492	582499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_019678	AT	3	6	582510	582515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_019678	ATAA	2	8	582552	582559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_019678	AAT	2	6	582601	582606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_019678	ATA	2	6	582751	582756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_019678	ATT	2	6	582766	582771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_019678	AG	3	6	582798	582803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3061	NC_019678	AAT	2	6	582858	582863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019678	AGT	2	6	582866	582871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3064	NC_019678	CTG	2	6	582895	582900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_019678	AT	3	6	582932	582937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_019678	ATTT	2	8	583009	583016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_019678	AAG	2	6	583034	583039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_019678	ATA	2	6	583044	583049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_019678	ATTG	2	8	583068	583075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_019678	TAA	2	6	583903	583908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_019678	ATCA	2	8	584762	584769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_019678	ATT	2	6	584774	584779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_019678	CAT	2	6	589532	589537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3089	NC_019678	TAT	2	6	592483	592488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3093	NC_019678	A	7	7	592579	592585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_019678	TAT	2	6	593071	593076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_019678	TAA	2	6	593093	593098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_019678	GGAG	2	8	593254	593261	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_019678	AT	3	6	593294	593299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3107	NC_019678	CAA	2	6	593744	593749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_019678	TA	3	6	593798	593803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_019678	AAT	2	6	593804	593809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_019678	AAG	2	6	593835	593840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_019678	TCCTT	2	10	593853	593862	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3113	NC_019678	AATT	2	8	593928	593935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_019678	TATAT	2	10	594118	594127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_019678	TTTA	2	8	594464	594471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_019678	TTA	2	6	594497	594502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_019678	TAG	2	6	594523	594528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_019678	GAGAA	2	10	594560	594569	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_019678	C	6	6	594592	594597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3123	NC_019678	C	6	6	594599	594604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3124	NC_019678	TAG	2	6	594636	594641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_019678	TATCAG	2	12	594839	594850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3129	NC_019678	T	6	6	594857	594862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_019678	CTT	2	6	594864	594869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_019678	A	6	6	594898	594903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_019678	CA	4	8	594904	594911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_019678	GCT	2	6	594914	594919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_019678	TA	3	6	594947	594952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_019678	TA	3	6	595085	595090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_019678	TTG	2	6	595099	595104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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