MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer RA-CH-1 chromosome

Total Repeats: 6330

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018609	ACA	2	6	2179491	2179496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_018609	ATAA	2	8	2179497	2179504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_018609	A	6	6	2179512	2179517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_018609	GCA	2	6	2179792	2179797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_018609	GGATT	2	10	2179900	2179909	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_018609	TCA	2	6	2180007	2180012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_018609	T	6	6	2180030	2180035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_018609	A	6	6	2180199	2180204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_018609	AGAA	3	12	2180224	2180235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_018609	T	7	7	2180522	2180528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_018609	T	7	7	2180530	2180536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_018609	TAT	2	6	2181254	2181259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_018609	TAT	2	6	2181900	2181905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_018609	CTAC	2	8	2181932	2181939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_018609	A	8	8	2181949	2181956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_018609	A	7	7	2182026	2182032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_018609	TAA	2	6	2182036	2182041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_018609	ATC	2	6	2182047	2182052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_018609	A	7	7	2182072	2182078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_018609	T	6	6	2185324	2185329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_018609	ATA	2	6	2185330	2185335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_018609	CT	4	8	2185364	2185371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_018609	A	6	6	2185396	2185401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_018609	TA	3	6	2185402	2185407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_018609	TAAA	2	8	2185474	2185481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_018609	TA	3	6	2187649	2187654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_018609	GTT	2	6	2187676	2187681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_018609	TTA	2	6	2192075	2192080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_018609	A	7	7	2192095	2192101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_018609	ATTT	2	8	2192107	2192114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_018609	AT	3	6	2192146	2192151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_018609	ACT	2	6	2192166	2192171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_018609	AACAA	2	10	2192198	2192207	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6034	NC_018609	TC	3	6	2192214	2192219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6035	NC_018609	TTTA	2	8	2192239	2192246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_018609	TCT	2	6	2192276	2192281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_018609	A	9	9	2192291	2192299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_018609	TCT	2	6	2192311	2192316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_018609	AG	3	6	2193269	2193274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_018609	TATT	2	8	2193284	2193291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_018609	ATTTT	2	10	2194234	2194243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_018609	ATCC	2	8	2195616	2195623	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_018609	TAT	2	6	2195625	2195630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_018609	T	7	7	2196238	2196244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_018609	AACC	2	8	2196833	2196840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6046	NC_018609	T	6	6	2196851	2196856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_018609	TTGAA	2	10	2196883	2196892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_018609	TA	3	6	2196896	2196901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_018609	TTCAA	2	10	2196921	2196930	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_018609	CGC	2	6	2196938	2196943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_018609	TTTA	2	8	2198910	2198917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_018609	T	7	7	2199720	2199726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_018609	TTA	2	6	2199733	2199738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_018609	T	6	6	2199778	2199783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_018609	T	6	6	2200980	2200985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_018609	A	6	6	2200993	2200998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_018609	A	6	6	2201871	2201876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_018609	A	7	7	2208378	2208384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_018609	TAA	2	6	2208406	2208411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_018609	T	8	8	2208424	2208431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_018609	ATA	2	6	2208464	2208469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_018609	T	7	7	2208968	2208974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_018609	AAG	2	6	2208977	2208982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_018609	T	8	8	2209002	2209009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_018609	T	6	6	2209846	2209851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_018609	TAT	2	6	2211019	2211024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_018609	A	7	7	2211089	2211095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_018609	A	8	8	2212656	2212663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_018609	T	6	6	2212680	2212685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_018609	AT	3	6	2212690	2212695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_018609	TGTA	2	8	2212697	2212704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_018609	TAT	2	6	2217295	2217300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_018609	CAG	2	6	2217301	2217306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6074	NC_018609	ATT	2	6	2217315	2217320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_018609	A	8	8	2217326	2217333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_018609	AAC	2	6	2217400	2217405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_018609	A	7	7	2217424	2217430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_018609	A	7	7	2217452	2217458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_018609	A	7	7	2219178	2219184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_018609	TTAA	2	8	2219214	2219221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_018609	T	6	6	2219635	2219640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_018609	CAT	2	6	2222149	2222154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_018609	T	6	6	2222197	2222202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_018609	TTAA	2	8	2222208	2222215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_018609	TA	3	6	2223020	2223025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_018609	A	7	7	2223029	2223035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6089	NC_018609	ATAAAA	2	12	2223965	2223976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_018609	TA	3	6	2223999	2224004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6095	NC_018609	GTA	2	6	2226838	2226843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_018609	GTA	2	6	2228293	2228298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_018609	TAT	2	6	2228339	2228344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_018609	T	7	7	2228396	2228402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_018609	TTGT	2	8	2228579	2228586	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_018609	T	6	6	2228926	2228931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_018609	AAT	2	6	2228940	2228945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_018609	T	6	6	2228950	2228955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_018609	TTTA	2	8	2229006	2229013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_018609	TAA	2	6	2229033	2229038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_018609	A	7	7	2229037	2229043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_018609	T	6	6	2229069	2229074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_018609	ACTAT	2	10	2229078	2229087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6111	NC_018609	TTA	2	6	2229103	2229108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_018609	AAGAC	2	10	2229112	2229121	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6113	NC_018609	ATA	2	6	2229181	2229186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_018609	GTA	2	6	2229195	2229200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6116	NC_018609	TGA	2	6	2230269	2230274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_018609	ATA	2	6	2230457	2230462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_018609	TTAT	2	8	2230478	2230485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_018609	A	8	8	2230516	2230523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_018609	TGT	2	6	2230548	2230553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6122	NC_018609	A	7	7	2230655	2230661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_018609	GA	4	8	2230708	2230715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6125	NC_018609	TC	3	6	2230784	2230789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_018609	AAC	2	6	2230793	2230798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6128	NC_018609	GTG	2	6	2230815	2230820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_018609	AT	3	6	2230824	2230829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_018609	AAT	2	6	2230900	2230905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_018609	TA	4	8	2231282	2231289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_018609	GAG	2	6	2231365	2231370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_018609	A	7	7	2231399	2231405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_018609	CGCTT	2	10	2231419	2231428	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6135	NC_018609	T	6	6	2231427	2231432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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