MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 chromosome

Total Repeats: 43877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019678	ATC	2	6	980884	980889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_019678	GGTT	2	8	980974	980981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_019678	TAT	2	6	980994	980999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_019678	TGG	2	6	981085	981090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_019678	T	6	6	981138	981143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_019678	GTT	2	6	981174	981179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_019678	T	6	6	981185	981190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_019678	TC	3	6	981209	981214	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5009	NC_019678	AATTA	2	10	981226	981235	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019678	CTAT	2	8	981466	981473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_019678	A	8	8	982448	982455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019678	AG	3	6	982508	982513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_019678	GTGTG	2	10	982520	982529	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_019678	TGT	2	6	982535	982540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019678	TACT	2	8	982564	982571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5016	NC_019678	TA	3	6	982582	982587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019678	AAAT	2	8	982634	982641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_019678	GTTA	3	12	983384	983395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_019678	CAT	2	6	984950	984955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_019678	ATTA	2	8	984957	984964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019678	ATAC	2	8	985041	985048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_019678	AAAG	2	8	985053	985060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019678	A	7	7	985708	985714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019678	T	6	6	985727	985732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019678	T	6	6	985736	985741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_019678	TAAT	2	8	985750	985757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_019678	TAT	2	6	985787	985792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_019678	TA	3	6	985795	985800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_019678	AT	3	6	985816	985821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019678	TA	3	6	986546	986551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019678	AAC	2	6	986593	986598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_019678	AAT	2	6	989554	989559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019678	T	6	6	989570	989575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_019678	ATCT	2	8	989579	989586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_019678	TAT	2	6	989635	989640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_019678	TTG	2	6	989768	989773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_019678	A	7	7	989786	989792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_019678	TAA	2	6	989846	989851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_019678	TTTA	2	8	989852	989859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_019678	ATT	2	6	991182	991187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019678	AATA	2	8	991238	991245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_019678	T	8	8	991247	991254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_019678	GAT	2	6	991696	991701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019678	AGG	2	6	992244	992249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_019678	CAA	2	6	992250	992255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_019678	TGA	2	6	995293	995298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_019678	AAAT	2	8	995304	995311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_019678	GACG	2	8	995376	995383	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5049	NC_019678	TAC	2	6	1000511	1000516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_019678	CAC	2	6	1000527	1000532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_019678	GAG	2	6	1000542	1000547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_019678	AT	3	6	1000589	1000594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_019678	GATATT	2	12	1000675	1000686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_019678	AAC	2	6	1000696	1000701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_019678	TTA	2	6	1004780	1004785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_019678	TATT	2	8	1004848	1004855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_019678	CTT	2	6	1004869	1004874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_019678	T	6	6	1005064	1005069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_019678	CA	3	6	1005073	1005078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_019678	T	6	6	1005080	1005085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_019678	CAA	2	6	1005146	1005151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_019678	AT	3	6	1005159	1005164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_019678	TCT	2	6	1005172	1005177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_019678	CTA	2	6	1005218	1005223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_019678	CAGAA	2	10	1005259	1005268	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5067	NC_019678	ATC	2	6	1005309	1005314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5069	NC_019678	CTT	2	6	1005389	1005394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_019678	GAT	2	6	1005443	1005448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5072	NC_019678	CAT	2	6	1005554	1005559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_019678	GTA	2	6	1005568	1005573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5078	NC_019678	A	6	6	1005715	1005720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5081	NC_019678	TTGT	2	8	1005853	1005860	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_019678	ACA	2	6	1007324	1007329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_019678	ATA	2	6	1007353	1007358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_019678	AAG	2	6	1007421	1007426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_019678	GTT	2	6	1007430	1007435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_019678	A	6	6	1009630	1009635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_019678	AGTA	2	8	1009657	1009664	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_019678	ATA	2	6	1009747	1009752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_019678	A	6	6	1009783	1009788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_019678	TA	3	6	1010926	1010931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_019678	ATTA	2	8	1010939	1010946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019678	AATA	2	8	1010956	1010963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_019678	AGC	2	6	1010990	1010995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_019678	TAT	2	6	1011426	1011431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_019678	AT	3	6	1011434	1011439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_019678	ATTTTT	2	12	1011497	1011508	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_019678	TAT	3	9	1011532	1011540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_019678	CTTA	2	8	1011555	1011562	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_019678	T	8	8	1011604	1011611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_019678	TAG	2	6	1012835	1012840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5111	NC_019678	ATT	2	6	1012932	1012937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_019678	A	6	6	1014201	1014206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_019678	AT	3	6	1014228	1014233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_019678	T	7	7	1014296	1014302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_019678	GTT	2	6	1014361	1014366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_019678	A	6	6	1014378	1014383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_019678	A	7	7	1014389	1014395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019678	AT	3	6	1014448	1014453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_019678	TCT	2	6	1014952	1014957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_019678	TAATA	2	10	1015016	1015025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_019678	ATT	2	6	1015031	1015036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_019678	AT	3	6	1015222	1015227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_019678	TAA	3	9	1015229	1015237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_019678	ACA	2	6	1015316	1015321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_019678	GAGC	2	8	1017106	1017113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5127	NC_019678	TAT	2	6	1017118	1017123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_019678	CAAA	2	8	1017142	1017149	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_019678	A	6	6	1017147	1017152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_019678	TAA	2	6	1017171	1017176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_019678	ATT	2	6	1017244	1017249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_019678	ACA	2	6	1017263	1017268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_019678	TCA	2	6	1017374	1017379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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