MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019678	AATC	2	8	1164918	1164925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_019678	TAA	2	6	1164972	1164977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_019678	GAA	2	6	1165239	1165244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_019678	TAC	2	6	1165250	1165255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_019678	CTT	2	6	1165270	1165275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_019678	AGA	2	6	1165322	1165327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_019678	TCAA	2	8	1165354	1165361	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_019678	A	6	6	1165380	1165385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_019678	TAGATT	2	12	1165497	1165508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_019678	GTTA	2	8	1165522	1165529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_019678	ACA	2	6	1165564	1165569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_019678	A	6	6	1165610	1165615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_019678	ATT	2	6	1165692	1165697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_019678	TCT	2	6	1165701	1165706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_019678	T	7	7	1167104	1167110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_019678	T	6	6	1167113	1167118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_019678	GTT	2	6	1167123	1167128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_019678	GTT	2	6	1167130	1167135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_019678	TTC	2	6	1167164	1167169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_019678	ATC	2	6	1167237	1167242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_019678	AT	3	6	1167252	1167257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_019678	T	6	6	1167294	1167299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_019678	ATT	2	6	1167338	1167343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_019678	TTTC	2	8	1167349	1167356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6025	NC_019678	ATT	2	6	1168065	1168070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_019678	TA	3	6	1168076	1168081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019678	TA	3	6	1168108	1168113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_019678	TAA	2	6	1168128	1168133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019678	ATT	2	6	1168170	1168175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019678	TAT	2	6	1168179	1168184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_019678	TATT	2	8	1168188	1168195	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_019678	A	6	6	1168198	1168203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_019678	A	7	7	1168259	1168265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_019678	TAA	2	6	1168267	1168272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_019678	TAAT	2	8	1168283	1168290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_019678	ATT	2	6	1169853	1169858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_019678	TAG	2	6	1169862	1169867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_019678	TA	4	8	1169892	1169899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_019678	AAT	2	6	1169994	1169999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_019678	CAAAA	2	10	1170023	1170032	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6041	NC_019678	ATTT	2	8	1170092	1170099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_019678	GTATTT	2	12	1170178	1170189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_019678	T	6	6	1170228	1170233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_019678	A	6	6	1170235	1170240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_019678	T	6	6	1170263	1170268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_019678	ATA	2	6	1170271	1170276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_019678	ATAAG	2	10	1170299	1170308	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_019678	AGC	2	6	1170311	1170316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_019678	A	6	6	1170800	1170805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_019678	TTGA	2	8	1170823	1170830	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_019678	AGA	2	6	1171334	1171339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_019678	TGA	3	9	1171419	1171427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_019678	AGA	2	6	1171451	1171456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_019678	ACAA	2	8	1171460	1171467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6055	NC_019678	TAA	2	6	1171472	1171477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_019678	GAAAT	2	10	1171495	1171504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_019678	AGC	2	6	1171529	1171534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_019678	ATT	2	6	1171581	1171586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_019678	TACA	2	8	1171591	1171598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_019678	GT	3	6	1171628	1171633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_019678	ATTT	2	8	1171797	1171804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_019678	CCA	2	6	1171823	1171828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_019678	TTCA	2	8	1171907	1171914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6064	NC_019678	T	7	7	1171937	1171943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_019678	TTA	2	6	1171950	1171955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6067	NC_019678	TAAT	2	8	1174553	1174560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_019678	ATT	2	6	1174567	1174572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_019678	AT	4	8	1174615	1174622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_019678	ATC	2	6	1175460	1175465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6073	NC_019678	A	7	7	1175558	1175564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_019678	AAG	2	6	1177077	1177082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6076	NC_019678	ACAATA	2	12	1177144	1177155	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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6078	NC_019678	TA	3	6	1177296	1177301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_019678	TTGT	2	8	1177740	1177747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_019678	TA	3	6	1177813	1177818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_019678	TAT	2	6	1177846	1177851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_019678	T	6	6	1177851	1177856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_019678	ATT	2	6	1179653	1179658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_019678	AGT	2	6	1179670	1179675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6086	NC_019678	TAATAT	2	12	1179697	1179708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_019678	A	7	7	1179727	1179733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6089	NC_019678	TAA	2	6	1179764	1179769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_019678	TTG	2	6	1179803	1179808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6094	NC_019678	GTA	2	6	1180757	1180762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_019678	CCCAAT	2	12	1180853	1180864	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_019678	TCA	2	6	1181371	1181376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_019678	T	6	6	1181410	1181415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_019678	AAT	2	6	1181462	1181467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_019678	TATT	2	8	1181468	1181475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_019678	CTA	2	6	1181494	1181499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6105	NC_019678	ATGA	2	8	1181552	1181559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_019678	TAC	2	6	1183782	1183787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_019678	CA	3	6	1183809	1183814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6109	NC_019678	TCA	2	6	1185223	1185228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_019678	ATA	2	6	1185268	1185273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6112	NC_019678	CTT	2	6	1186412	1186417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_019678	AAC	2	6	1186420	1186425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_019678	C	6	6	1186440	1186445	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6115	NC_019678	CT	3	6	1186472	1186477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_019678	TC	3	6	1186491	1186496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_019678	TTG	2	6	1186864	1186869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_019678	T	6	6	1186873	1186878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_019678	CAAT	2	8	1186890	1186897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_019678	AT	3	6	1186936	1186941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_019678	TTA	2	6	1186949	1186954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_019678	A	8	8	1187205	1187212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_019678	CCTT	2	8	1187292	1187299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_019678	TCTT	2	8	1187359	1187366	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_019678	TATT	2	8	1187378	1187385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_019678	GAA	2	6	1187401	1187406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_019678	GA	3	6	1187416	1187421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_019678	T	7	7	1188527	1188533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_019678	AATTT	2	10	1189233	1189242	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_019678	TTTG	2	8	1189303	1189310	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_019678	ATT	2	6	1189372	1189377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_019678	A	7	7	1189397	1189403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6134	NC_019678	CGG	2	6	1191548	1191553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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