MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018609	AG	3	6	119	124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018609	AT	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018609	AT	3	6	31917	31922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018609	TA	3	6	40038	40043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018609	TA	4	8	58819	58826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018609	AC	3	6	58837	58842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018609	TG	4	8	72085	72092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018609	AT	3	6	73922	73927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018609	TA	3	6	74205	74210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018609	AT	3	6	74531	74536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018609	TA	3	6	76502	76507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018609	AT	3	6	76634	76639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018609	TA	3	6	79291	79296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018609	TC	3	6	79738	79743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_018609	TA	3	6	81499	81504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018609	AT	3	6	92118	92123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018609	AC	3	6	96319	96324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018609	TA	3	6	96364	96369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018609	TA	3	6	99670	99675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018609	AT	3	6	114953	114958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018609	AC	3	6	116010	116015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018609	CA	3	6	117625	117630	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018609	GA	3	6	118734	118739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018609	AT	3	6	120203	120208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018609	TA	3	6	124768	124773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018609	AT	3	6	130962	130967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018609	CT	3	6	135177	135182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018609	TA	3	6	143344	143349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018609	CT	3	6	143710	143715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018609	TA	3	6	144704	144709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018609	AC	3	6	146406	146411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018609	AT	3	6	147127	147132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018609	AC	3	6	147164	147169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018609	TA	3	6	149938	149943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018609	CA	3	6	154068	154073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018609	CA	3	6	161713	161718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018609	AG	3	6	162464	162469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018609	TA	3	6	173962	173967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018609	CA	3	6	194357	194362	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018609	GA	3	6	206346	206351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018609	AT	3	6	208887	208892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018609	AT	3	6	217032	217037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018609	GA	3	6	217138	217143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018609	AG	3	6	217665	217670	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018609	AT	3	6	217832	217837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018609	TA	3	6	218832	218837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018609	AC	3	6	226804	226809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018609	TA	3	6	236887	236892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018609	AT	3	6	249115	249120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018609	CA	3	6	253043	253048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018609	TA	3	6	257993	257998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018609	CA	3	6	258061	258066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018609	TG	3	6	271271	271276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018609	TA	4	8	272665	272672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018609	CT	3	6	273078	273083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018609	AC	3	6	275679	275684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018609	TA	3	6	278579	278584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018609	TC	3	6	279146	279151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018609	TA	3	6	279435	279440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018609	TG	3	6	279617	279622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018609	TG	3	6	279700	279705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018609	GA	3	6	292534	292539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018609	AT	3	6	293131	293136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018609	GA	3	6	293237	293242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018609	AG	3	6	293764	293769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018609	AT	3	6	293931	293936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018609	AT	3	6	295367	295372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018609	AT	3	6	301242	301247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018609	GA	3	6	301348	301353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018609	AG	3	6	301875	301880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018609	AT	3	6	302042	302047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018609	AT	3	6	318462	318467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018609	TC	3	6	328526	328531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018609	TA	4	8	346024	346031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018609	CT	3	6	346118	346123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018609	TA	3	6	353062	353067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018609	TA	3	6	356331	356336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018609	TC	3	6	358808	358813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_018609	TC	3	6	360499	360504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018609	AT	3	6	361043	361048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018609	AT	3	6	361771	361776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_018609	GT	3	6	362942	362947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018609	CT	3	6	362995	363000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018609	CT	4	8	364445	364452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018609	AT	3	6	364570	364575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018609	AT	4	8	364590	364597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018609	TA	3	6	369312	369317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018609	TA	3	6	369392	369397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018609	TA	3	6	369413	369418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018609	AT	3	6	388095	388100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018609	AC	10	20	388275	388294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018609	GA	3	6	388734	388739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018609	CT	3	6	394016	394021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018609	TA	3	6	394062	394067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018609	CA	3	6	394080	394085	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018609	TA	3	6	396451	396456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018609	TC	3	6	397555	397560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018609	GA	3	6	397567	397572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018609	AT	4	8	423329	423336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018609	TA	3	6	423341	423346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018609	AT	4	8	425862	425869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018609	TA	3	6	436554	436559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018609	AT	3	6	437457	437462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018609	TA	3	6	451765	451770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018609	TA	3	6	457449	457454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018609	CT	3	6	467645	467650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018609	TA	4	8	468134	468141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018609	AT	3	6	468165	468170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018609	CA	3	6	470034	470039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018609	AT	3	6	470200	470205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018609	TC	3	6	504925	504930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018609	TA	3	6	505847	505852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018609	TA	3	6	516288	516293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018609	CT	3	6	517978	517983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018609	CT	3	6	518734	518739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018609	TA	3	6	521014	521019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018609	TA	3	6	532109	532114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018609	TC	3	6	533402	533407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018609	GA	3	6	533424	533429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018609	CT	3	6	533815	533820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018609	TA	3	6	538354	538359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018609	TA	3	6	542021	542026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018609	AG	4	8	548115	548122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018609	CT	3	6	548131	548136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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132	NC_018609	AC	4	8	566965	566972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018609	TA	3	6	579622	579627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018609	AT	3	6	596244	596249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018609	TA	3	6	619553	619558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018609	TA	3	6	623932	623937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018609	TA	3	6	639229	639234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018609	AC	4	8	643645	643652	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018609	CA	3	6	643684	643689	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018609	TA	3	6	650890	650895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018609	AT	3	6	651875	651880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018609	TA	3	6	652187	652192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018609	TA	3	6	652310	652315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018609	TA	3	6	652331	652336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018609	GA	3	6	652405	652410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018609	AT	3	6	657362	657367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018609	AT	3	6	657458	657463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018609	AT	3	6	665628	665633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018609	TA	3	6	666389	666394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018609	AT	3	6	679894	679899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_018609	TA	3	6	683432	683437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018609	AT	3	6	683455	683460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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